SAXSdb — 1ncc

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

INFLUENZA A SUBTYPE N9 NEURAMINIDASE

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 其他聚合物 4	IGG2A-KAPPA NC41 FAB (LIGHT CHAIN) × 4 IGG2A-KAPPA NC41 FAB (HEAVY CHAIN) × 4 （P01865） ;alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CALCIUM ION × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NRAM_IATRA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–389； UniProt 82–470

IGG2A-KAPPA NC41 FAB (HEAVY CHAIN)

物种未注明

UniProt P01865

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 其他聚合物 4	INFLUENZA A SUBTYPE N9 NEURAMINIDASE × 4 （P03472） IGG2A-KAPPA NC41 FAB (LIGHT CHAIN) × 4 ;alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CALCIUM ION × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GCAM_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 121–221； UniProt 1–101

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1ncc
沉积日期 deposition_date	1992-01-21
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURES OF TWO MUTANT NEURAMINIDASE-ANTIBODY COMPLEXES WITH AMINO ACID SUBSTITUTIONS IN THE INTERFACE
关键词 keywords	HYDROLASE(O-GLYCOSYL); HYDROLASE(O-GLYCOSYL)
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1ncc__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1ncc__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1ncc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	54.10 Å
Rg（电子密度）	53.85 Å
总 Rg	54.16 Å
原子数	26032
残基数	3296
排除体积	458220 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1ncc__assembly_1__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	INFLUENZA A SUBTYPE N9 NEURAMINIDASE
分子量 formula_weight	43881.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.2.1.18
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N
原子数 atom_count	6508

IRDFNNLTKGLCTINSWHIYGKDNAVRIGEDSDVLVTREPYVSCDPDECRFYALSQGTTIRGKHSNGTIHDRSQYRALISWPLSSPPTVYNSRVECIGWSSTSCHDGKTRMSICISGPNNNASAVIWYNRRPVTEINTWARNILRTQESECVCHNGVCPVVFTDGSATGPAETRIYYFKEGKILKWEPLAGTAKHIEECSCYGERAEITCTCRDNWQGSNRPVIRIDPVAMTHTSQYICSPVLTDNPRPNDPTVGKCNDPYPGNNNNGVKGFSYLDGVNTWLGRTISRASRSGYEMLKVPNALTDDKSKPTQGQTIVLNTDWSGYSGSFMDYWAEGECYRACFYVELIRGRPKEDKVWWTSNSIVSMCSSTEFLGQWDWPDGAKIEYFL

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	IGG2A-KAPPA NC41 FAB (LIGHT CHAIN)
分子量 formula_weight	23722.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

DIVMTQSPKFMSTSVGDRVTITCKASQDVSTAVVWYQQKPGQSPKLLIYWASTRHIGVPDRFAGSGSGTDYTLTISSVQAEDLALYYCQQHYSPPWTFGGGTKLEIKRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	IGG2A-KAPPA NC41 FAB (HEAVY CHAIN)
分子量 formula_weight	23626.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

QIQLVQSGPELKKPGETVKISCKASGYTFTNYGMNWVKQAPGKGLKWMGWINTNTGEPTYGEEFKGRFAFSLETSASTANLQINNLKNEDTATFFCARGEDNFGSLSDYWGQGTTVTVSSAKTTAPSVYPLAPVCGDTTGSSVTLGCLVKGYFPEPVTLTWNSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVTSSTWPSQSITCNVAHPASSTKVDKKIEPRG

实体 4 Entity 4 branched

描述 description	;alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	1073.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

结构域编号 domain_id	d1ncch1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d1ncch2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

结构域编号 domain_id	d1nccl1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d1nccl2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

结构域编号 domain_id	d1nccn_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.68 — 6-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamily	b.68.1 — Sialidases
家族 Family family	b.68.1.1 — Sialidases (neuraminidases)

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id	1nccH01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1nccH02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1nccL01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1nccL02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1nccN00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	120 — 6 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Neuraminidase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

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晶胞边长 a length_a	167.000 Å
晶胞边长 b length_b	167.000 Å
晶胞边长 c length_c	124.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 4 21 2
空间群编号 int_tables_number	90
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.500 Å
最低分辨率 resolution_low	8.000 Å
R 因子 r_factor	0.2120
R_work r_work	0.2120
R_free r_free	—

CRYSTAL STRUCTURES OF TWO MUTANT NEURAMINIDASE-ANTIBODY COMPLEXES WITH AMINO ACID SUBSTITUTIONS IN THE INTERFACE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

INFLUENZA A SUBTYPE N9 NEURAMINIDASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

IGG2A-KAPPA NC41 FAB (HEAVY CHAIN)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1ncc__assembly_1__model_1

1ncc__assembly_1__model_1 | I(q)

1ncc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

CATH v4.4 (5 domains)

7. 引用文献 (4)

CRYSTAL STRUCTURES OF TWO MUTANT NEURAMINIDASE-ANTIBODY COMPLEXES WITH AMINO ACID SUBSTITUTIONS IN THE INTERFACE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

INFLUENZA A SUBTYPE N9 NEURAMINIDASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

IGG2A-KAPPA NC41 FAB (HEAVY CHAIN)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1ncc__assembly_1__model_1

1ncc__assembly_1__model_1 | I(q)

1ncc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

CATH v4.4 (5 domains)

7. 引用文献 (4)