1o96

Structure of electron transferring flavoprotein for Methylophilus methylotrophus.

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ELECTRON TRANSFERRING FLAVOPROTEIN BETA-SUBUNIT

METHYLOPHILUS METHYLOTROPHUS

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	ELECTRON TRANSFERRING FLAVOPROTEIN ALPHA-SUBUNIT × 1 （P53571） ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	ELECTRON TRANSFERRING FLAVOPROTEIN ALPHA-SUBUNIT × 1 （P53571） ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	ELECTRON TRANSFERRING FLAVOPROTEIN ALPHA-SUBUNIT × 1 （P53571） ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	ELECTRON TRANSFERRING FLAVOPROTEIN ALPHA-SUBUNIT × 1 （P53571） ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ETFB_METME
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–264； UniProt 1–264 作者链 C； PDB构建体 1–264； UniProt 1–264 作者链 E； PDB构建体 1–264； UniProt 1–264 作者链 Q； PDB构建体 1–264； UniProt 1–264

ELECTRON TRANSFERRING FLAVOPROTEIN ALPHA-SUBUNIT

METHYLOPHILUS METHYLOTROPHUS

UniProt P53571

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	ELECTRON TRANSFERRING FLAVOPROTEIN BETA-SUBUNIT × 1 （P53570） ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	ELECTRON TRANSFERRING FLAVOPROTEIN BETA-SUBUNIT × 1 （P53570） ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	ELECTRON TRANSFERRING FLAVOPROTEIN BETA-SUBUNIT × 1 （P53570） ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	ELECTRON TRANSFERRING FLAVOPROTEIN BETA-SUBUNIT × 1 （P53570） ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ETFA_METME
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–320； UniProt 1–320 作者链 D； PDB构建体 1–320； UniProt 1–320 作者链 F； PDB构建体 1–320； UniProt 1–320 作者链 Z； PDB构建体 1–320； UniProt 1–320

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1o96
沉积日期 deposition_date	2002-12-11
结构标题 title	Structure of electron transferring flavoprotein for Methylophilus methylotrophus.
关键词 keywords	ELECTRON TRANSFER, FLAVOPROTEIN, FAD BINDING; ELECTRON TRANSFER
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1o96__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1o96__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1o96__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	24.82 Å
Rg（电子密度）	23.77 Å
总 Rg	24.60 Å
原子数	4299
残基数	574
排除体积	76236 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1o96__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1o96__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`1o96__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`1o96__assembly_4__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ELECTRON TRANSFERRING FLAVOPROTEIN BETA-SUBUNIT
分子量 formula_weight	28929.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,Q
原子数 atom_count	17093

MKILVAVKQTAALEEDFEIREDGMDVDEDFMMYDLNEWDDFSLEEAMKIKESSDTDVEVVVVSVGPDRVDESLRKCLAKGADRAVRVWDDAAEGSDAIVVGRILTEVIKKEAPDMVFAGVQSSDQAYASTGISVASYLNWPHAAVVADLQYKPGDNKAVIRRELEGGMLQEVEINCPAVLTIQLGINKPRYASLRGIKQAATKPIEEVSLADIGLSANDVGAAQSMSRVRRMYIPEKGRATMIEGTISEQAAKIIQIINEFKGA

来源 Source

来源生物 organism	METHYLOPHILUS METHYLOTROPHUS
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	17
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ELECTRON TRANSFERRING FLAVOPROTEIN ALPHA-SUBUNIT
分子量 formula_weight	33622.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,Z

SKILVIAEHRRNDLRPVSLELIGAANGLKKSGEDKVVVAVIGSQADAFVPALSVNGVDELVVVKGSSIDFDPDVFEASVSALIAAHNPSVVLLPHSVDSLGYASSLASKTGYGFATDVYIVEYQGDELVATRGGYNQKVNVEVDFPGKSTVVLTIRPSVFKPLEGAGSPVVSNVDAPSVQSRSQNKDYVEVGGGNDIDITTVDFIMSIGRGIGEETNVEQFRELADEAGATLCCSRPIADAGWLPKSRQVGQSGKVVGSCKLYVAMGISGSIQHMAGMKHVPTIIAVNTDPGASIFTIAKYGIVADIFDIEEELKAQLAA

来源 Source

来源生物 organism	METHYLOPHILUS METHYLOTROPHUS
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	17
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ADENOSINE MONOPHOSPHATE
分子量 formula_weight	347.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE
分子量 formula_weight	785.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

