1m9a

Crystal structure of the 26 kDa glutathione S-transferase from Schistosoma japonicum complexed with S-hexylglutathione

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 58.1 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glutathione S-Transferase 26 kDa

Schistosoma japonicum

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–218	未记录	GTX S-HEXYLGLUTATHIONE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；ammonium sulfate,ethanol, dithiothrietol, threalose, sodium acetate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.224

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1M9A	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1B8X GLUTATHIONE S-TRANSFERASE FUSED WITH THE NUCLEAR MATRIX TARGETING SIGNAL OF THE TRANSCRIPTION FACTOR AML-1 提交 1999-02-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–280（280 aa）片段：NMTS FRAGMENT	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.310
1B8X GLUTATHIONE S-TRANSFERASE FUSED WITH THE NUCLEAR MATRIX TARGETING SIGNAL OF THE TRANSCRIPTION FACTOR AML-1 提交 1999-02-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–280（280 aa）片段：NMTS FRAGMENT	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.310
1BG5 CRYSTAL STRUCTURE OF THE ANKYRIN BINDING DOMAIN OF ALPHA-NA,K-ATPASE AS A FUSION PROTEIN WITH GLUTATHIONE S-TRANSFERASE 提交 1998-06-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）片段：RESIDUES 1-218 FROM GLUTATHIONE S-TRANSFERASE, RESIDUES 219-254 FROM MINIMAL ALPHA-NA,K-ATPASE ANKYRIN BINDING DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.8；pH 8.8	分辨率 2.60 Å R-free 0.359
1DUG STRUCTURE OF THE FIBRINOGEN G CHAIN INTEGRIN BINDING AND FACTOR XIIIA CROSSLINKING SITES OBTAINED THROUGH CARRIER PROTEIN DRIVEN CRYSTALLIZATION 提交 2000-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–218（217 aa）链 B 2–218（217 aa）	未记录	GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；277 K；PEG 3350, sodium acetate, sodium chloride, ammonium sulfate, Tris, reduced glutathione, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.80 Å R-free 0.226
1GNE THE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF GLUTATHIONE S-TRANSFERASE OF SCHISTOSOMA JAPONICUM FUSED WITH A CONSERVED NEUTRALIZING EPITOPE ON GP41 OF HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 提交 1994-06-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–218（217 aa）	未记录	GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å
1GTA CRYSTAL STRUCTURES OF A SCHISTOSOMAL DRUG AND VACCINE TARGET: GLUTATHIONE S-TRANSFERASE FROM SCHISTOSOMA JAPONICA AND ITS COMPLEX WITH THE LEADING ANTISCHISTOSOMAL DRUG PRAZIQUANTEL 提交 1994-12-01	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.40 Å
1GTB CRYSTAL STRUCTURES OF A SCHISTOSOMAL DRUG AND VACCINE TARGET: GLUTATHIONE S-TRANSFERASE FROM SCHISTOSOMA JAPONICA AND ITS COMPLEX WITH THE LEADING ANTISCHISTOSOMAL DRUG PRAZIQUANTEL 提交 1994-12-01	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	PZQ PRAZIQUANTEL × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.60 Å
1M99 Crystal structure of the 26 kDa glutathione S-transferase from Schistosoma japonicum complexed with glutathione sulfonic acid 提交 2002-07-28	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	GTS GLUTATHIONE SULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；ammonium sulfate, ethanol, dithiothrietol, threalose, sodium acetate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.261
1M9B Crystal structure of the 26 kDa glutathione S-transferase from Schistosoma japonicum complexed with gamma-glutamyl[S-(2-iodobenzyl)cysteinyl]glycine 提交 2002-07-28	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	IBG GAMMA-GLUTAMYL[S-(2-IODOBENZYL)CYSTEINYL]GLYCINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；ammonium sulfate, ethanol, dithiothrietol, threalose, sodium acetate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.60 Å R-free 0.275
1U87 Crystal Structure Of The 26 Kda Glutathione S-Transferase Y7F mutant From Schistosoma Japonicum Complexed With Glutathione 提交 2004-08-05	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	突变：Y7F	GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；297 K；0.2M sodium citrate, 2M ammonium sulphate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K	分辨率 3.50 Å R-free 0.271
1U88 Crystal Structure Of The 26 Kda Glutathione S-Transferase Y7F mutant From Schistosoma Japonicum Complexed With S-Octyl Glutathione 提交 2004-08-05	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）链 B 1–218（218 aa）	突变：Y7F 突变：Y7F	GTY L-GAMMA-GLUTAMYL-S-OCTYL-D-CYSTEINYLGLYCINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；297 K；0.2M sodium citrate, 2M ammonium sulphate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K	分辨率 3.50 Å R-free 0.317
1UA5 Non-fusion GST from S. japonicum in complex with glutathione 提交 2003-02-28	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；ammonium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.50 Å R-free 0.221
1Y6E Orthorhombic glutathione S-transferase of Schistosoma japonicum 提交 2004-12-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–217（217 aa）链 B 1–217（217 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Modified Microbatch；pH 5.5；294 K；25% (w/v) PEG 3350, 0.1M Bis-Tris pH 5.5, Modified Microbatch, temperature 294K X-ray结晶条件 Modified Microbatch；pH 5.5；294 K；36% (w/v) PEG MME 5000, 0.1M sodium acetate pH 5.5, Modified Microbatch, temperature 294K	分辨率 3.00 Å R-free 0.279
3CRT Structural characterization of an engineered allosteric protein 提交 2008-04-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–214（214 aa）	突变：L50C	GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG8000, 50mM tris, 5mM B-mercaptoethanol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.90 Å R-free 0.257
3CRU Structural characterization of an engineered allosteric protein 提交 2008-04-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–214（214 aa）	突变：L50C	GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；298 K；20% PEG8000, 50 mM Tris-HCL, 3 mM B-ME., pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.291
