1s9r

CRYSTAL STRUCTURE OF ARGININE DEIMINASE COVALENTLY LINKED WITH A REACTION INTERMEDIATE

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Arginine deiminase

物种未注明

UniProt P23793

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 ARGININE × 2 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 UNKNOWN ATOM OR ION × 9 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ARCA_MYCAR
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–410; UniProt 0–409 作者链 B; PDB构建体 1–410; UniProt 0–409

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1s9r
沉积日期 deposition_date2004-02-05
结构标题 titleCRYSTAL STRUCTURE OF ARGININE DEIMINASE COVALENTLY LINKED WITH A REACTION INTERMEDIATE
关键词 keywordsDEIMINASE, HYDROLASE, 5-FOLD PSEUDO-SYMMETRIC DOMAIN, 5-HELIX BUNDLE DOMAIN, RACTION INTERMEDIATE; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1s9r__assembly_1__model_1 dimeric (2) 排除 — —
排除原因: 来源记录无法明确判定原子或离子的元素,因此不能可靠计算。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1s9ra_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.126 — Pentein, beta/alpha-propeller
超家族 Superfamily superfamilyd.126.1 — Pentein
家族 Family familyd.126.1.4 — Arginine deiminase
结构域编号 domain_idd1s9rb_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.126 — Pentein, beta/alpha-propeller
超家族 Superfamily superfamilyd.126.1 — Pentein
家族 Family familyd.126.1.4 — Arginine deiminase

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1s9rA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture75 — 5-stranded Propeller
拓扑 Topology topology10 — L-arginine/glycine Amidinotransferase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — L-arginine/glycine Amidinotransferase; Chain A
结构域编号 domain_id1s9rA02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology3930 — Pentein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Arginine deiminase
结构域编号 domain_id1s9rB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture75 — 5-stranded Propeller
拓扑 Topology topology10 — L-arginine/glycine Amidinotransferase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — L-arginine/glycine Amidinotransferase; Chain A
结构域编号 domain_id1s9rB02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology3930 — Pentein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Arginine deiminase
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7. 引用文献 (1)