1jlz

Solution Structure of a K+-Channel Blocker from the Scorpion Toxin of Tityus cambridgei

Method: SOLUTION NMR Dmax: 30.6 Å Quality: REASONABLE

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1jlz

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1jlz
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id1jlz
沉积日期 deposition_date2001-07-17
结构标题 titleSolution Structure of a K+-Channel Blocker from the Scorpion Toxin of Tityus cambridgei
关键词 keywordsscorpion venom, alpha-KTx, K+-channel blocker, TOXIN; TOXIN
实验方法 methodSOLUTION NMR

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier7.42
回转半径 Rg (电子) rg_electron7.73
零角强度 I(0) i027183300.00
分子量 molecular_weight36916.0 kDa
排除体积 excluded_volume44119 ų
包络体积 envelope_volume7491 ų
水化壳体积 shell_volume6947 ų
包络直径 envelope_diameter28.9
壳层 Rg shell_rg14.73
包络 Rg envelope_rg9.71
形状 Rg shape_rg7.76
总 Rg total_rg8.03
总原子数 total_atoms5025
残基数 n_residues345
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax30.6
Rg (实空间) rg_real7.42
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.50
I(0) (实空间) i0_real2.7180e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.1240e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal7.42
I(0) (倒空间) i0_reciprocal27180000.0000
解质量估计 total_estimate0.6656
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary8.5
偏度 Skewness skewness0.471
峰度 Kurtosis kurtosis0.130
角度范围 angular_range— – 0.5000 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha11220.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.376; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.522; Smooth: 0.000

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (1)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1jlza_
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.3 — Knottins (small inhibitors, toxins, lectins)
超家族 Superfamily superfamilyg.3.7 — Scorpion toxin-like
家族 Family familyg.3.7.2 — Short-chain scorpion toxins

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)