SAXSdb — 1kjx

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Adenylosuccinate Synthetase

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–432	未记录	IMP INOSINIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；293 K；PEG 8000, HEPES, magnesium acetate, IMP, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.283

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1KJX	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1ADE STRUCTURE OF ADENYLOSUCCINATE SYNTHETASE PH 7 AT 25 DEGREES CELSIUS 提交 1995-09-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–431（431 aa）链 B 1–431（431 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0	分辨率 2.00 Å
1ADI STRUCTURE OF ADENYLOSUCCINATE SYNTHETASE AT PH 6.5 AND 25 DEGREES CELSIUS 提交 1995-09-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–431（431 aa）链 B 1–431（431 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å
1CG0 STRUCTURE OF ADENYLOSUCCINATE SYNTHETASE FROM E. COLI COMPLEXED WITH HADACIDIN, GDP, 6-PHOSPHORYL-IMP, AND MG2+ 提交 1999-03-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–431（431 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 HDA HADACIDIN × 2 IMO 6-O-PHOSPHORYL INOSINE MONOPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；13% PEG 8000, 100MM NA-CACODYLATE(PH 6.5)	分辨率 2.50 Å R-free 0.259
1CG1 STRUCTURE OF THE MUTANT (K16Q) OF ADENYLOSUCCINATE SYNTHETASE FROM E. COLI COMPLEXED WITH HADACIDIN, GDP, 6-PHOSPHORYL-IMP, AND MG2+ 提交 1999-03-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–431（431 aa）	突变：K16Q	MG MAGNESIUM ION × 2 HDA HADACIDIN × 2 IMO 6-O-PHOSPHORYL INOSINE MONOPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；13% PEG 8000, 100MM NA-CACODYLATE(PH 6.5)	分辨率 2.50 Å R-free 0.249
1CG3 STRUCTURE OF THE MUTANT (R143L) OF ADENYLOSUCCINATE SYNTHETASE FROM E. COLI COMPLEXED WITH HADACIDIN, GDP, 6-PHOSPHORYL-IMP, AND MG2+ 提交 1999-03-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–431（431 aa）	突变：R143L	MG MAGNESIUM ION × 2 HDA HADACIDIN × 2 IMO 6-O-PHOSPHORYL INOSINE MONOPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；13% PEG 8000, 100MM NA-CACODYLATE(PH 6.5)	分辨率 2.50 Å R-free 0.232
1CG4 STRUCTURE OF THE MUTANT (R303L) OF ADENYLOSUCCINATE SYNTHETASE FROM E. COLI COMPLEXED WITH, GDP, 6-PHOSPHORYL-IMP, AND MG2+ 提交 1999-03-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–431（431 aa）	突变：R303L	MG MAGNESIUM ION × 2 IMO 6-O-PHOSPHORYL INOSINE MONOPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；13% PEG 8000, 100MM NA-CACODYLATE(PH 6.5)	分辨率 2.50 Å R-free 0.252
1CH8 STRUCTURE OF ADENYLOSUCCINATE SYNTHETASE FROM E. COLI COMPLEXED WITH A STRINGENT EFFECTOR, PPG2':3'P 提交 1999-03-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–431（431 aa）	未记录	NO3 NITRATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GPX GUANOSINE 5'-DIPHOSPHATE 2':3'-CYCLIC MONOPHOSPHATE × 1 HDA HADACIDIN × 1 IMP INOSINIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；16% PEG 8000, 100MM NA-CACODYLATE (PH 6.5)	分辨率 2.50 Å R-free 0.250
1CH8 STRUCTURE OF ADENYLOSUCCINATE SYNTHETASE FROM E. COLI COMPLEXED WITH A STRINGENT EFFECTOR, PPG2':3'P 提交 1999-03-31	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–431（431 aa）	未记录	NO3 NITRATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GPX GUANOSINE 5'-DIPHOSPHATE 2':3'-CYCLIC MONOPHOSPHATE × 2 HDA HADACIDIN × 2 IMP INOSINIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；16% PEG 8000, 100MM NA-CACODYLATE (PH 6.5)	分辨率 2.50 Å R-free 0.250
1CIB STRUCTURE OF ADENYLOSUCCINATE SYNTHETASE FROM E. COLI COMPLEXED WITH GDP, IMP, HADACIDIN, AND NO3 提交 1999-03-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–431（431 aa）	未记录	NO3 NITRATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 HDA HADACIDIN × 1 IMP INOSINIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；16% PEG 8000, 100MM NA-CACODYLATE (PH 6.5)	分辨率 2.30 Å R-free 0.240
1CIB STRUCTURE OF ADENYLOSUCCINATE SYNTHETASE FROM E. COLI COMPLEXED WITH GDP, IMP, HADACIDIN, AND NO3 提交 1999-03-31	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–431（431 aa）	未记录	NO3 NITRATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 HDA HADACIDIN × 2 IMP INOSINIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；16% PEG 8000, 100MM NA-CACODYLATE (PH 6.5)	分辨率 2.30 Å R-free 0.240
1GIM CRYSTAL STRUCTURE OF ADENYLOSUCCINATE SYNTHETASE FROM ESCHERICHIA COLI COMPLEXED WITH GDP, IMP, HADACIDIN, NO3-, AND MG2+. DATA COLLECTED AT 100K (PH 6.5) 提交 1996-06-15	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–431（431 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 NO3 NITRATE ION × 2 HDA HADACIDIN × 2 IMP INOSINIC ACID × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.273
