1u0t

Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis NAD kinase

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase

Mycobacterium tuberculosis

UniProt P0A5S6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PPNK_MYCTU
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–307; UniProt 1–307 作者链 B; PDB构建体 1–307; UniProt 1–307

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1u0t
沉积日期 deposition_date2004-07-14
结构标题 titleCrystal structure of Mycobacterium tuberculosis NAD kinase
关键词 keywords;alpha-beta; beta sandwich, Structural Genomics, PSI, Protein Structure Initiative, TB Structural Genomics Consortium, TBSGC, SIGNALING PROTEIN, TRANSFERASE ;; SIGNALING PROTEIN, TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1u0t__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1u0t__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1u0t__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)32.82 Å
Rg(电子密度)31.76 Å
总 Rg32.71 Å
原子数8174
残基数1084
排除体积146230 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1u0t__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1u0ta_
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.52 — NAD kinase/diacylglycerol kinase-like
超家族 Superfamily superfamilye.52.1 — NAD kinase/diacylglycerol kinase-like
家族 Family familye.52.1.1 — NAD kinase-like
结构域编号 domain_idd1u0tb_
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.52 — NAD kinase/diacylglycerol kinase-like
超家族 Superfamily superfamilye.52.1 — NAD kinase/diacylglycerol kinase-like
家族 Family familye.52.1.1 — NAD kinase-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1u0tA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10330 — Probable inorganic polyphosphate/atp-NAD kinase; domain 1
结构域编号 domain_id1u0tA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology200 — Tumour Suppressor Smad4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Probable inorganic polyphosphate/atp-NAD kinase; domain 2
结构域编号 domain_id1u0tB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10330 — Probable inorganic polyphosphate/atp-NAD kinase; domain 1
结构域编号 domain_id1u0tB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology200 — Tumour Suppressor Smad4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Probable inorganic polyphosphate/atp-NAD kinase; domain 2
▶

7. 引用文献 (2)