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1qck

SOLUTION STRUCTURE OF HUMAN BARRIER-TO-AUTOINTEGRATION FACTOR BAF, NMR, REGULARIZED MEAN STRUCTURE PLUS 20 INDIVIDUAL SIMULATED ANNEALING STRUCTURES

Method: SOLUTION NMR Dmax: 51.1 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (BARRIER-TO-AUTOINTEGRATION FACTOR)

Homo sapiens

UniProt O75531

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–89 链 B； UniProt 1–89 未记录 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 6.5；313 K 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1QCK Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1CI4 THE CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN BARRIER-TO-AUTOINTEGRATION FACTOR (BAF) 提交 1999-04-07 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–89（89 aa）
链 B 1–89（89 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；DIALYSIS OF PROTEIN AT 8.3 MG/ML IN 20MM TRIS HCL AT PH7.0, 10%(W/V) GLYCEROL, 150MM NACL, 10MM DTT, AND 0.1MM EDTA AGAINST 20MM IMIDAZOLE AT PH 6.5, 80MM NACL, AND 10MM DTT. DIALYSIS DONE AT ROOM TEMPERATURE.(ALL CONCENTRATIONS ARE IN MILLI-MOLAR)
分辨率 1.90 Å R-free 0.262
2BZF Structural basis for DNA bridging by barrier-to-autointegration factor (BAF) 提交 2005-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric
链 A 1–89（89 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.4；pH 7.40
分辨率 2.87 Å R-free 0.268
2EZX SOLUTION STRUCTURE OF HUMAN BARRIER-TO-AUTOINTEGRATION FACTOR BAF, NMR, REGULARIZED MEAN STRUCTURE 提交 1998-07-26 当前字段一致 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–89（89 aa）
链 B 1–89（89 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；313 K
分辨率未提供
2EZY SOLUTION STRUCTURE OF HUMAN BARRIER-TO-AUTOINTEGRATION FACTOR BAF, NMR, ENSEMBLE OF 20 SIMULATED ANNEALING STRUCTURES 提交 1998-07-26 当前字段一致 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–89（89 aa）
链 B 1–89（89 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；313 K
分辨率未提供
2EZZ SOLUTION STRUCTURE OF HUMAN BARRIER-TO-AUTOINTEGRATION FACTOR BAF NMR, ENSEMBLE OF 20 SIMULATED ANNEALING STRUCTURES 提交 1998-07-26 当前字段一致 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–89（89 aa）
链 B 1–89（89 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；313 K
分辨率未提供
2ODG Complex of barrier-to-autointegration factor and LEM-domain of emerin 提交 2006-12-22 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–89（89 aa） 片段：RESIDUES 1-89
链 B 1–89（89 aa） 片段：RESIDUES 1-89
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM POTASSIUM PHOSPHATE 200 mM NACL
分辨率未提供
6GHD Structural analysis of the ternary complex between lamin A/C, BAF and emerin identifies an interface disrupted in autosomal recessive progeroid diseases 提交 2018-05-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 2–89（88 aa）
链 E 2–89（88 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；25% PEG3.350, 20mM Tris-BispH5.5, 30mM NaCl, 0.2M NH4SO4
分辨率 2.10 Å R-free 0.247
6GHD Structural analysis of the ternary complex between lamin A/C, BAF and emerin identifies an interface disrupted in autosomal recessive progeroid diseases 提交 2018-05-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–89（88 aa）
链 C 2–89（88 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；25% PEG3.350, 20mM Tris-BispH5.5, 30mM NaCl, 0.2M NH4SO4
分辨率 2.10 Å R-free 0.247
6UNT Barrier-to-autointegration factor soaked in DMSO: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-13 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–89（89 aa）
链 B 1–89（89 aa）
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277.15 K；80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.75 Å R-free 0.223
6URE Barrier-to-autointegration factor Aqueous: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-23 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–89（89 aa）
链 B 1–89（89 aa）
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277.15 K；80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.65 Å R-free 0.202
6URJ Barrier-to-autointegration factor soaked in Acetone: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-23 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–89（89 aa）
链 B 1–89（89 aa）
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277.15 K；80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.65 Å R-free 0.192
6URK Barrier-to-autointegration factor soaked in Glycerol: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-23 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–89（89 aa）
链 B 1–89（89 aa）
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277.15 K；80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.86 Å R-free 0.226
6URL Barrier-to-autointegration factor soaked in isopropanol: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-23 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–89（89 aa）
链 B 1–89（89 aa）
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277.15 K；80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.72 Å R-free 0.201
6URN Barrier-to-autointegration factor t-butanol: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-23 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–89（89 aa）
链 B 1–89（89 aa）
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277.15 K；80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.68 Å R-free 0.204
6URR Barrier-to-autointegration factor soaked in Dioxane: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-24 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–89（89 aa）
链 B 1–89（89 aa）
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277.15 K；80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.80 Å R-free 0.230
6URZ Barrier-to-autointegration factor soaked in methanol: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-24 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–89（89 aa）
链 B 1–89（89 aa）
未记录 EOH ETHANOL × 2 MOH METHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277.15 K；80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.65 Å R-free 0.201
6US0 Barrier-to-autointegration factor soaked in R,S,R-bisfuranol (RSR): 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-24 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–89（89 aa）
链 B 1–89（89 aa）
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277.15 K；80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.65 Å R-free 0.201
6US1 Barrier-to-autointegration factor soaked in isobutanol: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-24 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–89（89 aa）
链 B 1–89（89 aa）
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277.15 K；80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.65 Å R-free 0.199
6US7 Barrier-to-autointegration factor soaked in TMAO: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-24 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–89（89 aa）
链 B 1–89（89 aa）
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277.15 K；80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.65 Å R-free 0.198
6USB Barrier-to-autointegration factor soaked in urea: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-25 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–89（89 aa）
链 B 1–89（89 aa）
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277.15 K；80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.68 Å R-free 0.210
6USD Barrier-to-autointegration factor soaked in ethanol: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-25 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–89（89 aa）
链 B 1–89（89 aa）
未记录 EOH ETHANOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277.15 K；80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.65 Å R-free 0.202
6USI Barrier-to-autointegration factor soaked in 1,6-hexanediol: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-26 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–89（89 aa）
链 B 1–89（89 aa）
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277.15 K；80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.65 Å R-free 0.208
7ABM X-ray structure of phosphorylated Barrier-to-autointegration factor (BAF) 提交 2020-09-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 3–88（86 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CS CESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；pBAF was crystallized by the hanging drop method against 0.2 M sodium fluoride, 20% w/v PEG 3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
7NDY Di-phosphorylated Barrier-to-Autointegration Factor (BAF) in complex with LEM domain of Emerin 提交 2021-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 2–89（88 aa）
链 B 2–89（88 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；Hepes Sodium salt 0.1 M pH 7.5 PEG 600 25% W/V
分辨率 1.44 Å R-free 0.225
7Z21 BAF A12T bound to the lamin A/C Ig-fold domain 提交 2022-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 2–89（88 aa）
链 C 2–89（88 aa）
突变：A12T 突变：A12T CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；3 M ammonium sulfate 0.1 M bicine pH 9
分辨率 1.63 Å R-free 0.300
7Z21 BAF A12T bound to the lamin A/C Ig-fold domain 提交 2022-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 2–89（88 aa）
链 D 2–89（88 aa）
突变：A12T 突变：A12T CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；3 M ammonium sulfate 0.1 M bicine pH 9
分辨率 1.63 Å R-free 0.300
9J8M Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (High mobility complex) 提交 2024-08-21 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 K 1–89（89 aa）
链 L 1–89（89 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.82 Å
9J8N Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (Low mobility complex) 提交 2024-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：32-meric
链 K 1–89（89 aa）
链 L 1–89（89 aa）
链 N 1–89（89 aa）
链 O 1–89（89 aa）
链 k 1–89（89 aa）
链 l 1–89（89 aa）
链 n 1–89（89 aa）
链 o 1–89（89 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.14 Å
9J8O Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-H1-nucleosome complex 提交 2024-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：28-meric
链 K 1–89（89 aa）
链 L 1–89（89 aa）
链 k 1–89（89 aa）
链 l 1–89（89 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.05 Å

