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1vzu

Roles of active site tryptophans in substrate binding and catalysis by ALPHA-1,3 GALACTOSYLTRANSFERASE

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

N-ACETYLLACTOSAMINIDE ALPHA-1,3-GALACTOSYLTRANSFERASE

BOS TAURUS

UniProt P14769

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 MANGANESE (II) ION × 1 URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GLYCEROL × 1 water × 1 与蛋白数一致
2 其他组合 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 MANGANESE (II) ION × 1 URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GLYCEROL × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1fg5 1g8o 1g93 1gww 1gww 1gx0 1gx0 1k4v 1k4v 1vzt 1vzt 2jcj

共 28 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源二聚体
2vfz 2wgz

共 2 个 assembly

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1gwv 1gwv 1gx4 1gx4 1o7o 1o7o 1o7q 1o7q 1vzu 1vzu 1vzx 1vzx

共 17 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GATR_BOVIN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–289； UniProt 80–368 作者链 B； PDB构建体 1–289； UniProt 80–368

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1vzu
沉积日期 deposition_date2004-05-27
结构标题 titleRoles of active site tryptophans in substrate binding and catalysis by ALPHA-1,3 GALACTOSYLTRANSFERASE
关键词 keywordsTRANSFERASE, GLYCOSYLTRANSFERASE, GLYCOPROTEIN; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1vzu__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1vzu__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1vzu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）19.07 Å
Rg（电子密度）18.10 Å
总 Rg19.09 Å
原子数2446
残基数287
排除体积43832 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1vzu__assembly_1__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1vzu__assembly_2__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1vzua_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.68 — Nucleotide-diphospho-sugar transferases
超家族 Superfamily superfamilyc.68.1 — Nucleotide-diphospho-sugar transferases
家族 Family familyc.68.1.9 — alpha-1,3-galactosyltransferase-like
结构域编号 domain_idd1vzub_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.68 — Nucleotide-diphospho-sugar transferases
超家族 Superfamily superfamilyc.68.1 — Nucleotide-diphospho-sugar transferases
家族 Family familyc.68.1.9 — alpha-1,3-galactosyltransferase-like

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id1vzuA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology550 — Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A
结构域编号 domain_id1vzuB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology550 — Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A
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7. 引用文献 (4)