UREASE
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 9 | UREASE × 3 （P18315） UREASE × 3 （P18314） water × 9 | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | URE3_KLEAE |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–100； UniProt 1–100 |
1kra
CRYSTAL STRUCTURE OF KLEBSIELLA AEROGENES UREASE, ITS APOENZYME AND TWO ACTIVE SITE MUTANTS
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
UREASE
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 9 | UREASE × 3 （P18316） UREASE × 3 （P18314） water × 9 | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | URE2_KLEAE |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 1–106； UniProt 1–106 |
UREASE
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 9 | UREASE × 3 （P18316） UREASE × 3 （P18315） water × 9 | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | URE1_KLEAE |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 3 |
| 链与序列区间 | 作者链 C； PDB构建体 1–567； UniProt 1–567 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 1kra |
| 沉积日期 deposition_date | 1995-06-20 |
| 结构标题 title | CRYSTAL STRUCTURE OF KLEBSIELLA AEROGENES UREASE, ITS APOENZYME AND TWO ACTIVE SITE MUTANTS |
| 关键词 keywords | APOENZYME, NICKEL METALLOENZYME, HYDROLASE (UREA AMIDO); HYDROLASE (UREA AMIDO) |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
1kra__assembly_1__model_1
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
1kra__assembly_1__model_1 | I(q)
1kra__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 38.76 Å |
| Rg（电子密度） | 37.85 Å |
| 总 Rg | 38.18 Å |
| 原子数 | 17352 |
| 残基数 | 2301 |
| 排除体积 | 308080 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains
SCOP 2.08 (4 domains)
| 结构域编号 domain_id | d1kraa_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.8 — Urease, gamma-subunit |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.8.1 — Urease, gamma-subunit |
| 家族 Family family | d.8.1.1 — Urease, gamma-subunit |
| 结构域编号 domain_id | d1krab_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.85 — beta-clip |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.85.3 — Urease, beta-subunit |
| 家族 Family family | b.85.3.1 — Urease, beta-subunit |
| 结构域编号 domain_id | d1krac1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.92 — Composite domain of metallo-dependent hydrolases |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.92.1 — Composite domain of metallo-dependent hydrolases |
| 家族 Family family | b.92.1.1 — alpha-Subunit of urease |
| 结构域编号 domain_id | d1krac2 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.1 — TIM beta/alpha-barrel |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.1.9 — Metallo-dependent hydrolases |
| 家族 Family family | c.1.9.2 — alpha-subunit of urease, catalytic domain |
CATH v4.4 (4 domains)
| 结构域编号 domain_id | 1kraA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 280 — Urease; subunit A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Urease, gamma-like subunit |
| 结构域编号 domain_id | 1kraB00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Ribbon |
| 拓扑 Topology topology | 150 — Urease, subunit B |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Urease, beta subunit |
| 结构域编号 domain_id | 1kraC01 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Urease, subunit C; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Urease, subunit C, domain 1 |
| 结构域编号 domain_id | 1kraC02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Alpha-Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 20 — TIM Barrel |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 140 — Metal-dependent hydrolases |