1m1g

Crystal Structure of Aquifex aeolicus N-utilization substance G (NusG), Space Group P2(1)

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription antitermination protein nusG

Aquifex aeolicus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白单体	单体	蛋白 1	water × 1	与蛋白数一致
3	蛋白单体	单体	蛋白 1	water × 1	与蛋白数一致
4	蛋白单体	单体	蛋白 1	water × 1	与蛋白数一致
5	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致
6	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NUSG_AQUAE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–248； UniProt 1–248 作者链 B； PDB构建体 1–248； UniProt 1–248 作者链 C； PDB构建体 1–248； UniProt 1–248 作者链 D； PDB构建体 1–248； UniProt 1–248

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1m1g
沉积日期 deposition_date	2002-06-19
结构标题 title	Crystal Structure of Aquifex aeolicus N-utilization substance G (NusG), Space Group P2(1)
关键词 keywords	;Transcription termination, Antitermination, KOW domain, RNP motif, Immunoglobulin fold, Nucleic acid interaction, protein-protein interaction, TRANSCRIPTION ;; TRANSCRIPTION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1m1g__assembly_4__model_1

Assembly 4 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1m1g__assembly_4__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1m1g__assembly_4__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	25.17 Å
Rg（电子密度）	24.58 Å
总 Rg	25.26 Å
原子数	1891
残基数	239
排除体积	34291 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1m1g__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1m1g__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`1m1g__assembly_3__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`1m1g__assembly_4__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`1m1g__assembly_5__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
6	1	`1m1g__assembly_6__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

结构域编号 domain_id	d1m1ga1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.114 — N-utilization substance G protein NusG, insert domain
超家族 Superfamily superfamily	b.114.1 — N-utilization substance G protein NusG, insert domain
家族 Family family	b.114.1.1 — N-utilization substance G protein NusG, insert domain

结构域编号 domain_id	d1m1ga2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.34 — SH3-like barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.34.5 — Translation proteins SH3-like domain
家族 Family family	b.34.5.4 — N-utilization substance G protein NusG, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1m1ga3
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.42 — N-utilization substance G protein NusG, N-terminal domain
家族 Family family	d.58.42.1 — N-utilization substance G protein NusG, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1m1gb1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.114 — N-utilization substance G protein NusG, insert domain
超家族 Superfamily superfamily	b.114.1 — N-utilization substance G protein NusG, insert domain
家族 Family family	b.114.1.1 — N-utilization substance G protein NusG, insert domain

结构域编号 domain_id	d1m1gb2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.34 — SH3-like barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.34.5 — Translation proteins SH3-like domain
家族 Family family	b.34.5.4 — N-utilization substance G protein NusG, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1m1gb3
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.42 — N-utilization substance G protein NusG, N-terminal domain
家族 Family family	d.58.42.1 — N-utilization substance G protein NusG, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1m1gc1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.114 — N-utilization substance G protein NusG, insert domain
超家族 Superfamily superfamily	b.114.1 — N-utilization substance G protein NusG, insert domain
家族 Family family	b.114.1.1 — N-utilization substance G protein NusG, insert domain

结构域编号 domain_id	d1m1gc2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.34 — SH3-like barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.34.5 — Translation proteins SH3-like domain
家族 Family family	b.34.5.4 — N-utilization substance G protein NusG, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1m1gc3
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.42 — N-utilization substance G protein NusG, N-terminal domain
家族 Family family	d.58.42.1 — N-utilization substance G protein NusG, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1m1gd1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.114 — N-utilization substance G protein NusG, insert domain
超家族 Superfamily superfamily	b.114.1 — N-utilization substance G protein NusG, insert domain
家族 Family family	b.114.1.1 — N-utilization substance G protein NusG, insert domain

结构域编号 domain_id	d1m1gd2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.34 — SH3-like barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.34.5 — Translation proteins SH3-like domain
家族 Family family	b.34.5.4 — N-utilization substance G protein NusG, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1m1gd3
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.42 — N-utilization substance G protein NusG, N-terminal domain
家族 Family family	d.58.42.1 — N-utilization substance G protein NusG, N-terminal domain

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	1m1gA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	940 — NusG, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	1m1gA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	320 — mini-chromosome maintenance (MCM) complex, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — N-utilization substance G protein NusG, insert domain

结构域编号 domain_id	1m1gA03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	1m1gB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	940 — NusG, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	1m1gB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	320 — mini-chromosome maintenance (MCM) complex, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — N-utilization substance G protein NusG, insert domain

结构域编号 domain_id	1m1gB03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	1m1gC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	940 — NusG, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	1m1gC02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	320 — mini-chromosome maintenance (MCM) complex, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — N-utilization substance G protein NusG, insert domain

结构域编号 domain_id	1m1gC03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	1m1gD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	940 — NusG, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	1m1gD02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	320 — mini-chromosome maintenance (MCM) complex, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — N-utilization substance G protein NusG, insert domain

结构域编号 domain_id	1m1gD03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

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晶胞边长 a length_a	87.500 Å
晶胞边长 b length_b	54.400 Å
晶胞边长 c length_c	113.200 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	89.30 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.000 Å
最低分辨率 resolution_low	30.000 Å
R 因子 r_factor	0.2510
R_work r_work	0.2510
R_free r_free	0.2740

描述 description	Transcription antitermination protein nusG
分子量 formula_weight	28041.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	8718

Crystal Structure of Aquifex aeolicus N-utilization substance G (NusG), Space Group P2(1)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription antitermination protein nusG

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1m1g__assembly_4__model_1

1m1g__assembly_4__model_1 | I(q)

1m1g__assembly_4__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (1)

来源生物 organism	Aquifex aeolicus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	63363
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1078

Crystal Structure of Aquifex aeolicus N-utilization substance G (NusG), Space Group P2(1)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription antitermination protein nusG

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1m1g__assembly_4__model_1

1m1g__assembly_4__model_1 | I(q)

1m1g__assembly_4__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (1)