1qp9

STRUCTURE OF HAP1-PC7 COMPLEXED TO THE UAS OF CYC7

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CYP1(HAP1-PC7) ACTIVATORY PROTEIN

Saccharomyces cerevisiae

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	同源多聚体	蛋白 2 DNA 2	;DNA (5'-D(APCPGPCPTPAPTPTPAPTPCPGPCPTPAPTPTPAPGPT)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(APCPTPAPAPTPAPGPCPGPAPTPAPAPTPAPGPCPGPT)-3') ; × 1 ZINC ION × 5 water × 4	与全部聚合物一致
2	蛋白–DNA	同源多聚体	蛋白 2 DNA 2	;DNA (5'-D(APCPGPCPTPAPTPTPAPTPCPGPCPTPAPTPTPAPGPT)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(APCPTPAPAPTPAPGPCPGPAPTPAPAPTPAPGPCPGPT)-3') ; × 1 ZINC ION × 4 water × 4	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CYP1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–76； UniProt 55–130 作者链 B； PDB构建体 1–76； UniProt 55–130 作者链 C； PDB构建体 1–76； UniProt 55–130 作者链 D； PDB构建体 1–76； UniProt 55–130

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1qp9
沉积日期 deposition_date	1999-06-01
结构标题 title	STRUCTURE OF HAP1-PC7 COMPLEXED TO THE UAS OF CYC7
关键词 keywords	ZINC BINUCLEAR CLUSTER, COILED-COIL, HEPTAD REPEAT, TRANSCRIPTION-DNA COMPLEX; TRANSCRIPTION/DNA
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1qp9__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1qp9__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1qp9__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	22.41 Å
Rg（电子密度）	22.25 Å
总 Rg	22.73 Å
原子数	1962
残基数	183
排除体积	32724 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1qp9__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1qp9__assembly_2__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(APCPGPCPTPAPTPTPAPTPCPGPCPTPAPTPTPAPGPT)-3') ;
分子量 formula_weight	6099.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	E,G
原子数 atom_count	4114

ACGCTATTATCGCTATTAGT

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(APCPTPAPAPTPAPGPCPGPAPTPAPAPTPAPGPCPGPT)-3') ;
分子量 formula_weight	6166.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	F,H

ACTAATAGCGATAATAGCGT

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	CYP1(HAP1-PC7) ACTIVATORY PROTEIN
分子量 formula_weight	9087.8 kDa
突变 mutation	S63G
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D

RKRNRIPLGCTICRKRKVKCDKLRPHCQQCTKTGVAHLCHYMEQTWAEEAEKELLKDNELKKLRERVKSLEKTLSK

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	9

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	96

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_id	d1qp9a1
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.38 — Zn2/Cys6 DNA-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	g.38.1 — Zn2/Cys6 DNA-binding domain
家族 Family family	g.38.1.1 — Zn2/Cys6 DNA-binding domain

结构域编号 domain_id	d1qp9a2
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.1.3 — Leucine zipper domain
家族 Family family	h.1.3.1 — Leucine zipper domain

结构域编号 domain_id	d1qp9b1
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.38 — Zn2/Cys6 DNA-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	g.38.1 — Zn2/Cys6 DNA-binding domain
家族 Family family	g.38.1.1 — Zn2/Cys6 DNA-binding domain

结构域编号 domain_id	d1qp9b2
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.1.3 — Leucine zipper domain
家族 Family family	h.1.3.1 — Leucine zipper domain

结构域编号 domain_id	d1qp9c1
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.38 — Zn2/Cys6 DNA-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	g.38.1 — Zn2/Cys6 DNA-binding domain
家族 Family family	g.38.1.1 — Zn2/Cys6 DNA-binding domain

结构域编号 domain_id	d1qp9c2
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.1.3 — Leucine zipper domain
家族 Family family	h.1.3.1 — Leucine zipper domain

结构域编号 domain_id	d1qp9d1
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.38 — Zn2/Cys6 DNA-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	g.38.1 — Zn2/Cys6 DNA-binding domain
家族 Family family	g.38.1.1 — Zn2/Cys6 DNA-binding domain

结构域编号 domain_id	d1qp9d2
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.1.3 — Leucine zipper domain
家族 Family family	h.1.3.1 — Leucine zipper domain

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	1qp9A01
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	240 — CD2-Gal4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Zn(2)-C6 fungal-type DNA-binding domain

结构域编号 domain_id	1qp9A02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	1qp9B01
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	240 — CD2-Gal4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Zn(2)-C6 fungal-type DNA-binding domain

结构域编号 domain_id	1qp9B02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	1qp9C01
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	240 — CD2-Gal4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Zn(2)-C6 fungal-type DNA-binding domain

结构域编号 domain_id	1qp9C02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	1qp9D01
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	240 — CD2-Gal4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Zn(2)-C6 fungal-type DNA-binding domain

结构域编号 domain_id	1qp9D02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

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晶胞边长 a length_a	85.900 Å
晶胞边长 b length_b	90.900 Å
晶胞边长 c length_c	96.500 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	8.000 Å
R 因子 r_factor	0.2550
R_work r_work	0.2550
R_free r_free	0.2940

STRUCTURE OF HAP1-PC7 COMPLEXED TO THE UAS OF CYC7

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CYP1(HAP1-PC7) ACTIVATORY PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1qp9__assembly_2__model_1

1qp9__assembly_2__model_1 | I(q)

1qp9__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (4)

STRUCTURE OF HAP1-PC7 COMPLEXED TO THE UAS OF CYC7

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CYP1(HAP1-PC7) ACTIVATORY PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1qp9__assembly_2__model_1

1qp9__assembly_2__model_1 | I(q)

1qp9__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (4)