General secretion pathway protein L
Vibrio cholerae
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | water × 2 | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | GSPL_VIBCH |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 L； PDB构建体 1–248； UniProt 1–248 |
1yf5
Cyto-Epsl: The Cytoplasmic Domain Of Epsl, An Inner Membrane Component Of The Type II Secretion System Of Vibrio Cholerae
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 1yf5 |
| 沉积日期 deposition_date | 2004-12-30 |
| 结构标题 title | Cyto-Epsl: The Cytoplasmic Domain Of Epsl, An Inner Membrane Component Of The Type II Secretion System Of Vibrio Cholerae |
| 关键词 keywords | Type II secretion, secretory protein, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
1yf5__assembly_1__model_1
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
1yf5__assembly_1__model_1 | I(q)
1yf5__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 28.02 Å |
| Rg（电子密度） | 27.13 Å |
| 总 Rg | 27.90 Å |
| 原子数 | 3728 |
| 残基数 | 470 |
| 排除体积 | 66665 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains
SCOP 2.08 (2 domains)
| 结构域编号 domain_id | d1yf5l1 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.55 — Ribonuclease H-like motif |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.55.1 — Actin-like ATPase domain |
| 家族 Family family | c.55.1.11 — Cyto-EpsL domain |
| 结构域编号 domain_id | d1yf5l2 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.55 — Ribonuclease H-like motif |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.55.1 — Actin-like ATPase domain |
| 家族 Family family | c.55.1.11 — Cyto-EpsL domain |
CATH v4.4 (2 domains)
| 结构域编号 domain_id | 1yf5L01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 420 — Nucleotidyltransferase; domain 5 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 380 — |
| 结构域编号 domain_id | 1yf5L02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 420 — Nucleotidyltransferase; domain 5 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 370 — GspL cytoplasmic domain, C-terminal subdomain |