1y0j

Zinc fingers as protein recognition motifs: structural basis for the GATA-1/Friend of GATA interaction

Method: SOLUTION NMR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Erythroid transcription factor

Mus musculus

UniProt P17679

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Zinc-finger protein ush × 1 (Q9VPQ6) ZINC ION × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GATA1_MOUSE
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 3–46; UniProt 200–243

Zinc-finger protein ush

Drosophila melanogaster

UniProt Q9VPQ6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Erythroid transcription factor × 1 (P17679) ZINC ION × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 USH_DROME
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 3–36; UniProt 202–235

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1y0j
沉积日期 deposition_date2004-11-15
结构标题 titleZinc fingers as protein recognition motifs: structural basis for the GATA-1/Friend of GATA interaction
关键词 keywordszinc finger, GATA-1, FOG, protein-protein complex, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1y0j__assembly_1__model_5

Assembly 1 · Model 5 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1y0j__assembly_1__model_5 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1y0j__assembly_1__model_5 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)13.23 Å
Rg(电子密度)12.61 Å
总 Rg13.89 Å
原子数1139
残基数75
排除体积10257 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1y0j__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 1y0j__assembly_1__model_2 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 1y0j__assembly_1__model_3 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 1y0j__assembly_1__model_4 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 1y0j__assembly_1__model_5 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 1y0j__assembly_1__model_6 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 1y0j__assembly_1__model_7 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 1y0j__assembly_1__model_8 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 1y0j__assembly_1__model_9 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 1y0j__assembly_1__model_10 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 1y0j__assembly_1__model_11 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 1y0j__assembly_1__model_12 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 1y0j__assembly_1__model_13 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 1y0j__assembly_1__model_14 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 1y0j__assembly_1__model_15 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 1y0j__assembly_1__model_16 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 1y0j__assembly_1__model_17 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 1y0j__assembly_1__model_18 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 1y0j__assembly_1__model_19 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 1y0j__assembly_1__model_20 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd1y0ja_
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.39 — Glucocorticoid receptor-like (DNA-binding domain)
超家族 Superfamily superfamilyg.39.1 — Glucocorticoid receptor-like (DNA-binding domain)
家族 Family familyg.39.1.1 — Erythroid transcription factor GATA-1
结构域编号 domain_idd1y0jb2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.37 — beta-beta-alpha zinc fingers
超家族 Superfamily superfamilyg.37.1 — beta-beta-alpha zinc fingers
家族 Family familyg.37.1.2 — C2HC finger
结构域编号 domain_idd1y0jb3
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

7. 引用文献 (1)