SAXSdb — 1qls

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

S100C PROTEIN

SUS SCROFA

UniProt P31950

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–99	未记录	ANNEXIN I × 2 （P04083） CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；20 MG/ML PROTEIN WERE CRYSTALLIZED BY VAPOR DIFFUSION AGAINST 10% PEG 4000, 20% PEG 4000, 10% 2-PROPANOL, 100MM HEPES, PH=8.5, pH 8.50	分辨率 2.30 Å R-free 0.268

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据

UniProt名称	S111_PIG
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99

ANNEXIN I

物种未注明

UniProt P04083

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–11	片段：N-TERMINAL 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	S100C PROTEIN × 2 （P31950） CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；20 MG/ML PROTEIN WERE CRYSTALLIZED BY VAPOR DIFFUSION AGAINST 10% PEG 4000, 20% PEG 4000, 10% 2-PROPANOL, 100MM HEPES, PH=8.5, pH 8.50	分辨率 2.30 Å R-free 0.268

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1QLS	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AIN CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN ANNEXIN I AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1992-06-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 32–345（314 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å
1BO9 NMR SOLUTION STRUCTURE OF DOMAIN 1 OF HUMAN ANNEXIN I 提交 1998-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 41–113（73 aa）片段：DOMAIN 1	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；300 K；压力 1	分辨率未提供
5VFW An engineered cyclic peptide alleviates symptoms of inflammation in a murine model of inflammatory bowel disease 提交 2017-04-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–26（25 aa）片段：N terminal Annexin I (2-26)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；290 K；离子强度（mmCIF原始值）1；压力 1 NMR样品组成 0.2 mM Ac 2-26, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
9NP0 Structure of human annexin A1 in complex with 2C1 Fab 提交 2025-03-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–346（346 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.32 Å

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ANX1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 2–12； UniProt 1–11

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1qls
沉积日期 deposition_date	1999-09-15
结构标题 title	S100C (S100A11),OR CALGIZZARIN, IN COMPLEX WITH ANNEXIN I N-TERMINUS
关键词 keywords	;METAL-BINDING PROTEIN/INHIBITOR, S100 FAMILY, EF-HAND PROTEIN, COMPLEX (LIGAND-ANNEXIN), LIGAND OF ANNEXIN II, CALCIUM/PHOSPHOLIPID BINDING PROTEIN, METAL-BINDING PROTEIN-INHIBITOR complex ;; METAL-BINDING PROTEIN/INHIBITOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	15.85 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	14.64 Å
零角强度 I(0) i0	2952450.00
分子量 molecular_weight	12066.0 kDa
排除体积 excluded_volume	15129 Å³
包络体积 envelope_volume	17636 Å³
水化壳体积 shell_volume	10829 Å³
包络直径 envelope_diameter	53.6 Å
壳层 Rg shell_rg	19.49 Å
包络 Rg envelope_rg	14.91 Å
形状 Rg shape_rg	14.63 Å
总 Rg total_rg	15.71 Å
总原子数 total_atoms	842
残基数 n_residues	106
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	59.4 Å
Rg (实空间) rg_real	15.81 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.58 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.9520e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.0090e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	15.82 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	2952000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8336
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	20.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.203
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.246
角度范围 angular_range	— – 0.5000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	219300.0000
实空间数据点数 n_real_points	80
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.647; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.890; Smooth: 1.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	S100C PROTEIN
分子量 formula_weight	11194.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	870

MAKRPTETERCIESLIAIFQKHAGRDGNNTKISKTEFLIFMNTELAAFTQNQKDPGVLDRMMKKLDLDSDGQLDFQEFLNLIGGLAIACHDSFIKSTQK

来源 Source

来源生物 organism	SUS SCROFA
通用名 common_name	PIG
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9823
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ANNEXIN I
分子量 formula_weight	1278.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

XAMVSAFLKQAW

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	23

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d1qlsa_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamily	a.39.1 — EF-hand
家族 Family family	a.39.1.2 — S100 proteins

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	1qlsA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	77.510 Å
晶胞边长 b length_b	77.510 Å
晶胞边长 c length_c	111.610 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 61 2 2
空间群编号 int_tables_number	178
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.300 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2140
R_free r_free	0.2680

fit	/app/data/saxs_computation/ql/1qls/1qls.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ql/1qls/1qls.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ql/1qls/1qls.dat

S100C (S100A11),OR CALGIZZARIN, IN COMPLEX WITH ANNEXIN I N-TERMINUS

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

S100C PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ANNEXIN I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)