3D0Z Structural charcaterization of an engineered allosteric protein 提交 2008-05-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–214（214 aa）	突变：L50H	GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG8000, 50mM TRIS, 5mM B-mercaptoethanol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.311
3QMZ Crystal structure of the cytoplasmic dynein heavy chain motor domain 提交 2011-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 T 2–218（217 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；277 K；16% PEG3350, 0.1 M sodium citrate, 0.2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K, pH 5.7	分辨率 6.00 Å R-free 0.430
3QMZ Crystal structure of the cytoplasmic dynein heavy chain motor domain 提交 2011-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 S 2–218（217 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；277 K；16% PEG3350, 0.1 M sodium citrate, 0.2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K, pH 5.7	分辨率 6.00 Å R-free 0.430
4AI6 Dynein Motor Domain - ADP complex 提交 2012-02-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–218（217 aa）片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092 链 B 2–218（217 aa）片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.40 Å R-free 0.303
4AKG Dynein Motor Domain - ATP complex 提交 2012-02-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–218（217 aa）片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092 链 B 2–218（217 aa）片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.30 Å R-free 0.305
4AKH Dynein Motor Domain - AMPPNP complex 提交 2012-02-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–218（217 aa）片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.60 Å R-free 0.302
4AKH Dynein Motor Domain - AMPPNP complex 提交 2012-02-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–218（217 aa）片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.60 Å R-free 0.302
4AKI Dynein Motor Domain - LuAc derivative 提交 2012-02-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–218（217 aa）片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092 链 B 2–218（217 aa）片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SO4 SULFATE ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.70 Å R-free 0.289
4ECB Chimeric GST Containing Inserts of Kininogen Peptides 提交 2012-03-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–49（49 aa）片段：unp residues 1-49, kinonogen 498-507, 50-228 链 A 50–218（169 aa）片段：unp residues 1-49, kinonogen 498-507, 50-228 链 B 1–49（49 aa）片段：unp residues 1-49, kinonogen 498-507, 50-228 链 B 50–218（169 aa）片段：unp residues 1-49, kinonogen 498-507, 50-228	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM HEPES, 200 mM KCl, 35% Pentaerythritol propoxylate, 0.1 M ATP solution, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.20 Å R-free 0.248
4ECC Chimeric GST Containing Inserts of Kininogen Peptides 提交 2012-03-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–49（49 aa）片段：unp residues 1-49, kinonogen 498-510, 50-228 链 A 50–215（166 aa）片段：unp residues 1-49, kinonogen 498-510, 50-228	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；(1)0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Hepes, 25% PEG 3350 (2)0.2 M Lithium Sulfate, 25% PEG 3350, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.20 Å R-free 0.269
4WR4 Crystal Structure of GST Mutated with Halogenated Tyrosine (7bGST-1) 提交 2014-10-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–218（217 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GSH Glutathione × 2 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M TRI-SODIUM CITRATE, 1.3M AMMONIUM SULFATE, 0.2M LITHIUM SULFATE	分辨率 1.60 Å R-free 0.222
4WR5 Crystal Structure of GST Mutated with Halogenated Tyrosine (7cGST-1) 提交 2014-10-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–218（217 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GSH Glutathione × 2 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；2.0M AMMONIUM SULFATE, 0.1M MES PH 7.0	分辨率 1.93 Å R-free 0.233
5GZZ Crystal Structure of FIN219-SjGST complex with JA 提交 2016-10-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–218（218 aa）链 C 1–218（218 aa）	未记录	JAA {(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetic acid × 1 GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；297 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris-HCl, 40%(w/v) PEG 4000	分辨率 2.39 Å R-free 0.234
5GZZ Crystal Structure of FIN219-SjGST complex with JA 提交 2016-10-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–218（218 aa）链 E 1–218（218 aa）	未记录	GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；297 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris-HCl, 40%(w/v) PEG 4000	分辨率 2.39 Å R-free 0.234
5GZZ Crystal Structure of FIN219-SjGST complex with JA 提交 2016-10-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–218（218 aa）链 G 1–218（218 aa）	未记录	GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；297 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris-HCl, 40%(w/v) PEG 4000	分辨率 2.39 Å R-free 0.234
6JI6 Crystal structure of glutathione S-transferase complexed and modified with glutathione 提交 2019-02-20	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	GSH Glutathione × 8 ACT ACETATE ION × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-Tris, 0.4M Ammonium acetate, 26% w/v PEG 3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.224
6N8U DRAFT model of Schistosoma japonicum Glutathione S-transferase expression tag 提交 2018-11-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）链 B 1–218（218 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG3350, 0.1M sodium acetate	分辨率 1.96 Å R-free 0.256
6RWD Crystal structure of SjGST in complex with GSH and ellagic acid at 1.53 Angstrom resolution 提交 2019-06-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）链 B 1–218（218 aa）	未记录	GSH Glutathione × 2 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 REF 2,3,7,8-tetrahydroxychromeno[5,4,3-cde]chromene-5,10-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；8.5 mg/ml SjGST in 10 mM Tris HCl, pH 7.0 was crystallised in 0.2M sodium chloride, 0.1 M BIS-TRIS, pH 5.5, 25% (w/v) PEG 3350.	分辨率 1.53 Å R-free 0.216
