HIV-1 TRANSACTIVATOR PROTEIN
Human immunodeficiency virus 1
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 1–86 | 突变：THR 40 LYS | 无其他共同聚合物 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取环境条件 | 分辨率未提供 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 1TIV | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1TAC HIV-1 TAT CYS-, NMR, 10 STRUCTURES 提交 1998-03-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
2–86（85 aa）
|
突变：M1L, C22S, C25A, C27A, C30S, C31A, C34S, C37A | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.85 M；压力 10E+5 PA
NMR样品组成
H2O/D2O (9:1)
|
分辨率未提供 |
| 1TBC HIV-1 TAT, NMR, 10 STRUCTURES 提交 1998-03-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
2–86（85 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.85 M；压力 10E+5 PA
NMR样品组成
H2O/D2O (9:1)
|
分辨率未提供 |
| 2BGN HIV-1 Tat protein derived N-terminal nonapeptide Trp2-Tat(1-9) bound to the active site of Dipeptidyl peptidase IV (CD26) 提交 2005-01-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 W
1–9（9 aa）
片段：HIV-1 TAT PROTEIN DERIVED N-TERMINAL NONAPEPTIDE, RESIDUES 1-9
链 X
1–9（9 aa）
片段：HIV-1 TAT PROTEIN DERIVED N-TERMINAL NONAPEPTIDE, RESIDUES 1-9
|
突变：YES 突变：YES | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.15 Å R-free 0.247 |
| 2BGN HIV-1 Tat protein derived N-terminal nonapeptide Trp2-Tat(1-9) bound to the active site of Dipeptidyl peptidase IV (CD26) 提交 2005-01-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 Y
1–9（9 aa）
片段：HIV-1 TAT PROTEIN DERIVED N-TERMINAL NONAPEPTIDE, RESIDUES 1-9
链 Z
1–9（9 aa）
片段：HIV-1 TAT PROTEIN DERIVED N-TERMINAL NONAPEPTIDE, RESIDUES 1-9
|
突变：YES 突变：YES | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.15 Å R-free 0.247 |
| 2BGR Crystal structure of HIV-1 Tat derived nonapeptides Tat(1-9) bound to the active site of Dipeptidyl peptidase IV (CD26) 提交 2005-01-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 Y
1–9（9 aa）
链 Z
1–9（9 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.203 |
| 8CCW Crystal structure of human Sirt3 in complex with an acetylated HIV1 Tat-46-54 substrate peptide 提交 2023-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
46–54（9 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；10 mg/ml human Sirt3-(118-399) in 20 mM Tris/HCl, pH 8.0, 150 mM NaCl, 5% (v/v) glycerol, 1 mM TCEP were incubated with 2 mM ac-Tat-46-54 for 60 min at 293.15 K. The complex was crystallized using the sitting-drop vapor-diffusion method at 293.15 K with 100 mM MES, pH 6.0, 30% (w/v) PEG 200, 5% (w/v) PEG 3000 as reservoir solution.
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.209 |
| 8CCZ Crystal structure of human Sirt3 in complex with an inhibiting HIV1 Tat-37-59 peptide 提交 2023-01-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
37–59（23 aa）
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突变：C37A | ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；10 mg/ml human Sirt3-(118-399) in 20 mM Tris/HCl, pH 8.0, 150 mM NaCl, 5% (v/v) glycerol, 1 mM TCEP were incubated with 2 mM Tat-37-59 in 10% (v/v) DMSO for 60 min at 293.15 K. The complex was crystallized using the sitting-drop vapor-diffusion method at 293.15 K with 100 mM CHES, pH 9.0, 20% (w/v) PEG 8000 as reservoir solution.
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.276 |
| 8CCZ Crystal structure of human Sirt3 in complex with an inhibiting HIV1 Tat-37-59 peptide 提交 2023-01-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
37–59（23 aa）
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突变：C37A | ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；10 mg/ml human Sirt3-(118-399) in 20 mM Tris/HCl, pH 8.0, 150 mM NaCl, 5% (v/v) glycerol, 1 mM TCEP were incubated with 2 mM Tat-37-59 in 10% (v/v) DMSO for 60 min at 293.15 K. The complex was crystallized using the sitting-drop vapor-diffusion method at 293.15 K with 100 mM CHES, pH 9.0, 20% (w/v) PEG 8000 as reservoir solution.
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分辨率 1.95 Å R-free 0.276 |
共 6 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | TAT_HV1Z2 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–86； UniProt 1–86 |
