1krl

Crystal Structure of Racemic DL-monellin in P-1

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MONELLIN, CHAIN A

物种未注明

UniProt P02881

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 MONELLIN, CHAIN B × 1 (P02882) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 MONELLIN, CHAIN B × 1 (P02882) water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MONA_DIOCU
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–44; UniProt 2–45 作者链 C; PDB构建体 1–44; UniProt 2–45

MONELLIN, CHAIN B

Dioscoreophyllum cumminsii

UniProt P02882

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 MONELLIN, CHAIN A × 1 (P02881) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 MONELLIN, CHAIN A × 1 (P02881) water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MONB_DIOCU
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–50; UniProt 1–50 作者链 D; PDB构建体 1–50; UniProt 1–50

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1krl
沉积日期 deposition_date2002-01-10
结构标题 titleCrystal Structure of Racemic DL-monellin in P-1
关键词 keywordsalpha-beta, PLANT PROTEIN; PLANT PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1krl__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1krl__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1krl__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)14.42 Å
Rg(电子密度)13.25 Å
总 Rg14.54 Å
原子数766
残基数92
排除体积13729 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1krl__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1krl__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1krl.1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.17 — Cystatin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.17.1 — Cystatin/monellin
家族 Family familyd.17.1.1 — Monellin
结构域编号 domain_idd1krl.2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.17 — Cystatin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.17.1 — Cystatin/monellin
家族 Family familyd.17.1.1 — Monellin

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1krlA00
类 Class class6 — Special
架构 Architecture architecture20 — Other non-globular
拓扑 Topology topology50 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily130
结构域编号 domain_id1krlB00
类 Class class6 — Special
架构 Architecture architecture10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily2000
结构域编号 domain_id1krlC00
类 Class class6 — Special
架构 Architecture architecture20 — Other non-globular
拓扑 Topology topology50 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily130
结构域编号 domain_id1krlD00
类 Class class6 — Special
架构 Architecture architecture10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily2000

7. 引用文献 (1)