7AL7 The Crystal Structure of Human IL-18 in Complex With Human IL-18 Binding Protein 提交 2020-10-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–218（217 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；0.2 M Calcium acetate hydrate, 0.1 M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5, 18% w/v Polyethylene glycol 8000	分辨率 1.80 Å R-free 0.232
7ESG Crystal structure of Haloarcula marismortui CheB with Glutathione S-transferase expression tag 提交 2021-05-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；20% PEG 3350, 200 mM Potassium citrate tribasic monohydrate, pH 8.3	分辨率 2.53 Å R-free 0.372
7NT8 Influenza virus H3N2 nucleoprotein - R416A mutant 提交 2021-03-09	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% w/v PEG 8000, 20% v/v ethylene glycol, 0.02 M of each alcohol (1,6-hexanediol, 0.2 M 1-butanol, 0.2 M (RS)-1,2- propanediol, 0.2 M 2-propanol, 0.2 M 1,4-butanediol, 0.2 M 1,3-propanediol), 0.1 M MES/imidazole pH 6.5.	分辨率 2.22 Å R-free 0.265
7NT8 Influenza virus H3N2 nucleoprotein - R416A mutant 提交 2021-03-09	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% w/v PEG 8000, 20% v/v ethylene glycol, 0.02 M of each alcohol (1,6-hexanediol, 0.2 M 1-butanol, 0.2 M (RS)-1,2- propanediol, 0.2 M 2-propanol, 0.2 M 1,4-butanediol, 0.2 M 1,3-propanediol), 0.1 M MES/imidazole pH 6.5.	分辨率 2.22 Å R-free 0.265
7XQK The Crystal Structure of CDK3 and CyclinE1 Complex from Biortus. 提交 2022-05-07	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 11 GOL GLYCEROL × 3 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.6M MgSO4, 0.1M MES pH6.5	分辨率 2.25 Å R-free 0.202
8DHB Active FLCN GAP complex 提交 2022-06-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 H 2–218（217 aa）	未记录	CZC [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,6-bis(oxidanylidene)-3~{H}-purin-9-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.53 Å
8GYD Structure of Schistosoma japonicum Glutathione S-transferase bound with the ligand complex of 16 提交 2022-09-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）链 B 1–218（218 aa）	未记录	0IH (2R)-2-[[2-(5-chloranylthiophen-2-yl)-4-oxidanylidene-6-[2-(1H-1,2,3,4-tetrazol-5-yl)phenyl]quinazolin-3-yl]methyl]-3-(4-chlorophenyl)propanoic acid × 3 EOH ETHANOL × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；49% Saturated ammonium sulfate, 0.3 M Sodium acetate, pH 5.6, 2% ethanol, 10 mM DTT	分辨率 1.70 Å R-free 0.215
8H4R The Crystal Structure of CDK3 and CyclinE1 Complex with Dinaciclib from Biortus 提交 2022-10-11	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	1QK 3-[({3-ethyl-5-[(2S)-2-(2-hydroxyethyl)piperidin-1-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-yl}amino)methyl]-1-hydroxypyridinium × 1 SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.6M MgSO4, 0.1M MES pH 6.60	分辨率 2.75 Å R-free 0.223
8JHU Legionella effector protein SidI 提交 2023-05-25	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8OK1 WD repeat containing protein 5 (WDR5)- N225A mutant 提交 2023-03-26	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate, 24% PEG3350	分辨率 1.38 Å R-free 0.218
8OKF WD repeat containing protein 5 (WDR5)- PER2 peptide 提交 2023-03-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	144 TRIS-HYDROXYMETHYL-METHYL-AMMONIUM × 2 CL CHLORIDE ION × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；0.1 M Tris pH 8.0, 50 mM sodium chloride, 13% PEG8000	分辨率 1.85 Å R-free 0.201
8RDY Saccharomyces cerevisiae Prp43 helicase in complex with Pxr1 提交 2023-12-08	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–218（218 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.33 Å
8SEN Cryo-EM Structure of RyR1 提交 2023-04-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 1–218（218 aa）链 F 1–218（218 aa）链 G 1–218（218 aa）链 H 1–218（218 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.49 Å
8SEO Cryo-EM Structure of RyR1 + ATP-gamma-S 提交 2023-04-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 1–218（218 aa）链 F 1–218（218 aa）链 G 1–218（218 aa）链 H 1–218（218 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.92 Å
8SEP Cryo-EM Structure of RyR1 + ADP 提交 2023-04-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 1–218（218 aa）链 F 1–218（218 aa）链 G 1–218（218 aa）链 H 1–218（218 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.57 Å
8SEQ Cryo-EM Structure of RyR1 + AMP 提交 2023-04-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 1–218（218 aa）链 F 1–218（218 aa）链 G 1–218（218 aa）链 H 1–218（218 aa）	未记录	AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8SER Cryo-EM Structure of RyR1 + Adenosine 提交 2023-04-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 1–218（218 aa）链 F 1–218（218 aa）链 G 1–218（218 aa）链 H 1–218（218 aa）	未记录	ADN ADENOSINE × 4 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.42 Å
8SES Cryo-EM Structure of RyR1 + Adenine 提交 2023-04-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 1–218（218 aa）链 F 1–218（218 aa）链 G 1–218（218 aa）链 H 1–218（218 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 ADE ADENINE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.98 Å
8SET Cryo-EM Structure of RyR1 + cAMP 提交 2023-04-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 1–218（218 aa）链 F 1–218（218 aa）链 G 1–218（218 aa）链 H 1–218（218 aa）	未记录	CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.42 Å
9AXA CryoEM structure of activated CRAF/MEK/14-3-3 complex with NST-628 提交 2024-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–218（218 aa）链 C 1–218（218 aa）	突变：Y340D Y341D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：Y340D Y341D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	A1AHE N-[3-fluoro-4-({7-[(3-fluoropyridin-2-yl)oxy]-4-methyl-2-oxo-2H-1-benzopyran-3-yl}methyl)pyridin-2-yl]-N'-methylsulfuric diamide × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.36 Å
