1q3y

NMR structure of the Cys28His mutant (D form) of the nucleocapsid protein NCp7 of HIV-1.

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GAG protein

物种未注明

UniProt Q9PY17

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 ZINC ION × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9PY17_9HIV1
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–42; UniProt 390–431

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1q3y
沉积日期 deposition_date2003-08-01
结构标题 titleNMR structure of the Cys28His mutant (D form) of the nucleocapsid protein NCp7 of HIV-1.
关键词 keywordsCCHC zinc knuckle, CCHH zinc knuckle, Viral protein; VIRAL PROTEIN
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1q3y__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1q3y__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 104 105 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1q3y__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)14.59 Å
Rg(电子密度)14.38 Å
总 Rg15.08 Å
原子数646
残基数41
排除体积5745 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1q3y__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1q3ya_
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.40 — Retrovirus zinc finger-like domains
超家族 Superfamily superfamilyg.40.1 — Retrovirus zinc finger-like domains
家族 Family familyg.40.1.1 — Retrovirus zinc finger-like domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1q3yA00
类 Class class4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture10 — Irregular
拓扑 Topology topology60 — HIV-1 Nucleocapsid Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Zinc finger, CCHC-type
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7. 引用文献 (2)