SAXSdb — 1ns1

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NONSTRUCTURAL PROTEIN 1

Influenza A virus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–73 链 B； UniProt 1–73	片段：RNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 1 - 73	无其他共同聚合物	SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 6；293 K	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1NS1	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AIL N-TERMINAL FRAGMENT OF NS1 PROTEIN FROM INFLUENZA A VIRUS 提交 1997-04-21	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–72（72 aa）片段：RNA-BINDING DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；NATIVE CRYSTALS WERE GROWN FROM 50MM NAH2PO4, 100MM NACL, 1MM NAN3 AT PH 6.5; MERCURY DERIVATIVE CRYSTAL WAS PREPARED BY SOAKING THE NATIVE CRYSTAL IN 2MM CH3HGCL WITH 10% PEG 6000 AT PH 8.0; PLATINUM DERIVATIVE CRYSTAL WAS PREPARED BY SOAKING THE NATIVE CRYSTAL IN 4MM PT(NH3)2CL2 WITH 10% PEG 6000 AT PH 6.5.	分辨率 1.90 Å R-free 0.229
2RHK Crystal structure of influenza A NS1A protein in complex with F2F3 fragment of human cellular factor CPSF30, Northeast Structural Genomics Targets OR8C and HR6309A 提交 2007-10-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 85–215（131 aa）片段：NS1A effector domain (UNP residues 85-215) 链 B 85–215（131 aa）片段：NS1A effector domain (UNP residues 85-215)	未记录	NO3 NITRATE ION × 5 ZN ZINC ION × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；293 K；0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50	分辨率 1.95 Å R-free 0.234
2RHK Crystal structure of influenza A NS1A protein in complex with F2F3 fragment of human cellular factor CPSF30, Northeast Structural Genomics Targets OR8C and HR6309A 提交 2007-10-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 85–215（131 aa）片段：NS1A effector domain (UNP residues 85-215) 链 B 85–215（131 aa）片段：NS1A effector domain (UNP residues 85-215)	未记录	NO3 NITRATE ION × 9 ZN ZINC ION × 6 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；293 K；0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50	分辨率 1.95 Å R-free 0.234
2RHK Crystal structure of influenza A NS1A protein in complex with F2F3 fragment of human cellular factor CPSF30, Northeast Structural Genomics Targets OR8C and HR6309A 提交 2007-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 85–215（131 aa）片段：NS1A effector domain (UNP residues 85-215)	未记录	NO3 NITRATE ION × 5 ZN ZINC ION × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；293 K；0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50	分辨率 1.95 Å R-free 0.234
2RHK Crystal structure of influenza A NS1A protein in complex with F2F3 fragment of human cellular factor CPSF30, Northeast Structural Genomics Targets OR8C and HR6309A 提交 2007-10-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 85–215（131 aa）片段：NS1A effector domain (UNP residues 85-215) 链 B 85–215（131 aa）片段：NS1A effector domain (UNP residues 85-215)	未记录	NO3 NITRATE ION × 4 ZN ZINC ION × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；293 K；0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50	分辨率 1.95 Å R-free 0.234
3EE8 Structure of NS1 effector domain 提交 2008-09-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 84–205（122 aa）片段：Effector domain (UNP residues 84-205)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；12% (w/v) PEG3350, and 4% (v/v) Tacsimate (pH6.0), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.60 Å R-free 0.284
3EE8 Structure of NS1 effector domain 提交 2008-09-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 84–205（122 aa）片段：Effector domain (UNP residues 84-205)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；12% (w/v) PEG3350, and 4% (v/v) Tacsimate (pH6.0), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.60 Å R-free 0.284
3EE9 Structure of NS1 effector domain 提交 2008-09-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 84–205（122 aa）片段：Effector domain (UNP residues 84-205)	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Batch；pH 5.5；298 K；20% (w/v) PEG400, 0.1M CH3COONa (pH5.5), 0.1M MgSO4, Batch, temperature 298K	分辨率 2.14 Å R-free 0.234
3EE9 Structure of NS1 effector domain 提交 2008-09-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 84–205（122 aa）片段：Effector domain (UNP residues 84-205)	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Batch；pH 5.5；298 K；20% (w/v) PEG400, 0.1M CH3COONa (pH5.5), 0.1M MgSO4, Batch, temperature 298K	分辨率 2.14 Å R-free 0.234
3KWG X-ray structure of NS1 effector domain W187A mutant 提交 2009-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 78–205（128 aa）片段：NS1 effector domain	突变：W187A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；277 K；0.3M magnesium formate, 0.1M Bis-Tris , pH 5.5, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 2.21 Å R-free 0.233
3KWG X-ray structure of NS1 effector domain W187A mutant 提交 2009-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 78–205（128 aa）片段：NS1 effector domain	突变：W187A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；277 K；0.3M magnesium formate, 0.1M Bis-Tris , pH 5.5, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 2.21 Å R-free 0.233
3KWG X-ray structure of NS1 effector domain W187A mutant 提交 2009-12-01	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 78–205（128 aa）片段：NS1 effector domain 链 B 78–205（128 aa）片段：NS1 effector domain	突变：W187A 突变：W187A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；277 K；0.3M magnesium formate, 0.1M Bis-Tris , pH 5.5, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 2.21 Å R-free 0.233
3KWI X-ray structure of NS1 effector domain W187Y mutant 提交 2009-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 78–205（128 aa）片段：NS1 effector domain	突变：W187Y	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；277 K；0.3M magnesium formate and 0.1M Bis-Tris , pH 5.5, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 2.21 Å R-free 0.258
3KWI X-ray structure of NS1 effector domain W187Y mutant 提交 2009-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 78–205（128 aa）片段：NS1 effector domain	突变：W187Y	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；277 K；0.3M magnesium formate and 0.1M Bis-Tris , pH 5.5, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 2.21 Å R-free 0.258