9AXC Activated CRAF/MEK heterotetramer from focused refinement of CRAF/MEK/14-3-3 complex 提交 2024-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–218（218 aa）链 C 1–218（218 aa）	突变：Y340D Y341D 突变：Y340D Y341D	A1AHE N-[3-fluoro-4-({7-[(3-fluoropyridin-2-yl)oxy]-4-methyl-2-oxo-2H-1-benzopyran-3-yl}methyl)pyridin-2-yl]-N'-methylsulfuric diamide × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric	链 DA 1–218（218 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric	链 DA 1–218（218 aa）	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.78 Å
9JPR Local refinement of H11 nanotubes assembled from baculovirus capsid protein 提交 2024-09-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–218（218 aa）链 B 1–218（218 aa）链 C 1–218（218 aa）链 D 1–218（218 aa）链 E 1–218（218 aa）链 F 1–218（218 aa）链 G 1–218（218 aa）链 H 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9JPS Local refinement of H12 nanotubes assembled from baculovirus capsid protein 提交 2024-09-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–218（218 aa）链 B 1–218（218 aa）链 C 1–218（218 aa）链 D 1–218（218 aa）链 E 1–218（218 aa）链 F 1–218（218 aa）链 G 1–218（218 aa）链 H 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9K2O Local refinement of A7 nanotubes assembled from baculovirus capsid protein 提交 2024-10-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–218（218 aa）链 B 1–218（218 aa）链 C 1–218（218 aa）链 D 1–218（218 aa）链 E 1–218（218 aa）链 F 1–218（218 aa）链 G 1–218（218 aa）链 H 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9N48 Crystal structure of PAK1 bound to compound C1 提交 2025-02-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–218（217 aa）链 B 2–218（217 aa）	未记录	A1BV1 (6M)-8-[2-(2-aminoethoxy)ethyl]-6-[2-chloro-3-fluoro-4-(2-oxopyrrolidin-1-yl)phenyl]-2-(ethylamino)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Lithium Sulfate, 0.1 M Tris pH8.5, 30% PEG4000	分辨率 1.85 Å R-free 0.216
9N4U Crystal structure of PAK1 bound to compound R1 提交 2025-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–218（217 aa）链 B 2–218（217 aa）	未记录	A1BV8 (3M)-3-[(4P)-2-chloro-4-(6-methylpyridin-2-yl)phenyl]-1-{2-[2-(dimethylamino)ethoxy]ethyl}-1,6-naphthyridin-2(1H)-one × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Lithium Sulfate, 0.1M Tris pH 8.5, 30% PEG4000	分辨率 1.77 Å R-free 0.203
9NBX Crystal structure of PAK1 bound to C2 提交 2025-02-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–218（217 aa）链 B 2–218（217 aa）	未记录	A1BW5 (6M)-8-(3-aminopropyl)-6-(4-butoxy-2-methylphenyl)-2-(methylamino)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Lithium Sulfate, 0.1M Tris pH8.5, 30% PEG 4000	分辨率 2.15 Å R-free 0.265
9NMC SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 3-(6-bromo-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-4-oxoquinolin-1(4H)-yl)propanenitrile 提交 2025-03-04	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	A1BY2 (3P)-6-bromo-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)quinolin-4(1H)-one × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M NaCl, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG 3350	分辨率 2.20 Å R-free 0.285
9NMD SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 3-(6-bromo-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-4-oxoquinolin-1(4H)-yl)propanenitrile 提交 2025-03-04	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	A1BY1 3-[(3P)-6-bromo-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-4-oxoquinolin-1(4H)-yl]propanenitrile × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；0.2 M sodium chloride, 0.1 M Bis-TRIS pH 5.5-7.5, 25 % PEG 33500	分辨率 2.40 Å R-free 0.268
9NME SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 2-[2-hydroxy-3-(4-isoquinolyl)-4-oxo-6-(trifluoromethyl)-1H-quinolin-8-yl]benzonitrile 提交 2025-03-04	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	A1BY3 (2M)-2-[(3P)-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-4-oxo-6-(trifluoromethyl)-1,4-dihydroquinolin-8-yl]benzonitrile × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG 3350	分辨率 1.60 Å R-free 0.228
9NMF SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 8-(6-amino-3-pyridyl)-2-hydroxy-3-(4-isoquinolyl)-6-(trifluoromethyl)-1H-quinolin-4-one 提交 2025-03-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）链 B 1–218（218 aa）	未记录	A1BY4 (3P,8M)-8-(6-aminopyridin-3-yl)-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-6-(trifluoromethyl)quinolin-4(1H)-one × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Lithium Sulfate monohydrate, 0.1M BIS-TRIS pH 5.5-7.5, 25% PEG 3350	分辨率 1.80 Å R-free 0.225
9NMG SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 8-(2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)-2-hydroxy-3-(4-isoquinolyl)-6-(trifluoromethyl)-1H-quinolin-4-one 提交 2025-03-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）链 B 1–218（218 aa）	未记录	A1BY5 (3P,8P)-8-(2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-6-(trifluoromethyl)quinolin-4(1H)-one × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5-7.5, 25 % PEG 3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.245
9NMH SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 2-hydroxy-3-(4-isoquinolyl)-8-(1,2,3,6-tetrahydropyridin-4-yl)-6-(trifluoromethyl)-1H-quinolin-4-one 提交 2025-03-04	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	A1BY6 (3P,8P)-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-8-(1,2,3,6-tetrahydropyridin-4-yl)-6-(trifluoromethyl)quinolin-4(1H)-one × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M NaCl, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5-7.5, 25% PEG 3350	分辨率 2.50 Å R-free 0.274
9RPD D. melanogaster Augmin TII N-clamp (GST-fusion) bound to a microtubule, well-defined subset of particles 提交 2025-06-24	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 K 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.90 Å
9YW2 Complex structure of human p97 bound to Faf1 and Ufd1 (NTD focused) 提交 2025-10-23	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.27 Å

