Thermus aquaticus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 异源复合物 | 蛋白 3 DNA 2 | 27-MER × 1 27-MER × 1 Repressor protein CI × 2 （P03034） CALCIUM ION × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 water × 5 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | Q9EZJ8_THEAQ |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 3 |
| 链与序列区间 | 作者链 H； PDB构建体 1–73； UniProt 366–438 |
Enterobacteria phage lambda
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 异源复合物 | 蛋白 3 DNA 2 | 27-MER × 1 27-MER × 1 sigma factor SigA × 1 （Q9EZJ8） CALCIUM ION × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 water × 5 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | RPC1_LAMBD |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 4 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–92； UniProt 1–91 作者链 B； PDB构建体 1–92； UniProt 1–91 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
| 条目编号 entry_id | 1rio |
| 沉积日期 deposition_date | 2003-11-17 |
| 结构标题 title | Structure of bacteriophage lambda cI-NTD in complex with sigma-region4 of Thermus aquaticus bound to DNA |
| 关键词 keywords | HELIX-TURN-HELIX, TRANSCRIPTION ACTIVATION, transcription-DNA COMPLEX; transcription/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 26.11 Å |
| Rg（电子密度） | 25.24 Å |
| 总 Rg | 25.75 Å |
| 原子数 | 3110 |
| 残基数 | 302 |
| 排除体积 | 51967 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d1rioa1 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.35 — lambda repressor-like DNA-binding domains |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.35.1 — lambda repressor-like DNA-binding domains |
| 家族 Family family | a.35.1.2 — Phage repressors |
| 结构域编号 domain_id | d1rioa2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d1riob1 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.35 — lambda repressor-like DNA-binding domains |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.35.1 — lambda repressor-like DNA-binding domains |
| 家族 Family family | a.35.1.2 — Phage repressors |
| 结构域编号 domain_id | d1riob2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d1rioh_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.4.13 — Sigma3 and sigma4 domains of RNA polymerase sigma factors |
| 家族 Family family | a.4.13.2 — Sigma4 domain |
| 结构域编号 domain_id | 1rioA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 260 — 434 Repressor (Amino-terminal Domain) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 40 — lambda repressor-like DNA-binding domains |
| 结构域编号 domain_id | 1rioB00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 260 — 434 Repressor (Amino-terminal Domain) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 40 — lambda repressor-like DNA-binding domains |
| 结构域编号 domain_id | 1rioH00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 10 — Arc Repressor Mutant, subunit A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain |