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1tro

CRYSTAL STRUCTURE OF TRP REPRESSOR OPERATOR COMPLEX AT ATOMIC RESOLUTION

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (TRP REPRESSOR)

物种未注明

UniProt P0A881

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 同源多聚体 蛋白 2 DNA 2 ;DNA (5'-D(*TP*GP*TP*AP*CP*TP*AP*GP*TP*TP*AP*AP*CP*TP*AP*GP*T P*AP*C)-3') ; × 2 TRYPTOPHAN × 2 water × 4 与全部聚合物一致
2 蛋白–DNA 同源多聚体 蛋白 2 DNA 2 ;DNA (5'-D(*TP*GP*TP*AP*CP*TP*AP*GP*TP*TP*AP*AP*CP*TP*AP*GP*T P*AP*C)-3') ; × 2 TRYPTOPHAN × 2 water × 4 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体
1jhg 1mi7 1wrp 1wrs 1wrt 1zt9 1zt9 2oz9 3ssw 3ssx 3wrp 6ejw

共 26 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源四聚体
1zt9 1zt9 1zt9

共 3 个 assembly

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1co0 1rcs 1tro 1tro 1trr 1trr

共 6 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TRPR_ECOLI
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–108； UniProt 0–107 作者链 C； PDB构建体 1–108； UniProt 0–107 作者链 E； PDB构建体 1–108； UniProt 0–107 作者链 G； PDB构建体 1–108； UniProt 0–107

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1tro
沉积日期 deposition_date1992-08-30
结构标题 titleCRYSTAL STRUCTURE OF TRP REPRESSOR OPERATOR COMPLEX AT ATOMIC RESOLUTION
关键词 keywordsPROTEIN-DNA COMPLEX, DOUBLE HELIX, TRANSCRIPTION-DNA COMPLEX; TRANSCRIPTION/DNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1tro__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1tro__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1tro__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）22.01 Å
Rg（电子密度）20.80 Å
总 Rg21.63 Å
原子数2430
残基数241
排除体积40876 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1tro__assembly_1__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1tro__assembly_2__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1troa_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamilya.4.12 — TrpR-like
家族 Family familya.4.12.1 — Trp repressor, TrpR
结构域编号 domain_idd1troc_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamilya.4.12 — TrpR-like
家族 Family familya.4.12.1 — Trp repressor, TrpR
结构域编号 domain_idd1troe_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamilya.4.12 — TrpR-like
家族 Family familya.4.12.1 — Trp repressor, TrpR
结构域编号 domain_idd1trog_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamilya.4.12 — TrpR-like
家族 Family familya.4.12.1 — Trp repressor, TrpR

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1troA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1270 — Trp Operon Repressor; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TrpR-like
结构域编号 domain_id1troC00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1270 — Trp Operon Repressor; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TrpR-like
结构域编号 domain_id1troE00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1270 — Trp Operon Repressor; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TrpR-like
结构域编号 domain_id1troG00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1270 — Trp Operon Repressor; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TrpR-like
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7. 引用文献 (2)