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UniProt名称	GST26_SCHJA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–218； UniProt 1–218

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1m9a
沉积日期 deposition_date	2002-07-28
结构标题 title	Crystal structure of the 26 kDa glutathione S-transferase from Schistosoma japonicum complexed with S-hexylglutathione
关键词 keywords	Glutathione transferase, antigen, multigene family, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	18.73 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	17.36 Å
零角强度 I(0) i0	10849700.00
分子量 molecular_weight	25645.0 kDa
排除体积 excluded_volume	32581 Å³
包络体积 envelope_volume	36791 Å³
水化壳体积 shell_volume	17620 Å³
包络直径 envelope_diameter	58.4 Å
壳层 Rg shell_rg	23.63 Å
包络 Rg envelope_rg	17.66 Å
形状 Rg shape_rg	17.33 Å
总 Rg total_rg	18.49 Å
总原子数 total_atoms	1804
残基数 n_residues	216
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	58.1 Å
Rg (实空间) rg_real	18.61 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.26 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.0850e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.1950e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	18.63 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	10850000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8967
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	25.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.131
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.450
角度范围 angular_range	— – 0.4250 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	2759000.0000
实空间数据点数 n_real_points	74
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.896; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.989; Smooth: 0.977

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Glutathione S-Transferase 26 kDa
分子量 formula_weight	25534.7 kDa
EC 编号 ec_number	2.5.1.18
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1981

