SAXSdb — 1jyi

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Concanavalin-Br

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–237 链 B； UniProt 1–237	未记录	12-mer peptide × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.75 Å R-free 0.265
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–237 链 D； UniProt 1–237	未记录	12-mer peptide × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.75 Å R-free 0.265

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1JYI	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AZD CONCANAVALIN FROM CANAVALIA BRASILIENSIS 提交 1997-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–237（237 aa）链 B 1–237（237 aa）链 C 1–237（237 aa）链 D 1–237（237 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；2 MICRO-L CBR (10 MG/ML) 2 MICRO-L (11-15% PEG 6000, 0.1 M MES PH 6, pH 6.0	分辨率 3.00 Å R-free 0.240
1C57 DIRECT DETERMINATION OF THE POSITIONS OF DEUTERIUM ATOMS OF BOUND WATER IN CONCANAVALIN A BY NEUTRON LAUE CRYSTALLOGRAPHY 提交 1999-10-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–237（237 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	NEUTRON DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；CRYSTALS SELECTED FOR NEUTRON STUDY WERE TRANSFERRED TO A 1ML BUFFERMADE UP OF 99.9% D2O WITH 0.1M NANO3, 0.05M TRIS-ACETATE, 1MM MNCL2 AND 1MM CACL2; PH 6.5.	分辨率 2.40 Å R-free 0.301
1DQ0 Locked, metal-free concanavalin A, a minor species in solution 提交 1999-12-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–237（237 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；293 K；2.1 M AMMONIUM SULPHATE, 120 MM SODIUM ACETATE, SOAKING OF LOCKED MNMN CON A CRYSTALS WITH THE METAL CHELATOR EDTA, pH 7.0, temperature 293.0K	分辨率 1.70 Å R-free 0.204
1DQ1 Calcium;Calcium concanavalin A 提交 1999-12-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–237（237 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；293 K；2.1 M ammonium sulphate, 120 mM sodium acetate, 100 mM calcium, prepared by soaking of locked, metal-free concanavalin A crystals (1DQ0) with calcium, pH 7.0, temperature 293.0K	分辨率 2.15 Å R-free 0.276
1DQ2 Unlocked metal-free concanavalin A 提交 1999-12-29	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–237（237 aa）链 B 1–237（237 aa）	未记录	ACY ACETIC ACID × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；2 M ammonium sulphate, 100 mM sodium acetate, 3% (w/v) PEG4000, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.05 Å R-free 0.279
1DQ4 A transient unlocked concanavalin A structure with MN2+ bound in the transition metal ion binding site S1 and an empty calcium binding site S2 提交 1999-12-30	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–237（237 aa）链 B 1–237（237 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；277 K；2.0 M ammonium sulphate, 100 mM sodium acetate, 3% PEG4000, 7 mM MnCl2, unlocked metal-free concanavalin A crystals were soaked with Mn2+, pH 5.0, temperature 277.0K	分辨率 2.90 Å R-free 0.246
1DQ5 Manganese;Manganese concanavalin A at pH 5.0 提交 1999-12-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–237（237 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；277 K；2.0 M ammonium sulphate, 100 mM sodium acetate, 3% PEG4000, 5 mM Mn2+, crystals of unlocked, metal-free con A were soaked with Mn2+, pH 5.0, temperature 277.0K	分辨率 2.00 Å R-free 0.210
1JOJ CONCANAVALIN A-HEXAPEPTIDE COMPLEX 提交 2001-07-30	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–237（237 aa）链 B 1–237（237 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å R-free 0.231
1JOJ CONCANAVALIN A-HEXAPEPTIDE COMPLEX 提交 2001-07-30	结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 1–237（237 aa）链 D 1–237（237 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å R-free 0.231
1JUI CONCANAVALIN A-CARBOHYDRATE MIMICKING 10-MER PEPTIDE COMPLEX 提交 2001-08-24	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–237（237 aa）链 B 1–237（237 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.75 Å R-free 0.222
1JUI CONCANAVALIN A-CARBOHYDRATE MIMICKING 10-MER PEPTIDE COMPLEX 提交 2001-08-24	结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 1–237（237 aa）链 D 1–237（237 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.75 Å R-free 0.222
