SAXSdb — 1jl2

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chimera of Ribonuclease HI, Ribonuclease H

Escherichia coli (strain K12)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	同源多聚体	蛋白 4	water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RNH_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–42； UniProt 1–42 作者链 A； PDB构建体 124–156； UniProt 123–155 作者链 B； PDB构建体 1–42； UniProt 1–42 作者链 B； PDB构建体 124–156； UniProt 123–155 作者链 C； PDB构建体 1–42； UniProt 1–42 作者链 C； PDB构建体 124–156； UniProt 123–155 作者链 D； PDB构建体 1–42； UniProt 1–42 作者链 D； PDB构建体 124–156； UniProt 123–155

Chimera of Ribonuclease HI, Ribonuclease H

Escherichia coli (strain K12)

UniProt P29253

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	同源多聚体	蛋白 4	water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RNH_THET8
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 43–123； UniProt 47–127 作者链 B； PDB构建体 43–123； UniProt 47–127 作者链 C； PDB构建体 43–123； UniProt 47–127 作者链 D； PDB构建体 43–123； UniProt 47–127

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1jl2
沉积日期 deposition_date	2001-07-13
结构标题 title	Crystal structure of TCEO RNase H-a chimera combining the folding core from T. thermophilus RNase H and the remaining region of E. coli RNase H
关键词 keywords	mixed alpha-beta protein, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1jl2__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1jl2__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1jl2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	28.50 Å
Rg（电子密度）	27.67 Å
总 Rg	28.44 Å
原子数	4424
残基数	562
排除体积	77842 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1jl2__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d1jl2a_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.55 — Ribonuclease H-like motif
超家族 Superfamily superfamily	c.55.3 — Ribonuclease H-like
家族 Family family	c.55.3.1 — Ribonuclease H

结构域编号 domain_id	d1jl2b_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.55 — Ribonuclease H-like motif
超家族 Superfamily superfamily	c.55.3 — Ribonuclease H-like
家族 Family family	c.55.3.1 — Ribonuclease H

结构域编号 domain_id	d1jl2c_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.55 — Ribonuclease H-like motif
超家族 Superfamily superfamily	c.55.3 — Ribonuclease H-like
家族 Family family	c.55.3.1 — Ribonuclease H

结构域编号 domain_id	d1jl2d_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.55 — Ribonuclease H-like motif
超家族 Superfamily superfamily	c.55.3 — Ribonuclease H-like
家族 Family family	c.55.3.1 — Ribonuclease H

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1jl2A00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H

结构域编号 domain_id	1jl2B00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H

结构域编号 domain_id	1jl2C00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H

结构域编号 domain_id	1jl2D00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H

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晶胞边长 a length_a	56.195 Å
晶胞边长 b length_b	87.033 Å
晶胞边长 c length_c	60.687 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	91.87 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.760 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2486
R_free r_free	0.2859

描述 description	Chimera of Ribonuclease HI, Ribonuclease H
分子量 formula_weight	17601.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.26.4
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	4705

Crystal structure of TCEO RNase H-a chimera combining the folding core from T. thermophilus RNase H and the remaining region of E. coli RNase H

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chimera of Ribonuclease HI, Ribonuclease H

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Chimera of Ribonuclease HI, Ribonuclease H

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1jl2__assembly_1__model_1

1jl2__assembly_1__model_1 | I(q)

1jl2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

来源生物 organism	Escherichia coli (strain K12)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	281

Crystal structure of TCEO RNase H-a chimera combining the folding core from T. thermophilus RNase H and the remaining region of E. coli RNase H

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chimera of Ribonuclease HI, Ribonuclease H

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chimera of Ribonuclease HI, Ribonuclease H

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1jl2__assembly_1__model_1

1jl2__assembly_1__model_1 | I(q)

1jl2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)