1ps9

The Crystal Structure and Reaction Mechanism of E. coli 2,4-Dienoyl CoA Reductase

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

2,4-dienoyl-CoA reductase

Escherichia coli

UniProt P42593

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 CHLORIDE ION × 3 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 1 5-MERCAPTOETHANOL-2-DECENOYL-COENZYME A × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FADH_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–671; UniProt 1–671

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1ps9
沉积日期 deposition_date2003-06-20
结构标题 titleThe Crystal Structure and Reaction Mechanism of E. coli 2,4-Dienoyl CoA Reductase
关键词 keywordsIRON-SULFUR, TIM BARREL, FLAVODOXIN, FLAVIN, ELECTRON TRANSFER, HYDRIDE TRANSFER, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1ps9__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1ps9__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1ps9__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)26.88 Å
Rg(电子密度)26.11 Å
总 Rg26.64 Å
原子数5303
残基数671
排除体积93814 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1ps9__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd1ps9a1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamilyc.1.4 — FMN-linked oxidoreductases
家族 Family familyc.1.4.1 — FMN-linked oxidoreductases
结构域编号 domain_idd1ps9a2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.3 — FAD/NAD(P)-binding domain
超家族 Superfamily superfamilyc.3.1 — FAD/NAD(P)-binding domain
家族 Family familyc.3.1.1 — C-terminal domain of adrenodoxin reductase-like
结构域编号 domain_idd1ps9a3
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.4 — Nucleotide-binding domain
超家族 Superfamily superfamilyc.4.1 — Nucleotide-binding domain
家族 Family familyc.4.1.1 — N-terminal domain of adrenodoxin reductase-like

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id1ps9A01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily70 — Aldolase class I
结构域编号 domain_id1ps9A02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id1ps9A03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — FAD/NAD(P)-binding domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — FAD/NAD(P)-binding domain
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7. 引用文献 (2)