1GIN CRYSTAL STRUCTURE OF ADENYLOSUCCINATE SYNTHETASE FROM ESCHERICHIA COLI COMPLEXED WITH GDP, IMP, HADACIDIN, NO3-, AND MG2+. DATA COLLECTED AT 298K (PH 6.5). 提交 1996-06-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–431（431 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 NO3 NITRATE ION × 2 HDA HADACIDIN × 2 IMP INOSINIC ACID × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 2.80 Å R-free 0.232
1HON STRUCTURE OF GUANINE NUCLEOTIDE (GPPCP) COMPLEX OF ADENYLOSUCCINATE SYNTHETASE FROM ESCHERICHIA COLI AT PH 6.5 AND 25 DEGREE CELSIUS 提交 1996-04-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–431（431 aa）链 B 1–431（431 aa）	未记录	GNH AMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；NATIVE P212121 CRYSTALS WERE SOAKED WITH GPPNP+MG(+2), pH 6.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.230
1HOO STRUCTURE OF GUANINE NUCLEOTIDE (GPPCP) COMPLEX OF ADENYLOSUCCINATE SYNTHETASE FROM E. COLI AT PH 6.5 AND 25 DEGREES CELSIUS 提交 1996-04-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–431（431 aa）链 B 1–431（431 aa）	未记录	GNH AMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；SOAK OF THE NATIVE P 21 21 21 CRYSTAL WITH GPPNP., pH 6.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.210
1HOP STRUCTURE OF GUANINE NUCLEOTIDE (GPPCP) COMPLEX OF ADENYLOSUCCINATE SYNTHETASE FROM ESCHERICHIA COLI AT PH 6.5 AND 25 DEGREES CELSIUS 提交 1996-04-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–431（431 aa）链 B 1–431（431 aa）	未记录	GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；NATIVE P212121 CRYSTALS WERE SOAKED WITH 5'-GUANOSYL-METHYLENE-TRIPHOSPHATE., pH 6.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.227
1JUY REFINED CRYSTAL STRUCTURE OF ADENYLOSUCCINATE SYNTHETASE FROM ESCHERICHIA COLI COMPLEXED WITH HYDANTOCIDIN 5'-PHOSPHATE GDP, HPO4(2-), MG2+, AND HADACIDIN 提交 1996-09-25	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–431（431 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 PI HYDROGENPHOSPHATE ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 H5P HYDANTOCIDIN-5'-PHOSPHATE × 2 HDA HADACIDIN × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.250
1KSZ ENTRAPMENT OF 6-THIOPHOSPHORYL-IMP IN THE ACTIVE SITE OF CRYSTALLINE ADENYLOSUCCINATE SYNTHETASE FROM ESCHERICHIA COLI, DATA COLLECTED AT 298K 提交 1997-01-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–431（431 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 HDA HADACIDIN × 2 PGS 2-DEAZO-6-THIOPHOSPHATE GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å R-free 0.250
1NHT ENTRAPMENT OF 6-THIOPHOSPHORYL-IMP IN THE ACTIVE SITE OF CRYSTALLINE ADENYLOSUCCINATE SYNTHETASE FROM ESCHERICHIA COLI DATA COLLECTED AT 100K 提交 1997-01-12	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–431（431 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 HDA HADACIDIN × 2 PGS 2-DEAZO-6-THIOPHOSPHATE GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.255
1QF4 DESIGN, SYNTHESIS, AND X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF AN ENZYME BOUND BISUBSTRATE HYBRID INHIBITOR OF ADENYLOSUCCINATE SYNTHETASE 提交 1999-04-06	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–432（431 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 RPD (C8-R)-HYDANTOCIDIN 5'-PHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0	分辨率 2.20 Å R-free 0.247
1QF5 DESIGN, SYNTHESIS, AND X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF AN ENZYME BOUND BISUBSTRATE HYBRID INHIBITOR OF ADENYLOSUCCINATE SYNTHETASE 提交 1999-04-06	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–432（431 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 RPL (C8-S)-HYDANTOCIDIN 5'-PHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 2.00 Å R-free 0.228
1SON ADENYLOSUCCINATE SYNTHETASE IN COMPLEX WITH THE NATURAL FEEDBACK INHIBITOR AMP 提交 1996-05-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–431（431 aa）	未记录	AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.6；pH 8.6	分辨率 2.55 Å
1SOO ADENYLOSUCCINATE SYNTHETASE INHIBITED BY HYDANTOCIDIN 5'-MONOPHOSPHATE 提交 1996-05-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–431（431 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 6 NA SODIUM ION × 2 H5P HYDANTOCIDIN-5'-PHOSPHATE × 2 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.7；pH 4.7	分辨率 2.60 Å
2GCQ Fully ligated E.Coli Adenylosuccinate Synthetase with GTP, 2'-deoxy-IMP and Hadacidin 提交 2006-03-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–431（431 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 DOI 9-(2-DEOXY-5-O-PHOSPHONO-BETA-D-ERYTHRO-PENTOFURANOSYL)-6-(PHOSPHONOOXY)-9H-PURINE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 HDA HADACIDIN × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.251

