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1z8y

Mapping the E2 Glycoprotein of Alphaviruses

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Spike glycoprotein E1

物种未注明

UniProt P03316

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 1200 Spike glycoprotein E2 × 240 （P11259） 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 20 Spike glycoprotein E2 × 4 （P11259） 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 100 Spike glycoprotein E2 × 20 （P11259） 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 120 Spike glycoprotein E2 × 24 （P11259） 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 20 Spike glycoprotein E2 × 4 （P11259） 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1kxa 1kxb 1kxc 1kxd 1kxe 1kxf 2snv

共 7 个 assembly

同源二聚体
1svp 2snw

共 2 个 assembly

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体
3j0f 3j0f 3j0f 3j0f 3j0f 3muw 3muw 3muw 3muw 3muw

共 10 个 assembly

异源或核酸复合物
1ld4 1ld4 1ld4 1ld4 1ld4 1z8y 1z8y 1z8y 1z8y 1z8y 3muu 3muu

共 12 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 POLS_SINDV
Isoform —
PDB实体 1, 2, 3, 5
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–290； UniProt 807–1096 作者链 C； PDB构建体 1–290； UniProt 807–1096 作者链 E； PDB构建体 1–290； UniProt 807–1096 作者链 G； PDB构建体 1–290； UniProt 807–1096 作者链 B； PDB构建体 1–89； UniProt 1101–1189 作者链 D； PDB构建体 1–89； UniProt 1101–1189 作者链 F； PDB构建体 1–89； UniProt 1101–1189 作者链 H； PDB构建体 1–89； UniProt 1101–1189 作者链 I； PDB构建体 1–31； UniProt 1215–1245 作者链 K； PDB构建体 1–31； UniProt 1215–1245 作者链 M； PDB构建体 1–31； UniProt 1215–1245 作者链 O； PDB构建体 1–31； UniProt 1215–1245 作者链 Q； PDB构建体 1–151； UniProt 114–264 作者链 R； PDB构建体 1–151； UniProt 114–264 作者链 S； PDB构建体 1–151； UniProt 114–264 作者链 T； PDB构建体 1–151； UniProt 114–264

Spike glycoprotein E2

物种未注明

UniProt P11259

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 1200 Spike glycoprotein E1 × 240 （P03316） Spike glycoprotein E1 × 240 （P03316） Spike glycoprotein E1 × 240 （P03316） Capsid protein C × 240 （P03316） 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 20 Spike glycoprotein E1 × 4 （P03316） Spike glycoprotein E1 × 4 （P03316） Spike glycoprotein E1 × 4 （P03316） Capsid protein C × 4 （P03316） 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 100 Spike glycoprotein E1 × 20 （P03316） Spike glycoprotein E1 × 20 （P03316） Spike glycoprotein E1 × 20 （P03316） Capsid protein C × 20 （P03316） 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 120 Spike glycoprotein E1 × 24 （P03316） Spike glycoprotein E1 × 24 （P03316） Spike glycoprotein E1 × 24 （P03316） Capsid protein C × 24 （P03316） 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 20 Spike glycoprotein E1 × 4 （P03316） Spike glycoprotein E1 × 4 （P03316） Spike glycoprotein E1 × 4 （P03316） Capsid protein C × 4 （P03316） 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1z8y 1z8y 1z8y 1z8y 1z8y

共 5 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 POLS_SINDW
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 J； PDB构建体 1–36； UniProt 363–398 作者链 L； PDB构建体 1–36； UniProt 363–398 作者链 N； PDB构建体 1–36； UniProt 363–398 作者链 P； PDB构建体 1–36； UniProt 363–398

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1z8y
沉积日期 deposition_date2005-03-31
结构标题 titleMapping the E2 Glycoprotein of Alphaviruses
关键词 keywordsicosahedral enveloped virus, Icosahedral virus, Virus; VIRUS
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1z8y__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1z8y__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 108 109 1010 1011 1012 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1z8y__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）0.00 Å
Rg（电子密度）260.50 Å
总 Rg260.70 Å
原子数1084200
残基数143220
排除体积19356000 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1z8y__assembly_1__model_1 complete icosahedral assembly （1200） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1z8y__assembly_2__model_1 eicosameric （20） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
3 1 1z8y__assembly_3__model_1 100-meric （100） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
4 1 1z8y__assembly_4__model_1 120-meric （120） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
5 1 1z8y__assembly_5__model_1 eicosameric （20） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1z8yq1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.47 — Trypsin-like serine proteases
超家族 Superfamily superfamilyb.47.1 — Trypsin-like serine proteases
家族 Family familyb.47.1.3 — Viral proteases
结构域编号 domain_idd1z8yr1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.47 — Trypsin-like serine proteases
超家族 Superfamily superfamilyb.47.1 — Trypsin-like serine proteases
家族 Family familyb.47.1.3 — Viral proteases
结构域编号 domain_idd1z8ys1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.47 — Trypsin-like serine proteases
超家族 Superfamily superfamilyb.47.1 — Trypsin-like serine proteases
家族 Family familyb.47.1.3 — Viral proteases
结构域编号 domain_idd1z8yt1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.47 — Trypsin-like serine proteases
超家族 Superfamily superfamilyb.47.1 — Trypsin-like serine proteases
家族 Family familyb.47.1.3 — Viral proteases
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7. 引用文献 (1)