1jof

Neurospora crassa 3-carboxy-cis,cis-mucoante lactonizing enzyme

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CARBOXY-CIS,CIS-MUCONATE CYCLASE

Neurospora crassa

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 4	SULFATE ION × 4 BETA-MERCAPTOETHANOL × 8 ;PIPERAZINE-N,N'-BIS(2-ETHANESULFONIC ACID) ; × 1 water × 4	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 4	SULFATE ION × 4 BETA-MERCAPTOETHANOL × 8 ;PIPERAZINE-N,N'-BIS(2-ETHANESULFONIC ACID) ; × 1 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CMLE_NEUCR
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 B； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 C； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 D； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 E； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 F； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 G； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 H； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1jof
沉积日期 deposition_date	2001-07-28
结构标题 title	Neurospora crassa 3-carboxy-cis,cis-mucoante lactonizing enzyme
关键词 keywords	BETA-PROPELLER, HOMOTETRAMER, SEMET-PROTEIN, ISOMERASE; ISOMERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1jof__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1jof__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1jof__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	37.98 Å
Rg（电子密度）	37.32 Å
总 Rg	37.63 Å
原子数	11562
残基数	1420
排除体积	204910 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1jof__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1jof__assembly_2__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	CARBOXY-CIS,CIS-MUCONATE CYCLASE
分子量 formula_weight	41715.4 kDa
EC 编号 ec_number	5.5.1.5
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H
原子数 atom_count	23837

PLHHLMIGTWTPPGAIFTVQFDDEKLTCKLIKRTEIPQDEPISWMTFDHERKNIYGAAMKKWSSFAVKSPTEIVHEASHPIGGHPRANDADTNTRAIFLLAAKQPPYAVYANPFYKFAGYGNVFSVSETGKLEKNVQNYEYQENTGIHGMVFDPTETYLYSADLTANKLWTHRKLASGEVELVGSVDAPDPGDHPRWVAMHPTGNYLYALMEAGNRICEYVIDPATHMPVYTHHSFPLIPPGIPDRDPETGKGLYRADVCALTFSGKYMFASSRANKFELQGYIAGFKLRDCGSIEKQLFLSPTPTSGGHSNAVSPCPWSDEWMAITDDQEGWLEIYRWKDEFLHRVARVRIPEPGFGMNAIWYD

来源 Source

来源生物 organism	Neurospora crassa
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	5141
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	BETA-MERCAPTOETHANOL
分子量 formula_weight	78.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	16

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	;PIPERAZINE-N,N'-BIS(2-ETHANESULFONIC ACID) ;
分子量 formula_weight	302.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	713

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_id	d1jofa_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.69 — 7-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamily	b.69.10 — 3-carboxy-cis,cis-mucoante lactonizing enzyme
家族 Family family	b.69.10.1 — 3-carboxy-cis,cis-mucoante lactonizing enzyme

结构域编号 domain_id	d1jofb_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.69 — 7-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamily	b.69.10 — 3-carboxy-cis,cis-mucoante lactonizing enzyme
家族 Family family	b.69.10.1 — 3-carboxy-cis,cis-mucoante lactonizing enzyme

结构域编号 domain_id	d1jofc_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.69 — 7-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamily	b.69.10 — 3-carboxy-cis,cis-mucoante lactonizing enzyme
家族 Family family	b.69.10.1 — 3-carboxy-cis,cis-mucoante lactonizing enzyme

结构域编号 domain_id	d1jofd_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.69 — 7-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamily	b.69.10 — 3-carboxy-cis,cis-mucoante lactonizing enzyme
家族 Family family	b.69.10.1 — 3-carboxy-cis,cis-mucoante lactonizing enzyme

结构域编号 domain_id	d1jofe_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.69 — 7-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamily	b.69.10 — 3-carboxy-cis,cis-mucoante lactonizing enzyme
家族 Family family	b.69.10.1 — 3-carboxy-cis,cis-mucoante lactonizing enzyme

结构域编号 domain_id	d1joff_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.69 — 7-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamily	b.69.10 — 3-carboxy-cis,cis-mucoante lactonizing enzyme
家族 Family family	b.69.10.1 — 3-carboxy-cis,cis-mucoante lactonizing enzyme

结构域编号 domain_id	d1jofg_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.69 — 7-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamily	b.69.10 — 3-carboxy-cis,cis-mucoante lactonizing enzyme
家族 Family family	b.69.10.1 — 3-carboxy-cis,cis-mucoante lactonizing enzyme

结构域编号 domain_id	d1jofh_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.69 — 7-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamily	b.69.10 — 3-carboxy-cis,cis-mucoante lactonizing enzyme
家族 Family family	b.69.10.1 — 3-carboxy-cis,cis-mucoante lactonizing enzyme

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	1jofA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase

结构域编号 domain_id	1jofB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase

结构域编号 domain_id	1jofC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase

结构域编号 domain_id	1jofD00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase

结构域编号 domain_id	1jofE00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase

结构域编号 domain_id	1jofF00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase

结构域编号 domain_id	1jofG00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase

结构域编号 domain_id	1jofH00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase

▶

晶胞边长 a length_a	92.290 Å
晶胞边长 b length_b	160.600 Å
晶胞边长 c length_c	237.500 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	32

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.500 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2120
R_free r_free	0.2510

Neurospora crassa 3-carboxy-cis,cis-mucoante lactonizing enzyme

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CARBOXY-CIS,CIS-MUCONATE CYCLASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1jof__assembly_1__model_1

1jof__assembly_1__model_1 | I(q)

1jof__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (2)

Neurospora crassa 3-carboxy-cis,cis-mucoante lactonizing enzyme

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CARBOXY-CIS,CIS-MUCONATE CYCLASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1jof__assembly_1__model_1

1jof__assembly_1__model_1 | I(q)

1jof__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (2)