SAXSdb — 1tpn

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TISSUE-TYPE PLASMINOGEN ACTIVATOR

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 36–85	未记录	无其他共同聚合物	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1TPN	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1A5H CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN TWO-CHAIN TISSUE PLASMINOGEN ACTIVATOR COMPLEX OF A BIS-BENZAMIDINE 提交 1998-02-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 311–562（252 aa）片段：LIGHT CHAIN, CATALYTIC DOMAIN 链 C 298–304（7 aa）片段：HEAVY CHAIN FRAGMENT, CATALYTIC DOMAIN	未记录	BBA 2,7-BIS-(4-AMIDINOBENZYLIDENE)-CYCLOHEPTAN-1-ONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.5；pH 4.5	分辨率 2.90 Å
1A5H CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN TWO-CHAIN TISSUE PLASMINOGEN ACTIVATOR COMPLEX OF A BIS-BENZAMIDINE 提交 1998-02-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 311–562（252 aa）片段：LIGHT CHAIN, CATALYTIC DOMAIN 链 D 298–304（7 aa）片段：HEAVY CHAIN FRAGMENT, CATALYTIC DOMAIN	未记录	BBA 2,7-BIS-(4-AMIDINOBENZYLIDENE)-CYCLOHEPTAN-1-ONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.5；pH 4.5	分辨率 2.90 Å
1BDA CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN SINGLE CHAIN TISSUE PLASMINOGEN ACTIVATOR IN COMPLEX WITH DANSYL-EGR-CMK (DANSYL-GLU-GLY-ARG CHLOROMETHYL KETONE) 提交 1998-05-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 298–562（265 aa）片段：UNP residues 298-562	突变：DELETION MUTANT	2Z0 N-{[5-(dimethylamino)naphthalen-2-yl]sulfonyl}-L-alpha-glutamyl-N-[(1S)-4-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-(chloroacetyl) butyl]glycinamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.2；pH 8.2	分辨率 3.35 Å
1BDA CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN SINGLE CHAIN TISSUE PLASMINOGEN ACTIVATOR IN COMPLEX WITH DANSYL-EGR-CMK (DANSYL-GLU-GLY-ARG CHLOROMETHYL KETONE) 提交 1998-05-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 298–562（265 aa）片段：UNP residues 298-562	突变：DELETION MUTANT	2Z0 N-{[5-(dimethylamino)naphthalen-2-yl]sulfonyl}-L-alpha-glutamyl-N-[(1S)-4-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-(chloroacetyl) butyl]glycinamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.2；pH 8.2	分辨率 3.35 Å
1PK2 SOLUTION STRUCTURE OF THE TISSUE-TYPE PLASMINOGEN ACTIVATOR KRINGLE 2 DOMAIN COMPLEXED TO 6-AMINOHEXANOIC ACID AN ANTIFIBRINOLYTIC DRUG 提交 1991-09-16	构建体不同配体/离子不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 209–298（90 aa）	未记录	ACA 6-AMINOHEXANOIC ACID × 1	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1PML KRINGLE-KRINGLE INTERACTIONS IN MULTIMER KRINGLE STRUCTURES 提交 1994-04-25	构建体不同配体/离子不同实验方法不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 213–298（86 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.38 Å
1PML KRINGLE-KRINGLE INTERACTIONS IN MULTIMER KRINGLE STRUCTURES 提交 1994-04-25	构建体不同配体/离子不同实验方法不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 213–298（86 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.38 Å
1PML KRINGLE-KRINGLE INTERACTIONS IN MULTIMER KRINGLE STRUCTURES 提交 1994-04-25	构建体不同配体/离子不同实验方法不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 213–298（86 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.38 Å
1RTF COMPLEX OF BENZAMIDINE WITH THE CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN TWO CHAIN TISSUE PLASMINOGEN ACTIVATOR [(TC)-T-PA] 提交 1995-11-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 311–562（252 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1 BEN BENZAMIDINE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.30 Å R-free 0.265
1TPG F1-G MODULE PAIR RESIDUES 1-91 (C83S) OF TISSUE-TYPE PLASMINOGEN ACTIVATOR (T-PA) (NMR, 298K, PH2.95, REPRESENTATIVE STRUCTURE) 提交 1995-06-14	构建体不同突变/修饰不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 36–126（91 aa）	突变：C83S	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1TPK CRYSTAL STRUCTURE OF THE KRINGLE-2 DOMAIN OF TISSUE PLASMINOGEN ACTIVATOR AT 2.4-ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1991-09-24	构建体不同配体/离子不同实验方法不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 211–298（88 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.40 Å
1TPK CRYSTAL STRUCTURE OF THE KRINGLE-2 DOMAIN OF TISSUE PLASMINOGEN ACTIVATOR AT 2.4-ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1991-09-24	构建体不同配体/离子不同实验方法不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 211–298（88 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.40 Å
1TPK CRYSTAL STRUCTURE OF THE KRINGLE-2 DOMAIN OF TISSUE PLASMINOGEN ACTIVATOR AT 2.4-ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1991-09-24	构建体不同配体/离子不同实验方法不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 211–298（88 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.40 Å
1TPM SOLUTION STRUCTURE OF THE FIBRIN BINDING FINGER DOMAIN OF TISSUE-TYPE PLASMINOGEN ACTIVATOR DETERMINED BY 1H NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE 提交 1993-05-26	当前字段一致	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 36–85（50 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
5BRR Michaelis complex of tPA-S195A:PAI-1 提交 2015-06-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 311–562（252 aa）片段：UNP residues 311-562	突变：C120A, N173Q, S203A	GOL GLYCEROL × 4 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298.15 K；8% PEG 6000, 0.1 M Tris-HCl	分辨率 3.16 Å R-free 0.276
5ZLZ Structure of tPA and PAI-1 提交 2018-03-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 311–561（251 aa）	突变：C430A, F458E, N483Q, S513A	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；4-8% PEG 3350, 20 mM bis-Tris-HCl pH 7.0	分辨率 3.58 Å R-free 0.312