1JYC CONCANAVALIN A/15-mer PEPTIDE COMPLEX 提交 2001-09-12	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–237（237 aa）链 B 1–237（237 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.75 Å R-free 0.240
1JYC CONCANAVALIN A/15-mer PEPTIDE COMPLEX 提交 2001-09-12	结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 1–237（237 aa）链 D 1–237（237 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.75 Å R-free 0.240
1QDC MAN(APLHA1-6)MAN(ALPHA1-O)METHYL CONCANAVALIN A COMPLEX 提交 1998-07-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–237（237 aa）链 B 1–237（237 aa）链 C 1–237（237 aa）链 D 1–237（237 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；DROP: 5 MICROLITER 7 MG/ML CON A + 5 MICROLITER 7% JEFFAMINE M-600, 10 % PEG 8000, 50 MM NH4COOH, 5MM MGCL2, 25 MM PHOSPHATE, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.00 Å R-free 0.211
3JU9 Crystal structure of a lectin from Canavalia brasiliensis seed (ConBr) complexed with alpha-aminobutyric acid 提交 2009-09-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–237（237 aa）	未记录	DBB D-ALPHA-AMINOBUTYRIC ACID × 4 GOL GLYCEROL × 4 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CL CHLORIDE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4H55 Crystal structure of Canavalia brasiliensis seed lectin (ConBr) in complex with beta-d-ribofuranose 提交 2012-09-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–237（237 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 BDR beta-D-ribofuranose × 4 DBB D-ALPHA-AMINOBUTYRIC ACID × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.15 Å R-free 0.227
4P14 Crystal structure of Canavalia brasiliensis (ConBr) complexed with adenine 提交 2014-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–237（237 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 ADE ADENINE × 4 GOL GLYCEROL × 8 DBB D-ALPHA-AMINOBUTYRIC ACID × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 2.00 Å R-free 0.228
4PCR Crystal structure of Canavalia brasiliensis seed lectin (ConBr) complexed with Gamma-Aminobutyric Acid (GABA) 提交 2014-04-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–237（237 aa）链 D 1–237（237 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2 ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；TRIS 0.1 M pH 9.0, amonium sulfate 2.2 M	分辨率 2.15 Å R-free 0.236
4PCR Crystal structure of Canavalia brasiliensis seed lectin (ConBr) complexed with Gamma-Aminobutyric Acid (GABA) 提交 2014-04-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–237（237 aa）链 D 1–237（237 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 4 ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 6 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；TRIS 0.1 M pH 9.0, amonium sulfate 2.2 M	分辨率 2.15 Å R-free 0.236
6VB8 Crystal structure of a lectin from Canavalia brasiliensis seed (ConBr) complexed with indole-3-acetic acid 提交 2019-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–237（237 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 4 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CL CHLORIDE ION × 8 DBB D-ALPHA-AMINOBUTYRIC ACID × 4 IAC 1H-INDOL-3-YLACETIC ACID × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 8.5	分辨率 2.20 Å R-free 0.236
8YJ9 Crystallization Studies of Concanavalin A in-Complex with D-Arabinose 提交 2024-03-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–237（237 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3 ROR L-ribose × 1 CA CALCIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；Crystallization solution was comprised of sodium acetate (100 mM, pH=5), PEG6000 (5%), and Ammoniun Sulphate (2M) in hanging drop vapor diffusion setup.	分辨率 2.20 Å R-free 0.221
8YYA Crystal Structure of Concanavalin A Complexed with 5-Fluorouracil 提交 2024-04-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–237（237 aa）	未记录	URF 5-FLUOROURACIL × 1 CA CALCIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293.5 K；0. 1M Sodium Accetate buffer pH 5.0 , 5% PEG 6000, 2 M Ammonium Sulphate.	分辨率 2.96 Å R-free 0.274
8ZE7 Crystal Structure of Concanavalin A Complexed with Lysine 提交 2024-05-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–237（237 aa）	未记录	LYS LYSINE × 1 GOL GLYCEROL × 1 CA CALCIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；2M Ammonium Sulphate, 0.1M Sodium Acetate (pH 5.0), PEG600 (5%), temperature 293.0 K	分辨率 2.22 Å R-free 0.248

