SAXSdb — 26qv

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mono-ethylhexylphthalate hydrolase

Rhodococcus sp. EG-5

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–303 链 B； UniProt 1–303	未记录	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 3.00 Å R-free 0.294
2	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–303 链 D； UniProt 1–303	未记录	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 3.00 Å R-free 0.294
3	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 1–303 链 H； UniProt 1–303	未记录	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 3.00 Å R-free 0.294
4	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 1–303 链 G； UniProt 1–303	未记录	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 3.00 Å R-free 0.294
5	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 1–303 链 J； UniProt 1–303	未记录	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 3.00 Å R-free 0.294

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 26QV	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
9WTK Crystal structure of monoalkyl phthalate hydrolase in complex with MBP from Rhodococcus sp. EG-5 提交 2025-09-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–303（303 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PHT PHTHALIC ACID × 1 1BO 1-BUTANOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Magnesium sulfate heptahydrate, 20% w/v PEG 3350, pH 6.0	分辨率 2.80 Å R-free 0.286
9WTK Crystal structure of monoalkyl phthalate hydrolase in complex with MBP from Rhodococcus sp. EG-5 提交 2025-09-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 10 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 J 1–303（303 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 PHT PHTHALIC ACID × 1 MLI MALONATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Magnesium sulfate heptahydrate, 20% w/v PEG 3350, pH 6.0	分辨率 2.80 Å R-free 0.286
9WTK Crystal structure of monoalkyl phthalate hydrolase in complex with MBP from Rhodococcus sp. EG-5 提交 2025-09-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–303（303 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 PHT PHTHALIC ACID × 1 1BO 1-BUTANOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Magnesium sulfate heptahydrate, 20% w/v PEG 3350, pH 6.0	分辨率 2.80 Å R-free 0.286
9WTK Crystal structure of monoalkyl phthalate hydrolase in complex with MBP from Rhodococcus sp. EG-5 提交 2025-09-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–303（303 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 PHT PHTHALIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Magnesium sulfate heptahydrate, 20% w/v PEG 3350, pH 6.0	分辨率 2.80 Å R-free 0.286
9WTK Crystal structure of monoalkyl phthalate hydrolase in complex with MBP from Rhodococcus sp. EG-5 提交 2025-09-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–303（303 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 7 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 PHT PHTHALIC ACID × 1 1BO 1-BUTANOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Magnesium sulfate heptahydrate, 20% w/v PEG 3350, pH 6.0	分辨率 2.80 Å R-free 0.286
9WTK Crystal structure of monoalkyl phthalate hydrolase in complex with MBP from Rhodococcus sp. EG-5 提交 2025-09-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 1–303（303 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 7 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PHT PHTHALIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Magnesium sulfate heptahydrate, 20% w/v PEG 3350, pH 6.0	分辨率 2.80 Å R-free 0.286
9WTK Crystal structure of monoalkyl phthalate hydrolase in complex with MBP from Rhodococcus sp. EG-5 提交 2025-09-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 F 1–303（303 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 PHT PHTHALIC ACID × 1 MLI MALONATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Magnesium sulfate heptahydrate, 20% w/v PEG 3350, pH 6.0	分辨率 2.80 Å R-free 0.286
9WTK Crystal structure of monoalkyl phthalate hydrolase in complex with MBP from Rhodococcus sp. EG-5 提交 2025-09-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 G 1–303（303 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 PHT PHTHALIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Magnesium sulfate heptahydrate, 20% w/v PEG 3350, pH 6.0	分辨率 2.80 Å R-free 0.286
9WTK Crystal structure of monoalkyl phthalate hydrolase in complex with MBP from Rhodococcus sp. EG-5 提交 2025-09-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 H 1–303（303 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 PHT PHTHALIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Magnesium sulfate heptahydrate, 20% w/v PEG 3350, pH 6.0	分辨率 2.80 Å R-free 0.286
9WTK Crystal structure of monoalkyl phthalate hydrolase in complex with MBP from Rhodococcus sp. EG-5 提交 2025-09-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 I 1–303（303 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PHT PHTHALIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Magnesium sulfate heptahydrate, 20% w/v PEG 3350, pH 6.0	分辨率 2.80 Å R-free 0.286

共 1 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A0U5ADH4_9NOCA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303 作者链 B； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303 作者链 C； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303 作者链 D； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303 作者链 E； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303 作者链 F； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303 作者链 G； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303 作者链 H； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303 作者链 I； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303 作者链 J； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	26qv
沉积日期 deposition_date	2026-05-11
最后修订 last_revision	2026-06-10
结构标题 title	Crystal structure of monoalkyl phthalate hydrolase from Rhodococcus sp. EG-5
关键词 keywords	Mono-butyl phthalate, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	68.78 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	69.47 Å
零角强度 I(0) i0	1322140000.00
分子量 molecular_weight	310390.0 kDa
排除体积 excluded_volume	390240 Å³
包络体积 envelope_volume	587760 Å³
水化壳体积 shell_volume	77557 Å³
包络直径 envelope_diameter	247.7 Å
壳层 Rg shell_rg	60.05 Å
包络 Rg envelope_rg	67.58 Å
形状 Rg shape_rg	69.47 Å
总 Rg total_rg	69.27 Å
总原子数 total_atoms	43729
残基数 n_residues	2868
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	225.2 Å
Rg (实空间) rg_real	69.27 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.03 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.3210e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.9150e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	66.63 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	1315000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7990
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	49.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.575
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.323
角度范围 angular_range	— – 0.1150 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0009
最高正则化参数 α highest_alpha	37880000.0000
实空间数据点数 n_real_points	24
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.815; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.734; Smooth: 0.206

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

▶

8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	177.612 Å
晶胞边长 b length_b	245.492 Å
晶胞边长 c length_c	191.658 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	80

空间群 space_group	C 2 2 2
空间群编号 int_tables_number	21
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	27.380 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2514
R_free r_free	0.2944

描述 description	Mono-ethylhexylphthalate hydrolase
分子量 formula_weight	33066.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	10

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J
原子数 atom_count	43983

Crystal structure of monoalkyl phthalate hydrolase from Rhodococcus sp. EG-5

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mono-ethylhexylphthalate hydrolase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

来源生物 organism	Rhodococcus sp. EG-5
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1747801
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	254

fit	/app/data/saxs_computation/6q/26qv/26qv.fit
pddf	/app/data/pr_computation/6q/26qv/26qv.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/6q/26qv/26qv.dat