共 10 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TPA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–50； UniProt 36–85

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1tpn
沉积日期 deposition_date	1993-05-26
结构标题 title	SOLUTION STRUCTURE OF THE FIBRIN BINDING FINGER DOMAIN OF TISSUE-TYPE PLASMINOGEN ACTIVATOR DETERMINED BY 1H NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE
关键词 keywords	PLASMINOGEN ACTIVATOR; PLASMINOGEN ACTIVATOR
实验方法 method	SOLUTION NMR

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	11.70 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	12.11 Å
零角强度 I(0) i0	458786000.00
分子量 molecular_weight	168110.0 kDa
排除体积 excluded_volume	205110 Å³
包络体积 envelope_volume	16396 Å³
水化壳体积 shell_volume	9973 Å³
包络直径 envelope_diameter	52.8 Å
壳层 Rg shell_rg	19.63 Å
包络 Rg envelope_rg	15.65 Å
形状 Rg shape_rg	12.08 Å
总 Rg total_rg	12.34 Å
总原子数 total_atoms	23016
残基数 n_residues	1400
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	46.8 Å
Rg (实空间) rg_real	11.85 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.48 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.5880e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.3200e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	11.84 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	458800000.0000
解质量估计 total_estimate	0.5030
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	11.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.628
峰度 Kurtosis kurtosis	0.164
角度范围 angular_range	— – 0.5000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	72870.0000
实空间数据点数 n_real_points	80
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.496; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.256; Positv: 1.000; Valcen: 0.276; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d1tpna_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.27 — FnI-like domain
超家族 Superfamily superfamily	g.27.1 — FnI-like domain
家族 Family family	g.27.1.1 — Fibronectin type I module

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	1tpnA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Complement Module, domain 1

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

描述 description	TISSUE-TYPE PLASMINOGEN ACTIVATOR
分子量 formula_weight	6008.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	23016

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606

SOLUTION STRUCTURE OF THE FIBRIN BINDING FINGER DOMAIN OF TISSUE-TYPE PLASMINOGEN ACTIVATOR DETERMINED BY 1H NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TISSUE-TYPE PLASMINOGEN ACTIVATOR

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

fit	/app/data/saxs_computation/tp/1tpn/1tpn.fit
pddf	/app/data/pr_computation/tp/1tpn/1tpn.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/tp/1tpn/1tpn.dat