共 19 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CONA_CANBR
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–237； UniProt 1–237 作者链 B； PDB构建体 1–237； UniProt 1–237 作者链 C； PDB构建体 1–237； UniProt 1–237 作者链 D； PDB构建体 1–237； UniProt 1–237

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1jyi
沉积日期 deposition_date	2001-09-12
结构标题 title	CONCANAVALIN A/12-MER PEPTIDE COMPLEX
关键词 keywords	LECTIN, SUGAR BINDING PROTEIN; SUGAR BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	48.15 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	48.42 Å
零角强度 I(0) i0	171639000.00
分子量 molecular_weight	108200.0 kDa
排除体积 excluded_volume	135030 Å³
包络体积 envelope_volume	194380 Å³
水化壳体积 shell_volume	34180 Å³
包络直径 envelope_diameter	158.8 Å
壳层 Rg shell_rg	51.80 Å
包络 Rg envelope_rg	46.28 Å
形状 Rg shape_rg	48.41 Å
总 Rg total_rg	48.59 Å
总原子数 total_atoms	7636
残基数 n_residues	996
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	150.2 Å
Rg (实空间) rg_real	48.75 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.72 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.7160e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.4180e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	48.16 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	171500000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6877
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	27.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.323
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.849
角度范围 angular_range	— – 0.1650 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	7039000.0000
实空间数据点数 n_real_points	34
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.504; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.419; Smooth: 0.007

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Concanavalin-Br
分子量 formula_weight	25622.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	7925

ADTIVAVELDTYPNTDIGDPSYPHIGIDIKSVRSKKTAKWNMQNGKVGTAHIIYNSVDKRLSAVVSYPNADSATVSYDVDLDNVLPEWVRVGLSASTGLYKETNTILSWSFTSKLKSNSTHETNALHFMFNQFSKDQKDLILQGDATTGTDGNLELTRVSSNGSPQGSSVGRALFYAPVHIWESSAVVASFEATFTFLIKSPDSHPADGIAFFISNIDSSIPSGSTGRLLGLFPDAN

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	12-mer peptide
分子量 formula_weight	1365.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P,Q,R,S

DVFYPYPYASGS

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	MANGANESE (II) ION
分子量 formula_weight	54.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	289

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d1jyia_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.29 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
超家族 Superfamily superfamily	b.29.1 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
家族 Family family	b.29.1.1 — Legume lectins

结构域编号 domain_id	d1jyib_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.29 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
超家族 Superfamily superfamily	b.29.1 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
家族 Family family	b.29.1.1 — Legume lectins

结构域编号 domain_id	d1jyic_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.29 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
超家族 Superfamily superfamily	b.29.1 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
家族 Family family	b.29.1.1 — Legume lectins

结构域编号 domain_id	d1jyid_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.29 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
超家族 Superfamily superfamily	b.29.1 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
家族 Family family	b.29.1.1 — Legume lectins

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1jyiA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	200 —

结构域编号 domain_id	1jyiB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	200 —

结构域编号 domain_id	1jyiC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	200 —

结构域编号 domain_id	1jyiD00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	200 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	102.545 Å
晶胞边长 b length_b	118.323 Å
晶胞边长 c length_c	252.591 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	32

空间群 space_group	C 2 2 21
空间群编号 int_tables_number	20
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.750 Å
最低分辨率 resolution_low	10.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.1920
R_free r_free	0.2650

fit	/app/data/saxs_computation/jy/1jyi/1jyi.fit
pddf	/app/data/pr_computation/jy/1jyi/1jyi.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/jy/1jyi/1jyi.dat

CONCANAVALIN A/12-MER PEPTIDE COMPLEX

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Concanavalin-Br

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)