1wur

Structure of GTP cyclohydrolase I Complexed with 8-oxo-dGTP

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GTP cyclohydrolase I

Thermus thermophilus

UniProt Q5SH52

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 10 ZINC ION × 10 8-OXO-2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 10 water × 10 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q5SH52_THET8
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 B; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 C; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 D; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 E; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1wur
沉积日期 deposition_date2004-12-08
结构标题 titleStructure of GTP cyclohydrolase I Complexed with 8-oxo-dGTP
关键词 keywords;BETA BARREL, PROTEIN-INHIBITOR COMPLEX, HYDROLASE, PTERIDINE, TETRAHYDROBIOPTERIN, Structural Genomics, NPPSFA, National Project on Protein Structural and Functional Analyses, RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative, RSGI ;; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1wur__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1wur__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1wur__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)36.19 Å
Rg(电子密度)35.12 Å
总 Rg35.66 Å
原子数14982
残基数1848
排除体积266930 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1wur__assembly_1__model_1 decameric (10) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 15 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

结构域编号 domain_idd1wura_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.96 — T-fold
超家族 Superfamily superfamilyd.96.1 — Tetrahydrobiopterin biosynthesis enzymes-like
家族 Family familyd.96.1.1 — GTP cyclohydrolase I
结构域编号 domain_idd1wurb_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.96 — T-fold
超家族 Superfamily superfamilyd.96.1 — Tetrahydrobiopterin biosynthesis enzymes-like
家族 Family familyd.96.1.1 — GTP cyclohydrolase I
结构域编号 domain_idd1wurc_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.96 — T-fold
超家族 Superfamily superfamilyd.96.1 — Tetrahydrobiopterin biosynthesis enzymes-like
家族 Family familyd.96.1.1 — GTP cyclohydrolase I
结构域编号 domain_idd1wurd_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.96 — T-fold
超家族 Superfamily superfamilyd.96.1 — Tetrahydrobiopterin biosynthesis enzymes-like
家族 Family familyd.96.1.1 — GTP cyclohydrolase I
结构域编号 domain_idd1wure_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.96 — T-fold
超家族 Superfamily superfamilyd.96.1 — Tetrahydrobiopterin biosynthesis enzymes-like
家族 Family familyd.96.1.1 — GTP cyclohydrolase I

CATH v4.4 (10 domains)

结构域编号 domain_id1wurA01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology286 — GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GTP cyclohydrolase I, N-terminal domain
结构域编号 domain_id1wurA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1130 — GTP Cyclohydrolase I, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GTP cyclohydrolase I, C-terminal domain/NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase, N-terminal domain
结构域编号 domain_id1wurB01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology286 — GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GTP cyclohydrolase I, N-terminal domain
结构域编号 domain_id1wurB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1130 — GTP Cyclohydrolase I, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GTP cyclohydrolase I, C-terminal domain/NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase, N-terminal domain
结构域编号 domain_id1wurC01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology286 — GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GTP cyclohydrolase I, N-terminal domain
结构域编号 domain_id1wurC02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1130 — GTP Cyclohydrolase I, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GTP cyclohydrolase I, C-terminal domain/NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase, N-terminal domain
结构域编号 domain_id1wurD01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology286 — GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GTP cyclohydrolase I, N-terminal domain
结构域编号 domain_id1wurD02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1130 — GTP Cyclohydrolase I, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GTP cyclohydrolase I, C-terminal domain/NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase, N-terminal domain
结构域编号 domain_id1wurE01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology286 — GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GTP cyclohydrolase I, N-terminal domain
结构域编号 domain_id1wurE02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1130 — GTP Cyclohydrolase I, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GTP cyclohydrolase I, C-terminal domain/NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase, N-terminal domain
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7. 引用文献 (1)