1jv2

CRYSTAL STRUCTURE OF THE EXTRACELLULAR SEGMENT OF INTEGRIN ALPHAVBETA3

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。

七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息,但缺少统一蛋白身份时,不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。

当前条目的 assembly 组成

Assembly 物理组成 蛋白状态 蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物 数据核对
1 其他组合 异源复合物 2 / 0 / 0 / 7 与蛋白数一致

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1jv2
沉积日期 deposition_date2001-08-28
结构标题 titleCRYSTAL STRUCTURE OF THE EXTRACELLULAR SEGMENT OF INTEGRIN ALPHAVBETA3
关键词 keywords;genu, hybrid domain, beta-tail domain, PSI domain, EGF domain, MIDAS, ADMIDAS, Cage motif, propeller, A-domain, thigh domain, calf domain, CELL ADHESION ;; CELL ADHESION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1jv2__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1jv2__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1jv2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)40.11 Å
Rg(电子密度)39.64 Å
总 Rg40.01 Å
原子数11656
残基数1466
排除体积206810 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1jv2__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 17 domains

SCOP 2.08 (9 domains)

结构域编号 domain_idd1jv2a1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.15 — Integrin domains
家族 Family familyb.1.15.1 — Integrin domains
结构域编号 domain_idd1jv2a2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.15 — Integrin domains
家族 Family familyb.1.15.1 — Integrin domains
结构域编号 domain_idd1jv2a3
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.15 — Integrin domains
家族 Family familyb.1.15.1 — Integrin domains
结构域编号 domain_idd1jv2a4
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.69 — 7-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamilyb.69.8 — Integrin alpha N-terminal domain
家族 Family familyb.69.8.1 — Integrin alpha N-terminal domain
结构域编号 domain_idd1jv2b1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.15 — Integrin domains
家族 Family familyb.1.15.1 — Integrin domains
结构域编号 domain_idd1jv2b2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.62 — vWA-like
超家族 Superfamily superfamilyc.62.1 — vWA-like
家族 Family familyc.62.1.1 — Integrin A (or I) domain
结构域编号 domain_idd1jv2b3
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.200 — Integrin beta tail domain
超家族 Superfamily superfamilyd.200.1 — Integrin beta tail domain
家族 Family familyd.200.1.1 — Integrin beta tail domain
结构域编号 domain_idd1jv2b4
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.3 — Knottins (small inhibitors, toxins, lectins)
超家族 Superfamily superfamilyg.3.11 — EGF/Laminin
家族 Family familyg.3.11.6 — Integrin beta EGF-like domains
结构域编号 domain_idd1jv2b5
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.3 — Knottins (small inhibitors, toxins, lectins)
超家族 Superfamily superfamilyg.3.11 — EGF/Laminin
家族 Family familyg.3.11.6 — Integrin beta EGF-like domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id1jv2A01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily130 — Integrin alpha, N-terminal
结构域编号 domain_id1jv2A02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1460 — Integrin domains. Chain A, domain 2
结构域编号 domain_id1jv2A03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1510 — ntegrin, alpha v. Chain A, domain 3
结构域编号 domain_id1jv2A04
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1530 — ntegrin, alpha v. Chain A, domain 4
结构域编号 domain_id1jv2B01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1510 — ntegrin, alpha v. Chain A, domain 3
结构域编号 domain_id1jv2B02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily410 — von Willebrand factor, type A domain
结构域编号 domain_id1jv2B03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology25 — Laminin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Laminin
结构域编号 domain_id1jv2B04
类 Class class4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture10 — Irregular
拓扑 Topology topology1240 — Hormone receptor fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 —
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7. 引用文献 (1)