1jm1

Crystal structure of the soluble domain of the Rieske protein II (soxF) from Sulfolobus acidocaldarius

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Rieske iron-sulfur protein soxF

Sulfolobus acidocaldarius

UniProt Q53766

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 MAGNESIUM ION × 1 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q53766_SULAC
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–204; UniProt 47–250

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1jm1
沉积日期 deposition_date2001-07-17
结构标题 titleCrystal structure of the soluble domain of the Rieske protein II (soxF) from Sulfolobus acidocaldarius
关键词 keywordsRieske iron-sulfur protein, electron transport, respiratory chain, oxidoreductase; electron transport, oxidoreductase
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1jm1__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1jm1__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1jm1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)16.86 Å
Rg(电子密度)15.46 Å
总 Rg16.58 Å
原子数2979
残基数202
排除体积27047 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1jm1__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1jm1a_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.33 — ISP domain
超家族 Superfamily superfamilyb.33.1 — ISP domain
家族 Family familyb.33.1.1 — Rieske iron-sulfur protein (ISP)

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1jm1A00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture102 — 3-layer Sandwich
拓扑 Topology topology10 — Rieske Iron-sulfur Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Rieske [2Fe-2S] iron-sulphur domain
▶

7. 引用文献 (3)