共 6 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VNS1_IAUDO
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–73； UniProt 1–73 作者链 B； PDB构建体 1–73； UniProt 1–73

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1ns1
沉积日期 deposition_date	1997-10-02
结构标题 title	RNA-BINDING DOMAIN OF NON-STRUCTURAL PROTEIN 1 FROM INFLUENZA VIRUS, NMR, 16 STRUCTURES
关键词 keywords	NONSTRUCTURAL PROTEIN, RNA-BINDING, SSRNA-BINDING, DSRNA-BINDING, POLYA-RNA-BINDING, DIMERIC SIX HELICAL STRUCTURE; NONSTRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	SOLUTION NMR

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	15.32 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	14.90 Å
零角强度 I(0) i0	1036570000.00
分子量 molecular_weight	264970.0 kDa
排除体积 excluded_volume	329150 Å³
包络体积 envelope_volume	33313 Å³
水化壳体积 shell_volume	16931 Å³
包络直径 envelope_diameter	54.3 Å
壳层 Rg shell_rg	22.47 Å
包络 Rg envelope_rg	16.45 Å
形状 Rg shape_rg	14.85 Å
总 Rg total_rg	15.21 Å
总原子数 total_atoms	37376
残基数 n_residues	2336
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	50.4 Å
Rg (实空间) rg_real	15.19 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.32 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.0370e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.1760e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	15.20 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	1037000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8637
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	19.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.049
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.338
角度范围 angular_range	— – 0.5000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	489300.0000
实空间数据点数 n_real_points	80
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.745; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.992; Smooth: 0.997

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d1ns1a_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.16 — S15/NS1 RNA-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	a.16.1 — S15/NS1 RNA-binding domain
家族 Family family	a.16.1.1 — N-terminal, RNA-binding domain of nonstructural protein NS1

结构域编号 domain_id	d1ns1b_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.16 — S15/NS1 RNA-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	a.16.1 — S15/NS1 RNA-binding domain
家族 Family family	a.16.1.1 — N-terminal, RNA-binding domain of nonstructural protein NS1

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	1ns1A00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — S15/NS1, RNA-binding

结构域编号 domain_id	1ns1B00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — S15/NS1, RNA-binding

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8. 引用文献 (2)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

描述 description	NONSTRUCTURAL PROTEIN 1
分子量 formula_weight	8310.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	37376

来源生物 organism	Influenza A virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11320
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

RNA-BINDING DOMAIN OF NON-STRUCTURAL PROTEIN 1 FROM INFLUENZA VIRUS, NMR, 16 STRUCTURES

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NONSTRUCTURAL PROTEIN 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

fit	/app/data/saxs_computation/ns/1ns1/1ns1.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ns/1ns1/1ns1.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ns/1ns1/1ns1.dat