1piu

OXIDIZED RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-D84E MUTANT CONTAINING OXO-BRIDGED DIFERRIC CLUSTER

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 beta chain

Escherichia coli

UniProt P69924

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–375 链 B; UniProt 1–375 突变:D84E FE FE (III) ION × 4 HG MERCURY (II) ION × 10 O OXYGEN ATOM × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;310 K;20% PEG 4000, 200mM NaCl, 50mM MES, 0.3% dioxane, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 310K 分辨率 2.20 Å R-free 0.232

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 62 个其他 PDB 条目、126 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RIR2_ECOLI
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–375; UniProt 1–375 作者链 B; PDB构建体 1–375; UniProt 1–375

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

暂无 SAXS 图

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

暂无 P(r) 图
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1piu
沉积日期 deposition_date2003-05-30
结构标题 titleOXIDIZED RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2-D84E MUTANT CONTAINING OXO-BRIDGED DIFERRIC CLUSTER
关键词 keywordsfour-helix bundle, oxo-bridged diferric cluster, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

该条目暂无 SAXS 数据。

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

该条目暂无 P(r) 分析数据。

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1piua_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.25 — Ferritin-like
超家族 Superfamily superfamilya.25.1 — Ferritin-like
家族 Family familya.25.1.2 — Ribonucleotide reductase-like
结构域编号 domain_idd1piub_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.25 — Ferritin-like
超家族 Superfamily superfamilya.25.1 — Ferritin-like
家族 Family familya.25.1.2 — Ribonucleotide reductase-like

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id1piuA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology620 — Ribonucleotide Reductase, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ribonucleotide Reductase, subunit A
结构域编号 domain_id1piuB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology620 — Ribonucleotide Reductase, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ribonucleotide Reductase, subunit A

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (0)