共 27 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BAF_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–89； UniProt 1–89 作者链 B； PDB构建体 1–89； UniProt 1–89

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1qck

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1qck
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1qck
沉积日期 deposition_date1999-05-06
结构标题 titleSOLUTION STRUCTURE OF HUMAN BARRIER-TO-AUTOINTEGRATION FACTOR BAF, NMR, REGULARIZED MEAN STRUCTURE PLUS 20 INDIVIDUAL SIMULATED ANNEALING STRUCTURES
关键词 keywordsDNA-BINDING PROTEIN, INTEGRATION, AIDS, RETROVIRUSES, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier17.04 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron16.49 Å
零角强度 I(0) i02466070000.00
分子量 molecular_weight422420.0 kDa
排除体积 excluded_volume528190 ų
包络体积 envelope_volume38749 ų
水化壳体积 shell_volume18021 ų
包络直径 envelope_diameter60.4 Å
壳层 Rg shell_rg24.19 Å
包络 Rg envelope_rg18.36 Å
形状 Rg shape_rg16.43 Å
总 Rg total_rg16.78 Å
总原子数 total_atoms59004
残基数 n_residues3737
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax51.1 Å
Rg (实空间) rg_real16.98 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.24 Å
I(0) (实空间) i0_real2.4660e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.7040e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal16.99 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal2466000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8988
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary20.2 Å
偏度 Skewness skewness0.212
峰度 Kurtosis kurtosis-0.488
角度范围 angular_range— – 0.4650 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha759500.0000
实空间数据点数 n_real_points77
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.956; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.813
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1qcka_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.60 — SAM domain-like
超家族 Superfamily superfamilya.60.5 — Barrier-to-autointegration factor, BAF
家族 Family familya.60.5.1 — Barrier-to-autointegration factor, BAF
结构域编号 domain_idd1qckb_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.60 — SAM domain-like
超家族 Superfamily superfamilya.60.5 — Barrier-to-autointegration factor, BAF
家族 Family familya.60.5.1 — Barrier-to-autointegration factor, BAF

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id1qckA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology150 — DNA polymerase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — Barrier-to-autointegration factor, BAF
结构域编号 domain_id1qckB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology150 — DNA polymerase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — Barrier-to-autointegration factor, BAF
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8. 引用文献 (2)

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9. 文件与曲线 (10)