MSPILGYWKIKGLVQPTRLLLEYLEEKYEEHLYERDEGDKWRNKKFELGLEFPNLPYYIDGDVKLTQSMAIIRYIADKHNMLGGCPKERAEISMLEGAVLDIRYGVSRIAYSKDFETLKVDFLSKLPEMLKMFEDRLCHKTYLNGDHVTHPDFMLYDALDVVLYMDPMCLDAFPKLVCFKKRIEAIPQIDKYLKSSKYIAWPLQGWQATFGGGDHPPK

来源 Source

来源生物 organism	Schistosoma japonicum
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	6182
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	S-HEXYLGLUTATHIONE
分子量 formula_weight	392.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	174

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d1m9aa1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.45 — GST C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.45.1 — GST C-terminal domain-like
家族 Family family	a.45.1.1 — Glutathione S-transferase (GST), C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1m9aa2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.47 — Thioredoxin fold
超家族 Superfamily superfamily	c.47.1 — Thioredoxin-like
家族 Family family	c.47.1.5 — Glutathione S-transferase (GST), N-terminal domain

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	1m9aA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	30 — Glutaredoxin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Glutaredoxin

结构域编号 domain_id	1m9aA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1050 — Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

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8. 引用文献 (3)

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晶胞边长 a length_a	114.993 Å
晶胞边长 b length_b	114.993 Å
晶胞边长 c length_c	78.352 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 63 2 2
空间群编号 int_tables_number	182
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.100 Å
最低分辨率 resolution_low	33.900 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2000
R_free r_free	0.2240

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pddf	/app/data/pr_computation/m9/1m9a/1m9a.pr.out
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