1lna

A STRUCTURAL ANALYSIS OF METAL SUBSTITUTIONS IN THERMOLYSIN

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 68.1 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1lna

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1lna
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id1lna
沉积日期 deposition_date1994-05-13
结构标题 titleA STRUCTURAL ANALYSIS OF METAL SUBSTITUTIONS IN THERMOLYSIN
关键词 keywordsMETALLOPROTEASE; METALLOPROTEASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier20.49
回转半径 Rg (电子) rg_electron19.60
零角强度 I(0) i022107900.00
分子量 molecular_weight34885.0 kDa
排除体积 excluded_volume43074 ų
包络体积 envelope_volume47900 ų
水化壳体积 shell_volume20569 ų
包络直径 envelope_diameter68.2
壳层 Rg shell_rg25.99
包络 Rg envelope_rg19.86
形状 Rg shape_rg19.58
总 Rg total_rg20.48
总原子数 total_atoms2458
残基数 n_residues316
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax68.1
Rg (实空间) rg_real20.46
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.44
I(0) (实空间) i0_real2.2110e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.7320e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal20.46
I(0) (倒空间) i0_reciprocal22110000.0000
解质量估计 total_estimate0.8744
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary24.3
偏度 Skewness skewness0.354
峰度 Kurtosis kurtosis-0.240
角度范围 angular_range— – 0.3900 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha4665000.0000
实空间数据点数 n_real_points71
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.805; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.950

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (7)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1lnae_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.92 — Zincin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.92.1 — Metalloproteases ('zincins'), catalytic domain
家族 Family familyd.92.1.2 — Thermolysin-like

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id1lnaE01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology170 — Elastase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id1lnaE02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology390 — Neutral Protease; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Neutral Protease Domain 2

7. 引用文献 (18)

8. 文件与曲线 (10)