1ofc

nucleosome recognition module of ISWI ATPase

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ISWI PROTEIN

DROSOPHILA MELANOGASTER

UniProt Q24368

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 alpha-D-glucopyranose × 1 4-deoxy-alpha-D-glucopyranose × 1 GLYCEROL × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ISWI_DROME
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 X; PDB构建体 4–304; UniProt 691–991

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1ofc
沉积日期 deposition_date2003-04-10
结构标题 titlenucleosome recognition module of ISWI ATPase
关键词 keywordsNUCLEAR PROTEIN, CHROMATIN REMODELING FACTOR, ISWI, ATPASE, SANT DOMAIN, NUCLEOSOME RECOGNITION; NUCLEAR PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1ofc__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1ofc__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1ofc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)29.71 Å
Rg(电子密度)29.90 Å
总 Rg30.23 Å
原子数2207
残基数267
排除体积39230 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1ofc__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd1ofcx1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamilya.4.1 — Homeodomain-like
家族 Family familya.4.1.3 — Myb/SANT domain
结构域编号 domain_idd1ofcx2
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamilya.4.1 — Homeodomain-like
家族 Family familya.4.1.13 — SLIDE domain
结构域编号 domain_idd1ofcx3
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.187 — HAND domain of the nucleosome remodeling ATPase ISWI
超家族 Superfamily superfamilya.187.1 — HAND domain of the nucleosome remodeling ATPase ISWI
家族 Family familya.187.1.1 — HAND domain of the nucleosome remodeling ATPase ISWI

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1ofcX01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1040 — N-(1-d-carboxylethyl)-l-norvaline Dehydrogenase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — ISWI, HAND domain
结构域编号 domain_id1ofcX02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Homeodomain-like
结构域编号 domain_id1ofcX03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1190 — iswi atpase
结构域编号 domain_id1ofcX04
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Homeodomain-like
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7. 引用文献 (1)