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1sxq

BGT in complex with a 13mer DNA containing a central C:G base pair and UDP

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA beta-glucosyltransferase

Enterobacteria phage T4

UniProt P04547

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 单体 蛋白 1 DNA 2 5'-D(*AP*AP*AP*AP*AP*AP*GP*TP*TP*TP*TP*TP*T)-3' × 1 5'-D(*AP*AP*AP*AP*AP*AP*CP*TP*TP*TP*TP*TP*T)-3' × 1 URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 water × 3 与全部聚合物一致
2 蛋白–DNA 单体 蛋白 1 DNA 2 5'-D(*AP*AP*AP*AP*AP*AP*GP*TP*TP*TP*TP*TP*T)-3' × 1 5'-D(*AP*AP*AP*AP*AP*AP*CP*TP*TP*TP*TP*TP*T)-3' × 1 URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 water × 3 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1bgt 1bgu 1c3j 1j39 1jej 1jg6 1jg7 1jiu 1jiv 1jix 1nvk 1nzd

共 16 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1ixy 1ixy 1m5r 1m5r 1sxp 1sxq 1sxq

共 7 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GSTB_BPT4
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 B； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1sxq
沉积日期 deposition_date2004-03-31
结构标题 titleBGT in complex with a 13mer DNA containing a central C:G base pair and UDP
关键词 keywordsflipped-out base, TRANSFERASE-DNA COMPLEX; TRANSFERASE/DNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1sxq__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1sxq__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1sxq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）24.40 Å
Rg（电子密度）23.05 Å
总 Rg23.92 Å
原子数3422
残基数377
排除体积59836 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1sxq__assembly_1__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1sxq__assembly_2__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1sxqa_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.87 — UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase
超家族 Superfamily superfamilyc.87.1 — UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase
家族 Family familyc.87.1.1 — beta-Glucosyltransferase (DNA-modifying)
结构域编号 domain_idd1sxqb_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.87 — UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase
超家族 Superfamily superfamilyc.87.1 — UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase
家族 Family familyc.87.1.1 — beta-Glucosyltransferase (DNA-modifying)

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1sxqA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily2000 — Glycogen Phosphorylase B;
结构域编号 domain_id1sxqA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily2000 — Glycogen Phosphorylase B;
结构域编号 domain_id1sxqB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily2000 — Glycogen Phosphorylase B;
结构域编号 domain_id1sxqB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily2000 — Glycogen Phosphorylase B;
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7. 引用文献 (1)