物种未注明
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 9 | UREASE × 3 （P41021） UREASE × 3 （P41020） NICKEL (II) ION × 6 BETA-MERCAPTOETHANOL × 6 water × 9 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | URE3_BACPA |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–100； UniProt 1–100 |
物种未注明
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 9 | UREASE × 3 （P41022） UREASE × 3 （P41020） NICKEL (II) ION × 6 BETA-MERCAPTOETHANOL × 6 water × 9 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | URE2_BACPA |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 1–122； UniProt 5–126 |
物种未注明
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 9 | UREASE × 3 （P41022） UREASE × 3 （P41021） NICKEL (II) ION × 6 BETA-MERCAPTOETHANOL × 6 water × 9 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | URE1_BACPA |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 3 |
| 链与序列区间 | 作者链 C； PDB构建体 1–570； UniProt 1–569 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
| 条目编号 entry_id | 1ubp |
| 沉积日期 deposition_date | 1998-01-21 |
| 结构标题 title | CRYSTAL STRUCTURE OF UREASE FROM BACILLUS PASTEURII INHIBITED WITH BETA-MERCAPTOETHANOL AT 1.65 ANGSTROMS RESOLUTION |
| 关键词 keywords | UREASE, BACILLUS PASTEURII, NICKEL, HYDROLASE, BETA-MERCAPTOETHANOL; HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 39.32 Å |
| Rg（电子密度） | 38.45 Å |
| 总 Rg | 38.78 Å |
| 原子数 | 18198 |
| 残基数 | 2370 |
| 排除体积 | 323460 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d1ubpa_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.8 — Urease, gamma-subunit |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.8.1 — Urease, gamma-subunit |
| 家族 Family family | d.8.1.1 — Urease, gamma-subunit |
| 结构域编号 domain_id | d1ubpb_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.85 — beta-clip |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.85.3 — Urease, beta-subunit |
| 家族 Family family | b.85.3.1 — Urease, beta-subunit |
| 结构域编号 domain_id | d1ubpc1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.92 — Composite domain of metallo-dependent hydrolases |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.92.1 — Composite domain of metallo-dependent hydrolases |
| 家族 Family family | b.92.1.1 — alpha-Subunit of urease |
| 结构域编号 domain_id | d1ubpc2 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.1 — TIM beta/alpha-barrel |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.1.9 — Metallo-dependent hydrolases |
| 家族 Family family | c.1.9.2 — alpha-subunit of urease, catalytic domain |
| 结构域编号 domain_id | 1ubpA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 280 — Urease; subunit A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Urease, gamma-like subunit |
| 结构域编号 domain_id | 1ubpB00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Ribbon |
| 拓扑 Topology topology | 150 — Urease, subunit B |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Urease, beta subunit |
| 结构域编号 domain_id | 1ubpC01 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Urease, subunit C; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Urease, subunit C, domain 1 |
| 结构域编号 domain_id | 1ubpC02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Alpha-Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 20 — TIM Barrel |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 140 — Metal-dependent hydrolases |