1mdv

KEY ROLE OF PHENYLALANINE 20 IN CYTOCHROME C3: STRUCTURE, STABILITY AND FUNCTION STUDIES

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CYTOCHROME C3

Desulfovibrio vulgaris subsp. vulgaris str. Hildenborough

UniProt P00131

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 water × 1 与蛋白数一致
3 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 8 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 32 water × 8 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CYC3_DESVH
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–107; UniProt 23–129 作者链 B; PDB构建体 1–107; UniProt 23–129

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1mdv
沉积日期 deposition_date1998-09-08
结构标题 titleKEY ROLE OF PHENYLALANINE 20 IN CYTOCHROME C3: STRUCTURE, STABILITY AND FUNCTION STUDIES
关键词 keywordsMUTANT CYTOCHROME C3, DESULFOVIBRIO VULGARIS HILDENBOROUGH, ELECTRON TRANSPORT; ELECTRON TRANSPORT
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1mdv__assembly_3__model_1

Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1mdv__assembly_3__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1mdv__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)37.92 Å
Rg(电子密度)37.38 Å
总 Rg37.98 Å
原子数7496
残基数804
排除体积133360 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1mdv__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1mdv__assembly_2__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 1mdv__assembly_3__model_1 octameric (8) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1mdva_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.138 — Multiheme cytochromes
超家族 Superfamily superfamilya.138.1 — Multiheme cytochromes
家族 Family familya.138.1.1 — Cytochrome c3-like
结构域编号 domain_idd1mdvb_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.138 — Multiheme cytochromes
超家族 Superfamily superfamilya.138.1 — Multiheme cytochromes
家族 Family familya.138.1.1 — Cytochrome c3-like

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id1mdvA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology10 — Cytochrome C3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cytochrome C3
结构域编号 domain_id1mdvB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology10 — Cytochrome C3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cytochrome C3

7. 引用文献 (3)