2awo

Crystal structure of the ADP-Mg-bound E. Coli MALK (Crystallized with ADP-Mg)

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 133.7 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein malK

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–371 链 B； UniProt 1–371	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；5mM ADP-Mg2+, 0.2M Magnesium Formate, 15%~20% PEG3350, 15% Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.277
2	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–371 链 D； UniProt 1–371	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；5mM ADP-Mg2+, 0.2M Magnesium Formate, 15%~20% PEG3350, 15% Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.277

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2AWO	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1Q12 Crystal Structure of the ATP-bound E. coli MalK 提交 2003-07-18	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–371（371 aa）链 B 1–371（371 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；273 K；PEG 4000, glycerol, Sodium Acetate, Tris, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K	分辨率 2.60 Å R-free 0.286
1Q12 Crystal Structure of the ATP-bound E. coli MalK 提交 2003-07-18	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–371（371 aa）链 D 1–371（371 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；273 K；PEG 4000, glycerol, Sodium Acetate, Tris, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K	分辨率 2.60 Å R-free 0.286
1Q1B Crystal structure of E. coli MalK in the nucleotide-free form 提交 2003-07-18	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–371（371 aa）链 B 1–371（371 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；293 K；PEG 4000, glycerol, Sodium Acetate, Tris, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.304
1Q1B Crystal structure of E. coli MalK in the nucleotide-free form 提交 2003-07-18	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–371（371 aa）链 D 1–371（371 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；293 K；PEG 4000, glycerol, Sodium Acetate, Tris, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.304
1Q1E The ATPase component of E. coli maltose transporter (MalK) in the nucleotide-free form 提交 2003-07-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–371（371 aa）链 B 1–371（371 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG5K MME, (NH4)2SO4, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.276
2AWN Crystal structure of the ADP-Mg-bound E. Coli MALK (Crystallized with ATP-Mg) 提交 2005-09-01	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–371（371 aa）链 B 1–371（371 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；5mM ATP-Mg2+, 0.2M Magnesium Formate, 15%~20% PEG3350, 15% Glycerol , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.271
2AWN Crystal structure of the ADP-Mg-bound E. Coli MALK (Crystallized with ATP-Mg) 提交 2005-09-01	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–371（371 aa）链 D 1–371（371 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；5mM ATP-Mg2+, 0.2M Magnesium Formate, 15%~20% PEG3350, 15% Glycerol , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.271
3FH6 Crystal structure of the resting state maltose transporter from E. coli 提交 2008-12-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–371（371 aa）链 B 1–371（371 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；11.5 % PEG 4000, 0.1M ADA pH 6.5, 0.1 M NaCl, 0.1 M Li2SO4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 4.50 Å R-free 0.363
3FH6 Crystal structure of the resting state maltose transporter from E. coli 提交 2008-12-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–371（371 aa）链 D 1–371（371 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；11.5 % PEG 4000, 0.1M ADA pH 6.5, 0.1 M NaCl, 0.1 M Li2SO4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 4.50 Å R-free 0.363
3GD7 Crystal structure of human NBD2 complexed with N6-Phenylethyl-ATP (P-ATP) 提交 2009-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 219–371（153 aa）	突变：Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D	B44 N-(2-phenylethyl)adenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；1.1-1.25 M tri-sodium citrate, pH 5.5-8, sitting drop, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION	分辨率 2.70 Å R-free 0.308
3GD7 Crystal structure of human NBD2 complexed with N6-Phenylethyl-ATP (P-ATP) 提交 2009-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 219–371（153 aa）	突变：Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D	B44 N-(2-phenylethyl)adenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；1.1-1.25 M tri-sodium citrate, pH 5.5-8, sitting drop, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION	分辨率 2.70 Å R-free 0.308
3GD7 Crystal structure of human NBD2 complexed with N6-Phenylethyl-ATP (P-ATP) 提交 2009-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 219–371（153 aa）	突变：Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D	B44 N-(2-phenylethyl)adenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；1.1-1.25 M tri-sodium citrate, pH 5.5-8, sitting drop, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION	分辨率 2.70 Å R-free 0.308
3GD7 Crystal structure of human NBD2 complexed with N6-Phenylethyl-ATP (P-ATP) 提交 2009-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 219–371（153 aa）	突变：Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D	B44 N-(2-phenylethyl)adenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；1.1-1.25 M tri-sodium citrate, pH 5.5-8, sitting drop, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION	分辨率 2.70 Å R-free 0.308
3GD7 Crystal structure of human NBD2 complexed with N6-Phenylethyl-ATP (P-ATP) 提交 2009-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 信息不足同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 219–371（153 aa）链 B 219–371（153 aa）链 C 219–371（153 aa）链 D 219–371（153 aa）	突变：Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D 突变：Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D 突变：Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D 突变：Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D	B44 N-(2-phenylethyl)adenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；1.1-1.25 M tri-sodium citrate, pH 5.5-8, sitting drop, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION	分辨率 2.70 Å R-free 0.308
3PUV Crystal Structure of an outward-facing MBP-Maltose transporter complex bound to ADP-VO4 提交 2010-12-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–371（371 aa）链 B 1–371（371 aa）	未记录	PGV (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 10 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 VO4 VANADATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；27% PEG 400, 0.1M HEPES, 10 mM magnesium chloride, 50 mM sodium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K, pH 7.5	分辨率 2.40 Å R-free 0.253
3PUW Crystal Structure of an outward-facing MBP-Maltose transporter complex bound to ADP-AlF4 提交 2010-12-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–371（371 aa）链 B 1–371（371 aa）	未记录	PGV (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 10 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；27 % PEG 400, 0.1 M HEPES, 10 mM magnesium chloride, 50 mM sodium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K, pH 7.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.255
3PUX Crystal Structure of an outward-facing MBP-Maltose transporter complex bound to ADP-BeF3 提交 2010-12-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–371（371 aa）链 B 1–371（371 aa）	未记录	UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 1 PGV (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 10 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；293 K；27% PEG 400, 0.1 M HEPES, 10 mM magnesium chloride, 50 mM sodium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K, pH 7.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.265
3RLF Crystal structure of the maltose-binding protein/maltose transporter complex in an outward-facing conformation bound to MgAMPPNP 提交 2011-04-19	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–371（371 aa）链 B 1–371（371 aa）	未记录	UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 1 PGV (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；28% PEG 4000, 0.1M sodium hepes pH 7.5, 0.2M sodium chloride, 0.05M magnesium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.20 Å R-free 0.254
4JBW Crystal structure of E. coli maltose transporter MalFGK2 in complex with its regulatory protein EIIAglc 提交 2013-02-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–371（371 aa）链 B 1–371（371 aa）	未记录	PGV (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；295 K；13% PEG monomethylether 2000, 100mM Sodium cacodylate pH 5.6, 100mM Non Detergent Sulfobetaine (NDSB-256), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 3.91 Å R-free 0.281
4JBW Crystal structure of E. coli maltose transporter MalFGK2 in complex with its regulatory protein EIIAglc 提交 2013-02-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 1–371（371 aa）链 D 1–371（371 aa）	未记录	PGV (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；295 K；13% PEG monomethylether 2000, 100mM Sodium cacodylate pH 5.6, 100mM Non Detergent Sulfobetaine (NDSB-256), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 3.91 Å R-free 0.281
9BCR Cryo-EM structure of a bacterial prototype ATP-binding cassette transporter MalFGK2. 提交 2024-04-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 2–371（370 aa）链 D 2–371（370 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.26 Å
9NQJ Cryo-EM structure of a bacterial prototype ATP-binding cassette transporter MalFGK2. 提交 2025-03-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 2–371（370 aa）链 B 2–371（370 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 VO4 VANADATE ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.34 Å

