Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 其他组合 | 单体 | 蛋白 1 其他聚合物 2 | alpha-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CALCIUM ION × 30 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | TSP2_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 4–625； UniProt 551–1172 |
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| 条目编号 entry_id | 1yo8 |
| 沉积日期 deposition_date | 2005-01-26 |
| 结构标题 title | Structure of the C-terminal domain of human thrombospondin-2 |
| 关键词 keywords | EGF; Ca(2+)-binding domains; lectin domain; disulfide, Cell adhesion; CELL ADHESION |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 32.15 Å |
| Rg（电子密度） | 32.75 Å |
| 总 Rg | 32.99 Å |
| 原子数 | 4969 |
| 残基数 | 616 |
| 排除体积 | 86164 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 1yo8A01 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Ribbon |
| 拓扑 Topology topology | 25 — Laminin |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Laminin |
| 结构域编号 domain_id | 1yo8A02 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Ribbon |
| 拓扑 Topology topology | 25 — Laminin |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Laminin |
| 结构域编号 domain_id | 1yo8A03 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Ribbon |
| 拓扑 Topology topology | 25 — Laminin |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Laminin |
| 结构域编号 domain_id | 1yo8A05 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Jelly Rolls |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 200 — |