1q4q

Crystal structure of a DIAP1-Dronc complex

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Apoptosis 1 inhibitor

Drosophila melanogaster

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Nedd2-like caspase CG8091-PA × 1 （Q9XYF4） ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
10	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Nedd2-like caspase CG8091-PA × 1 （Q9XYF4） ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Nedd2-like caspase CG8091-PA × 1 （Q9XYF4） ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Nedd2-like caspase CG8091-PA × 1 （Q9XYF4） ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Nedd2-like caspase CG8091-PA × 1 （Q9XYF4） ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Nedd2-like caspase CG8091-PA × 1 （Q9XYF4） ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Nedd2-like caspase CG8091-PA × 1 （Q9XYF4） ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
7	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Nedd2-like caspase CG8091-PA × 1 （Q9XYF4） ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
8	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Nedd2-like caspase CG8091-PA × 1 （Q9XYF4） ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
9	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Nedd2-like caspase CG8091-PA × 1 （Q9XYF4） ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IAP1_DROME
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–124； UniProt 201–323 作者链 B； PDB构建体 1–124； UniProt 201–323 作者链 C； PDB构建体 1–124； UniProt 201–323 作者链 D； PDB构建体 1–124； UniProt 201–323 作者链 E； PDB构建体 1–124； UniProt 201–323 作者链 F； PDB构建体 1–124； UniProt 201–323 作者链 G； PDB构建体 1–124； UniProt 201–323 作者链 H； PDB构建体 1–124； UniProt 201–323 作者链 I； PDB构建体 1–124； UniProt 201–323 作者链 J； PDB构建体 1–124； UniProt 201–323

Nedd2-like caspase CG8091-PA

物种未注明

UniProt Q9XYF4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Apoptosis 1 inhibitor × 1 （Q24306） ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
10	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Apoptosis 1 inhibitor × 1 （Q24306） ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Apoptosis 1 inhibitor × 1 （Q24306） ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Apoptosis 1 inhibitor × 1 （Q24306） ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Apoptosis 1 inhibitor × 1 （Q24306） ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Apoptosis 1 inhibitor × 1 （Q24306） ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Apoptosis 1 inhibitor × 1 （Q24306） ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
7	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Apoptosis 1 inhibitor × 1 （Q24306） ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
8	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Apoptosis 1 inhibitor × 1 （Q24306） ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
9	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Apoptosis 1 inhibitor × 1 （Q24306） ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ICENC_DROME
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–12； UniProt 114–125 作者链 L； PDB构建体 1–12； UniProt 114–125 作者链 M； PDB构建体 1–12； UniProt 114–125 作者链 N； PDB构建体 1–12； UniProt 114–125 作者链 O； PDB构建体 1–12； UniProt 114–125 作者链 P； PDB构建体 1–12； UniProt 114–125 作者链 Q； PDB构建体 1–12； UniProt 114–125 作者链 R； PDB构建体 1–12； UniProt 114–125 作者链 S； PDB构建体 1–12； UniProt 114–125 作者链 T； PDB构建体 1–12； UniProt 114–125

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1q4q
沉积日期 deposition_date	2003-08-04
结构标题 title	Crystal structure of a DIAP1-Dronc complex
关键词 keywords	caspase, IAP, ubiquitination, apoptosis, APOPTOSIS INHIBITOR; APOPTOSIS INHIBITOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1q4q__assembly_9__model_1

Assembly 9 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1q4q__assembly_9__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1q4q__assembly_9__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	13.97 Å
Rg（电子密度）	12.81 Å
总 Rg	14.14 Å
原子数	844
残基数	102
排除体积	14982 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1q4q__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1q4q__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`1q4q__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`1q4q__assembly_4__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`1q4q__assembly_5__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
6	1	`1q4q__assembly_6__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
7	1	`1q4q__assembly_7__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
8	1	`1q4q__assembly_8__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
9	1	`1q4q__assembly_9__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
10	1	`1q4q__assembly_10__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Apoptosis 1 inhibitor
分子量 formula_weight	14078.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	10

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J
原子数 atom_count	9166

DVQPETCRPSAASGNYFPQYPEYAIETARLRTFEAWPRNLKQKPHQLAEAGFFYTGVGDRVRCFSCGGGLMDWNDNDEPWEQHALWLSQCRFVKLMKGQLYIDTVAAKPVLAEEKEESTSIGGD

来源 Source

来源生物 organism	Drosophila melanogaster
通用名 common_name	fruit fly
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7227
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Nedd2-like caspase CG8091-PA
分子量 formula_weight	1474.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T

SRPPFISLNERR

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	557

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

SCOP 2.08 (10 domains)

结构域编号 domain_id	d1q4qa_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.52 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
超家族 Superfamily superfamily	g.52.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
家族 Family family	g.52.1.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat

结构域编号 domain_id	d1q4qb_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.52 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
超家族 Superfamily superfamily	g.52.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
家族 Family family	g.52.1.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat

结构域编号 domain_id	d1q4qc_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.52 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
超家族 Superfamily superfamily	g.52.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
家族 Family family	g.52.1.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat

结构域编号 domain_id	d1q4qd_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.52 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
超家族 Superfamily superfamily	g.52.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
家族 Family family	g.52.1.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat

结构域编号 domain_id	d1q4qe_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.52 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
超家族 Superfamily superfamily	g.52.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
家族 Family family	g.52.1.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat

结构域编号 domain_id	d1q4qf_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.52 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
超家族 Superfamily superfamily	g.52.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
家族 Family family	g.52.1.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat

结构域编号 domain_id	d1q4qg_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.52 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
超家族 Superfamily superfamily	g.52.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
家族 Family family	g.52.1.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat

结构域编号 domain_id	d1q4qh_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.52 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
超家族 Superfamily superfamily	g.52.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
家族 Family family	g.52.1.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat

结构域编号 domain_id	d1q4qi_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.52 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
超家族 Superfamily superfamily	g.52.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
家族 Family family	g.52.1.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat

结构域编号 domain_id	d1q4qj_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.52 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
超家族 Superfamily superfamily	g.52.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
家族 Family family	g.52.1.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat

CATH v4.4 (10 domains)

结构域编号 domain_id	1q4qA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A

结构域编号 domain_id	1q4qB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A

结构域编号 domain_id	1q4qC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A

结构域编号 domain_id	1q4qD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A

结构域编号 domain_id	1q4qE00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A

结构域编号 domain_id	1q4qF00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A

结构域编号 domain_id	1q4qG00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A

结构域编号 domain_id	1q4qH00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A

结构域编号 domain_id	1q4qI00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A

结构域编号 domain_id	1q4qJ00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A

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晶胞边长 a length_a	128.900 Å
晶胞边长 b length_b	128.900 Å
晶胞边长 c length_c	183.695 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	60

空间群 space_group	P 65
空间群编号 int_tables_number	170
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.100 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	0.2030
R_work r_work	0.1990
R_free r_free	0.2460

Crystal structure of a DIAP1-Dronc complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Apoptosis 1 inhibitor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Nedd2-like caspase CG8091-PA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1q4q__assembly_9__model_1

1q4q__assembly_9__model_1 | I(q)

1q4q__assembly_9__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

SCOP 2.08 (10 domains)

CATH v4.4 (10 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of a DIAP1-Dronc complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Apoptosis 1 inhibitor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Nedd2-like caspase CG8091-PA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1q4q__assembly_9__model_1

1q4q__assembly_9__model_1 | I(q)

1q4q__assembly_9__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

SCOP 2.08 (10 domains)

CATH v4.4 (10 domains)

7. 引用文献 (1)