1yem

Conserved hypothetical protein Pfu-838710-001 from Pyrococcus furiosus

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Conserved hypothetical protein Pfu-838710-001

Pyrococcus furiosus (strain ATCC 43587 / DSM 3638 / JCM 8422 / Vc1)

UniProt Q8U2H2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 PLATINUM (II) ION × 1 UNKNOWN ATOM OR ION × 7 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q8U2H2_PYRFU
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 10–179; UniProt 2–171 作者链 B; PDB构建体 10–179; UniProt 2–171

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1yem
沉积日期 deposition_date2004-12-28
结构标题 titleConserved hypothetical protein Pfu-838710-001 from Pyrococcus furiosus
关键词 keywords;Structural Genomics, Southeast Collaboratory for Structural Genomics, SECSG, Protein Structure Initiative, PSI, conserved hypothetical protein, Pyrococcus furiosus, hyperthermophile, UNKNOWN FUNCTION ;; STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1yem__assembly_1__model_1 dimeric (2) 排除 — —
排除原因: 来源记录无法明确判定原子或离子的元素,因此不能可靠计算。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1yema1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.63 — CYTH-like phosphatases
超家族 Superfamily superfamilyd.63.1 — CYTH-like phosphatases
家族 Family familyd.63.1.2 — CYTH domain
结构域编号 domain_idd1yema2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd1yemb1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.63 — CYTH-like phosphatases
超家族 Superfamily superfamilyd.63.1 — CYTH-like phosphatases
家族 Family familyd.63.1.2 — CYTH domain
结构域编号 domain_idd1yemb2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id1yemA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology320 — Hypothetical Protein Pfu-838710-001
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hypothetical Protein Pfu-838710-001
结构域编号 domain_id1yemB00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology320 — Hypothetical Protein Pfu-838710-001
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hypothetical Protein Pfu-838710-001
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7. 引用文献 (1)