1tqy

The Actinorhodin Ketosynthase/Chain Length Factor

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actinorhodin polyketide putative beta-ketoacyl synthase 1

Streptomyces coelicolor A3(2)

UniProt Q02059

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Actinorhodin polyketide putative beta-ketoacyl synthase 2 × 1 （Q02062） MAGNESIUM ION × 1 ACETYL GROUP × 1 SODIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Actinorhodin polyketide putative beta-ketoacyl synthase 2 × 1 （Q02062） MAGNESIUM ION × 1 ACETYL GROUP × 1 SODIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Actinorhodin polyketide putative beta-ketoacyl synthase 2 × 1 （Q02062） MAGNESIUM ION × 1 ACETYL GROUP × 1 SODIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Actinorhodin polyketide putative beta-ketoacyl synthase 2 × 1 （Q02062） MAGNESIUM ION × 1 ACETYL GROUP × 1 SODIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KASA_STRCO
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–424； UniProt 45–467 作者链 C； PDB构建体 2–424； UniProt 45–467 作者链 E； PDB构建体 2–424； UniProt 45–467 作者链 G； PDB构建体 2–424； UniProt 45–467

Actinorhodin polyketide putative beta-ketoacyl synthase 2

Streptomyces coelicolor A3(2)

UniProt Q02062

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Actinorhodin polyketide putative beta-ketoacyl synthase 1 × 1 （Q02059） MAGNESIUM ION × 1 ACETYL GROUP × 1 SODIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Actinorhodin polyketide putative beta-ketoacyl synthase 1 × 1 （Q02059） MAGNESIUM ION × 1 ACETYL GROUP × 1 SODIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Actinorhodin polyketide putative beta-ketoacyl synthase 1 × 1 （Q02059） MAGNESIUM ION × 1 ACETYL GROUP × 1 SODIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Actinorhodin polyketide putative beta-ketoacyl synthase 1 × 1 （Q02059） MAGNESIUM ION × 1 ACETYL GROUP × 1 SODIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KASB_STRCO
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 10–415； UniProt 2–407 作者链 D； PDB构建体 10–415； UniProt 2–407 作者链 F； PDB构建体 10–415； UniProt 2–407 作者链 H； PDB构建体 10–415； UniProt 2–407

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1tqy
沉积日期 deposition_date	2004-06-18
结构标题 title	The Actinorhodin Ketosynthase/Chain Length Factor
关键词 keywords	alpha-beta-alpha-beta-alpha, heterodimer, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1tqy__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1tqy__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1tqy__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	26.52 Å
Rg（电子密度）	25.32 Å
总 Rg	26.11 Å
原子数	6115
残基数	823
排除体积	107260 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1tqy__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1tqy__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`1tqy__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`1tqy__assembly_4__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Actinorhodin polyketide putative beta-ketoacyl synthase 1
分子量 formula_weight	45113.3 kDa
EC 编号 ec_number	2.3.1.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G
原子数 atom_count	25535

MKRRVVITGVGVRAPGGNGTRQFWELLTSGRTATRRISFFDPSPYRSQVAAEADFDPVAEGFGPRELDRMDRASQFAVACAREAFAASGLDPDTLDPARVGVSLGSAVAAATSLEREYLLLSDSGRDWEVDAAWLSRHMFDYLVPSVMPAEVAWAVGAEGPVTMVSTGCTSGLDSVGNAVRAIEEGSADVMFAGAADTPITPIVVACFDAIRATTARNDDPEHASRPFDGTRDGFVLAEGAAMFVLEDYDSALARGARIHAEISGYATRCNAYHMTGLKADGREMAETIRVALDESRTDATDIDYINAHGSGTRQNDRHETAAYKRALGEHARRTPVSSIKSMVGHSLGAIGSLEIAACVLALEHGVVPPTANLRTSDPECDLDYVPLEARERKLRSVLTVGSGFGGFQSAMVLRDAETAGAAA

来源 Source

来源生物 organism	Streptomyces coelicolor A3(2)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	100226
宿主生物 host_organism	Streptomyces coelicolor A3(2)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Actinorhodin polyketide putative beta-ketoacyl synthase 2
分子量 formula_weight	43590.6 kDa
EC 编号 ec_number	2.3.1.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H

MDYKDDDDKSVLITGVGVVAPNGLGLAPYWSAVLDGRHGLGPVTRFDVSRYPATLAGQIDDFHAPDHIPGRLLPQTDPSTRLALTAADWALQDAKADPESLTDYDMGVVTANACGGFDFTHREFRKLWSEGPKSVSVYESFAWFYAVNTGQISIRHGMRGPSSALVAEQAGGLDALGHARRTIRRGTPLVVSGGVDSALDPWGWVSQIASGRISTATDPDRAYLPFDERAAGYVPGEGGAILVLEDSAAAEARGRHDAYGELAGCASTFDPAPGSGRPAGLERAIRLALNDAGTGPEDVDVVFADGAGVPELDAAEARAIGRVFGREGVPVTVPKTTTGRLYSGGGPLDVVTALMSLREGVIAPTAGVTSVPREYGIDLVLGEPRSTAPRTALVLARGRWGFNSAAVLRRFAPTP

来源 Source

来源生物 organism	Streptomyces coelicolor A3(2)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	100226
宿主生物 host_organism	Streptomyces coelicolor A3(2)

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ACETYL GROUP
分子量 formula_weight	44.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1075

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 32 domains

SCOP 2.08 (16 domains)

结构域编号 domain_id	d1tqya1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.95 — Thiolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.95.1 — Thiolase-like
家族 Family family	c.95.1.1 — Thiolase-related