共 21 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PURA_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–432； UniProt 1–432

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1kjx
沉积日期 deposition_date	2001-12-05
结构标题 title	IMP Complex of E. Coli Adenylosuccinate Synthetase
关键词 keywords	LIGASE, GTP-HYDROLYSING ENZYMES, PURINE NUCLEOTIDE BIOSYNTHESIS, INDUCED FIT, IMP; LIGASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	22.92 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	22.04 Å
零角强度 I(0) i0	38356600.00
分子量 molecular_weight	47552.0 kDa
排除体积 excluded_volume	59427 Å³
包络体积 envelope_volume	68740 Å³
水化壳体积 shell_volume	25772 Å³
包络直径 envelope_diameter	77.1 Å
壳层 Rg shell_rg	29.29 Å
包络 Rg envelope_rg	22.27 Å
形状 Rg shape_rg	22.04 Å
总 Rg total_rg	22.87 Å
总原子数 total_atoms	3344
残基数 n_residues	431
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	73.9 Å
Rg (实空间) rg_real	22.85 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.46 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.8360e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.5540e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	22.87 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	38360000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6544
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	28.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.283
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.335
角度范围 angular_range	— – 0.3450 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	10770000.0000
实空间数据点数 n_real_points	66
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.862; Stabil: 0.999; Sysdev: 0.307; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Adenylosuccinate Synthetase
分子量 formula_weight	47400.8 kDa
EC 编号 ec_number	6.3.4.4
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3656

MGNNVVVLGTQWGDEGKGKIVDLLTERAKYVVRYQGGHNAGHTLVINGEKTVLHLIPSGILRENVTSIIGNGVVLSPAALMKEMKELEDRGIPVRERLLLSEACPLILDYHVALDNAREKARGAKAIGTTGRGIGPAYEDKVARRGLRVGDLFDKETFAEKLKEVMEYHNFQLVNYYKAEAVDYQKVLDDTMAVADILTSMVVDVSDLLDQARQRGDFVMFEGAQGTLLDIDHGTYPYVTSSNTTAGGVATGSGLGPRYVDYVLGILKAYSTRVGAGPFPTELFDETGEFLCKQGNEFGATTGRRRRTGWLDTVAVRRAVQLNSLSGFCLTKLDVLDGLKEVKLCVAYRMPDGREVTTTPLAADDWKGVEPIYETMPGWSESTFGVKDRSGLPQAALNYIKRIEELTGVPIDIISTGPDRTETMILRDPFDA

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	INOSINIC ACID
分子量 formula_weight	348.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	312

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d1kjxa_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.10 — Nitrogenase iron protein-like

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	1kjxA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	440 — Adenylosuccinate Synthetase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Adenylosuccinate Synthetase, subunit A, domain 1

结构域编号 domain_id	1kjxA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	300 — Adenylosuccinate Synthetase, subunit A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Adenylosuccinate Synthetase, subunit A, domain 2

结构域编号 domain_id	1kjxA03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	170 — Adenylosuccinate Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Adenylosuccinate Synthetase, subunit A, domain 3

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	80.600 Å
晶胞边长 b length_b	80.600 Å
晶胞边长 c length_c	158.650 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 32 2 1
空间群编号 int_tables_number	154
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.600 Å
最低分辨率 resolution_low	8.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.1960
R_free r_free	0.2830

fit	/app/data/saxs_computation/kj/1kjx/1kjx.fit
pddf	/app/data/pr_computation/kj/1kjx/1kjx.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/kj/1kjx/1kjx.dat

IMP Complex of E. Coli Adenylosuccinate Synthetase

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Adenylosuccinate Synthetase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction