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1qn9

Crystal structure of the C(-29) Adenovirus major late promoter TATA box variant bound to wild-type TBP (Arabidopsis thaliana TBP isoform 2). TATA element recognition by the TATA box-binding protein has been conserved throughout evolution.

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR TFIID-1

ARABIDOPSIS THALIANA

UniProt P28147

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 单体 蛋白 1 DNA 2 ;DNA (5'-D(*GP*CP*TP*AP*CP*AP*AP*AP*AP*GP*GP*GP*CP*A)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*TP*GP*CP*CP*CP*TP*TP*TP*TP*GP*TP*AP*GP*C)-3') ; × 1 water × 3 与全部聚合物一致
2 蛋白–DNA 单体 蛋白 1 DNA 2 ;DNA (5'-D(*GP*CP*TP*AP*CP*AP*AP*AP*AP*GP*GP*GP*CP*A)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*TP*GP*CP*CP*CP*TP*TP*TP*TP*GP*TP*AP*GP*C)-3') ; × 1 water × 3 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1vok 1vok 9ow8 9ow8 9ow8 9ow8 9owi 9owi 9owi 9owi

共 10 个 assembly

同源二聚体
1vok 1vok

共 2 个 assembly

同源四聚体
1vok 1vok

共 2 个 assembly

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1qn3 1qn3 1qn4 1qn4 1qn5 1qn5 1qn6 1qn6 1qn7 1qn7 1qn8 1qn8

共 49 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TF21_ARATH
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–200； UniProt 1–200 作者链 B； PDB构建体 1–200； UniProt 1–200

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1qn9
沉积日期 deposition_date1999-10-14
结构标题 titleCrystal structure of the C(-29) Adenovirus major late promoter TATA box variant bound to wild-type TBP (Arabidopsis thaliana TBP isoform 2). TATA element recognition by the TATA box-binding protein has been conserved throughout evolution.
关键词 keywords;TATA BOX-BINDING PROTEIN (TBP), ADENOVIRUS MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) TATA BOX, TBP-TATA ELEMENT COMPLEXES, C (- 29) TATA BOX VARIANT ;; TATA BOX-BINDING PROTEIN (TBP)
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1qn9__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1qn9__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1qn9__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）19.83 Å
Rg（电子密度）19.60 Å
总 Rg20.31 Å
原子数2007
残基数211
排除体积34589 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1qn9__assembly_1__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1qn9__assembly_2__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1qn9a1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.129 — TBP-like
超家族 Superfamily superfamilyd.129.1 — TATA-box binding protein-like
家族 Family familyd.129.1.1 — TATA-box binding protein (TBP), C-terminal domain
结构域编号 domain_idd1qn9a2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.129 — TBP-like
超家族 Superfamily superfamilyd.129.1 — TATA-box binding protein-like
家族 Family familyd.129.1.1 — TATA-box binding protein (TBP), C-terminal domain
结构域编号 domain_idd1qn9b1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.129 — TBP-like
超家族 Superfamily superfamilyd.129.1 — TATA-box binding protein-like
家族 Family familyd.129.1.1 — TATA-box binding protein (TBP), C-terminal domain
结构域编号 domain_idd1qn9b2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.129 — TBP-like
超家族 Superfamily superfamilyd.129.1 — TATA-box binding protein-like
家族 Family familyd.129.1.1 — TATA-box binding protein (TBP), C-terminal domain

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1qn9A01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology310 — TATA-Binding Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TATA-Binding Protein
结构域编号 domain_id1qn9A02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology310 — TATA-Binding Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TATA-Binding Protein
结构域编号 domain_id1qn9B01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology310 — TATA-Binding Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TATA-Binding Protein
结构域编号 domain_id1qn9B02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology310 — TATA-Binding Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TATA-Binding Protein
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7. 引用文献 (1)