结构域编号 domain_id	d1tqya2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.95 — Thiolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.95.1 — Thiolase-like
家族 Family family	c.95.1.1 — Thiolase-related

结构域编号 domain_id	d1tqyb1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.95 — Thiolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.95.1 — Thiolase-like
家族 Family family	c.95.1.1 — Thiolase-related

结构域编号 domain_id	d1tqyb2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.95 — Thiolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.95.1 — Thiolase-like
家族 Family family	c.95.1.1 — Thiolase-related

结构域编号 domain_id	d1tqyc1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.95 — Thiolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.95.1 — Thiolase-like
家族 Family family	c.95.1.1 — Thiolase-related

结构域编号 domain_id	d1tqyc2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.95 — Thiolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.95.1 — Thiolase-like
家族 Family family	c.95.1.1 — Thiolase-related

结构域编号 domain_id	d1tqyd1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.95 — Thiolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.95.1 — Thiolase-like
家族 Family family	c.95.1.1 — Thiolase-related

结构域编号 domain_id	d1tqyd2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.95 — Thiolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.95.1 — Thiolase-like
家族 Family family	c.95.1.1 — Thiolase-related

结构域编号 domain_id	d1tqye1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.95 — Thiolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.95.1 — Thiolase-like
家族 Family family	c.95.1.1 — Thiolase-related

结构域编号 domain_id	d1tqye2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.95 — Thiolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.95.1 — Thiolase-like
家族 Family family	c.95.1.1 — Thiolase-related

结构域编号 domain_id	d1tqyf1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.95 — Thiolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.95.1 — Thiolase-like
家族 Family family	c.95.1.1 — Thiolase-related

结构域编号 domain_id	d1tqyf2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.95 — Thiolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.95.1 — Thiolase-like
家族 Family family	c.95.1.1 — Thiolase-related

结构域编号 domain_id	d1tqyg1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.95 — Thiolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.95.1 — Thiolase-like
家族 Family family	c.95.1.1 — Thiolase-related

结构域编号 domain_id	d1tqyg2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.95 — Thiolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.95.1 — Thiolase-like
家族 Family family	c.95.1.1 — Thiolase-related

结构域编号 domain_id	d1tqyh1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.95 — Thiolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.95.1 — Thiolase-like
家族 Family family	c.95.1.1 — Thiolase-related

结构域编号 domain_id	d1tqyh2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.95 — Thiolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.95.1 — Thiolase-like
家族 Family family	c.95.1.1 — Thiolase-related

CATH v4.4 (16 domains)

结构域编号 domain_id	1tqyA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	47 — Peroxisomal Thiolase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Thiolase/Chalcone synthase

结构域编号 domain_id	1tqyA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	47 — Peroxisomal Thiolase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Thiolase/Chalcone synthase

结构域编号 domain_id	1tqyB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	47 — Peroxisomal Thiolase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Thiolase/Chalcone synthase

结构域编号 domain_id	1tqyB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	47 — Peroxisomal Thiolase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Thiolase/Chalcone synthase

结构域编号 domain_id	1tqyC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	47 — Peroxisomal Thiolase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Thiolase/Chalcone synthase

结构域编号 domain_id	1tqyC02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	47 — Peroxisomal Thiolase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Thiolase/Chalcone synthase

结构域编号 domain_id	1tqyD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	47 — Peroxisomal Thiolase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Thiolase/Chalcone synthase

结构域编号 domain_id	1tqyD02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	47 — Peroxisomal Thiolase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Thiolase/Chalcone synthase

结构域编号 domain_id	1tqyE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	47 — Peroxisomal Thiolase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Thiolase/Chalcone synthase

结构域编号 domain_id	1tqyE02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	47 — Peroxisomal Thiolase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Thiolase/Chalcone synthase

结构域编号 domain_id	1tqyF01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	47 — Peroxisomal Thiolase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Thiolase/Chalcone synthase

结构域编号 domain_id	1tqyF02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	47 — Peroxisomal Thiolase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Thiolase/Chalcone synthase

结构域编号 domain_id	1tqyG01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	47 — Peroxisomal Thiolase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Thiolase/Chalcone synthase

结构域编号 domain_id	1tqyG02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	47 — Peroxisomal Thiolase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Thiolase/Chalcone synthase

结构域编号 domain_id	1tqyH01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	47 — Peroxisomal Thiolase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Thiolase/Chalcone synthase

结构域编号 domain_id	1tqyH02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	47 — Peroxisomal Thiolase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Thiolase/Chalcone synthase

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晶胞边长 a length_a	262.700 Å
晶胞边长 b length_b	262.700 Å
晶胞边长 c length_c	224.030 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	36

空间群 space_group	H 3
空间群编号 int_tables_number	146
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.000 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2330
R_free r_free	0.2530

The Actinorhodin Ketosynthase/Chain Length Factor

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actinorhodin polyketide putative beta-ketoacyl synthase 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Actinorhodin polyketide putative beta-ketoacyl synthase 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1tqy__assembly_1__model_1

1tqy__assembly_1__model_1 | I(q)

1tqy__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 32 domains

SCOP 2.08 (16 domains)

CATH v4.4 (16 domains)

7. 引用文献 (1)

The Actinorhodin Ketosynthase/Chain Length Factor

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actinorhodin polyketide putative beta-ketoacyl synthase 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Actinorhodin polyketide putative beta-ketoacyl synthase 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1tqy__assembly_1__model_1

1tqy__assembly_1__model_1 | I(q)

1tqy__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 32 domains

SCOP 2.08 (16 domains)

CATH v4.4 (16 domains)

7. 引用文献 (1)