1ukl

Crystal structure of Importin-beta and SREBP-2 complex

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Importin beta-1 subunit

Mus musculus

UniProt P70168

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 Sterol regulatory element binding protein-2 × 2 (Q12772) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 Sterol regulatory element binding protein-2 × 2 (Q12772) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IMB1_MOUSE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–876; UniProt 1–876 作者链 B; PDB构建体 1–876; UniProt 1–876

Sterol regulatory element binding protein-2

Homo sapiens

UniProt Q12772

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 Importin beta-1 subunit × 1 (P70168) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 Importin beta-1 subunit × 1 (P70168) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SRBP2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–61; UniProt 343–403 作者链 D; PDB构建体 1–61; UniProt 343–403 作者链 E; PDB构建体 1–61; UniProt 343–403 作者链 F; PDB构建体 1–61; UniProt 343–403

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1ukl
沉积日期 deposition_date2003-08-26
结构标题 titleCrystal structure of Importin-beta and SREBP-2 complex
关键词 keywords;Transcription factor, Nuclear transport factor, HEAT repeat, Helix-Loop-Helix Leucine zipper, PROTEIN TRANSPORT-DNA BINDING PROTEIN COMPLEX ;; PROTEIN TRANSPORT/DNA BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1ukl__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1ukl__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1ukl__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)34.48 Å
Rg(电子密度)33.86 Å
总 Rg34.36 Å
原子数7803
残基数992
排除体积139700 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1ukl__assembly_1__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1ukl__assembly_2__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd1ukla_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamilya.118.1 — ARM repeat
家族 Family familya.118.1.1 — Armadillo repeat
结构域编号 domain_idd1uklb_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamilya.118.1 — ARM repeat
家族 Family familya.118.1.1 — Armadillo repeat
结构域编号 domain_idd1uklc_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.38 — HLH-like
超家族 Superfamily superfamilya.38.1 — HLH, helix-loop-helix DNA-binding domain
家族 Family familya.38.1.1 — HLH, helix-loop-helix DNA-binding domain
结构域编号 domain_idd1ukld_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.38 — HLH-like
超家族 Superfamily superfamilya.38.1 — HLH, helix-loop-helix DNA-binding domain
家族 Family familya.38.1.1 — HLH, helix-loop-helix DNA-binding domain
结构域编号 domain_idd1ukle_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.38 — HLH-like
超家族 Superfamily superfamilya.38.1 — HLH, helix-loop-helix DNA-binding domain
家族 Family familya.38.1.1 — HLH, helix-loop-helix DNA-binding domain
结构域编号 domain_idd1uklf_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.38 — HLH-like
超家族 Superfamily superfamilya.38.1 — HLH, helix-loop-helix DNA-binding domain
家族 Family familya.38.1.1 — HLH, helix-loop-helix DNA-binding domain

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id1uklA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology10 — Leucine-rich Repeat Variant
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Leucine-rich Repeat Variant
结构域编号 domain_id1uklB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology10 — Leucine-rich Repeat Variant
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Leucine-rich Repeat Variant
结构域编号 domain_id1uklC00
类 Class class4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture10 — Irregular
拓扑 Topology topology280 — MYOD Basic-Helix-Loop-Helix Domain, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Helix-loop-helix DNA-binding domain
结构域编号 domain_id1uklD00
类 Class class4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture10 — Irregular
拓扑 Topology topology280 — MYOD Basic-Helix-Loop-Helix Domain, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Helix-loop-helix DNA-binding domain
结构域编号 domain_id1uklE00
类 Class class4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture10 — Irregular
拓扑 Topology topology280 — MYOD Basic-Helix-Loop-Helix Domain, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Helix-loop-helix DNA-binding domain
结构域编号 domain_id1uklF00
类 Class class4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture10 — Irregular
拓扑 Topology topology280 — MYOD Basic-Helix-Loop-Helix Domain, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Helix-loop-helix DNA-binding domain
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7. 引用文献 (1)