结构域编号 domain_id	d1o96a_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.26 — Adenine nucleotide alpha hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.26.2 — Adenine nucleotide alpha hydrolases-like
家族 Family family	c.26.2.3 — ETFP subunits

结构域编号 domain_id	d1o96b1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.26 — Adenine nucleotide alpha hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.26.2 — Adenine nucleotide alpha hydrolases-like
家族 Family family	c.26.2.3 — ETFP subunits

结构域编号 domain_id	d1o96b2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.31 — DHS-like NAD/FAD-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	c.31.1 — DHS-like NAD/FAD-binding domain
家族 Family family	c.31.1.2 — C-terminal domain of the electron transfer flavoprotein alpha subunit

结构域编号 domain_id	d1o96c_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.26 — Adenine nucleotide alpha hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.26.2 — Adenine nucleotide alpha hydrolases-like
家族 Family family	c.26.2.3 — ETFP subunits

结构域编号 domain_id	d1o96d1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.26 — Adenine nucleotide alpha hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.26.2 — Adenine nucleotide alpha hydrolases-like
家族 Family family	c.26.2.3 — ETFP subunits

结构域编号 domain_id	d1o96d2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.31 — DHS-like NAD/FAD-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	c.31.1 — DHS-like NAD/FAD-binding domain
家族 Family family	c.31.1.2 — C-terminal domain of the electron transfer flavoprotein alpha subunit

结构域编号 domain_id	d1o96e_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.26 — Adenine nucleotide alpha hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.26.2 — Adenine nucleotide alpha hydrolases-like
家族 Family family	c.26.2.3 — ETFP subunits

结构域编号 domain_id	d1o96f1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.26 — Adenine nucleotide alpha hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.26.2 — Adenine nucleotide alpha hydrolases-like
家族 Family family	c.26.2.3 — ETFP subunits

结构域编号 domain_id	d1o96f2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.31 — DHS-like NAD/FAD-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	c.31.1 — DHS-like NAD/FAD-binding domain
家族 Family family	c.31.1.2 — C-terminal domain of the electron transfer flavoprotein alpha subunit

结构域编号 domain_id	d1o96q_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.26 — Adenine nucleotide alpha hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.26.2 — Adenine nucleotide alpha hydrolases-like
家族 Family family	c.26.2.3 — ETFP subunits

结构域编号 domain_id	d1o96z1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.26 — Adenine nucleotide alpha hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.26.2 — Adenine nucleotide alpha hydrolases-like
家族 Family family	c.26.2.3 — ETFP subunits

结构域编号 domain_id	d1o96z2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.31 — DHS-like NAD/FAD-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	c.31.1 — DHS-like NAD/FAD-binding domain
家族 Family family	c.31.1.2 — C-terminal domain of the electron transfer flavoprotein alpha subunit

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	1o96A00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	620 — HUPs

结构域编号 domain_id	1o96B01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	620 — HUPs

结构域编号 domain_id	1o96B02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1220 — TPP-binding domain

结构域编号 domain_id	1o96C00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	620 — HUPs

结构域编号 domain_id	1o96D01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	620 — HUPs

结构域编号 domain_id	1o96D02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1220 — TPP-binding domain

结构域编号 domain_id	1o96E00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	620 — HUPs

结构域编号 domain_id	1o96F01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	620 — HUPs

结构域编号 domain_id	1o96F02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1220 — TPP-binding domain

结构域编号 domain_id	1o96Q00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	620 — HUPs

结构域编号 domain_id	1o96Z01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	620 — HUPs

结构域编号 domain_id	1o96Z02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1220 — TPP-binding domain

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晶胞边长 a length_a	117.516 Å
晶胞边长 b length_b	126.877 Å
晶胞边长 c length_c	221.390 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.100 Å
最低分辨率 resolution_low	19.920 Å
R 因子 r_factor	0.2150
R_work r_work	0.2120
R_free r_free	0.2780

Structure of electron transferring flavoprotein for Methylophilus methylotrophus.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ELECTRON TRANSFERRING FLAVOPROTEIN BETA-SUBUNIT

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ELECTRON TRANSFERRING FLAVOPROTEIN ALPHA-SUBUNIT

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1o96__assembly_2__model_1

1o96__assembly_2__model_1 | I(q)

1o96__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of electron transferring flavoprotein for Methylophilus methylotrophus.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ELECTRON TRANSFERRING FLAVOPROTEIN BETA-SUBUNIT

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ELECTRON TRANSFERRING FLAVOPROTEIN ALPHA-SUBUNIT

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1o96__assembly_2__model_1

1o96__assembly_2__model_1 | I(q)

1o96__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (1)