共 13 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MALK_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–371； UniProt 1–371 作者链 B； PDB构建体 1–371； UniProt 1–371 作者链 C； PDB构建体 1–371； UniProt 1–371 作者链 D； PDB构建体 1–371； UniProt 1–371

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2awo
沉积日期 deposition_date	2005-09-01
结构标题 title	Crystal structure of the ADP-Mg-bound E. Coli MALK (Crystallized with ADP-Mg)
关键词 keywords	ATP-BINDING CASSETTE, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	40.26 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	39.98 Å
零角强度 I(0) i0	372382000.00
分子量 molecular_weight	156810.0 kDa
排除体积 excluded_volume	196390 Å³
包络体积 envelope_volume	262220 Å³
水化壳体积 shell_volume	55408 Å³
包络直径 envelope_diameter	141.1 Å
壳层 Rg shell_rg	45.02 Å
包络 Rg envelope_rg	39.30 Å
形状 Rg shape_rg	39.98 Å
总 Rg total_rg	40.27 Å
总原子数 total_atoms	11005
残基数 n_residues	1408
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	133.7 Å
Rg (实空间) rg_real	40.30 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.07 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.7240e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	6.2930e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	40.26 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	372400000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8833
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	44.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.353
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.473
角度范围 angular_range	— – 0.1950 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	38630000.0000
实空间数据点数 n_real_points	40
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.877; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.974; Smooth: 0.875

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein malK
分子量 formula_weight	42184.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.3.19
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	11005

MASVQLQNVTKAWGEVVVSKDINLDIHEGEFVVFVGPSGCGKSTLLRMIAGLETITSGDLFIGEKRMNDTPPAERGVGMVFQSYALYPHLSVAENMSFGLKLAGAKKEVINQRVNQVAEVLQLAHLLDRKPKALSGGQRQRVAIGRTLVAEPSVFLLDEPLSNLDAALRVQMRIEISRLHKRLGRTMIYVTHDQVEAMTLADKIVVLDAGRVAQVGKPLELYHYPADRFVAGFIGSPKMNFLPVKVTATAIDQVQVELPMPNRQQVWLPVESRDVQVGANMSLGIRPEHLLPSDIADVILEGEVQVVEQLGNETQIHIQIPSIRQNLVYRQNDVVLVEEGATFAIGLPPERCHLFREDGTACRRLHKEPGVASASHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

结构域编号 domain_id	d2awoa1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.6 — MOP-like
家族 Family family	b.40.6.3 — ABC-transporter additional domain

结构域编号 domain_id	d2awoa2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.12 — ABC transporter ATPase domain-like

结构域编号 domain_id	d2awoa3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2awob1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.6 — MOP-like
家族 Family family	b.40.6.3 — ABC-transporter additional domain

结构域编号 domain_id	d2awob2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.12 — ABC transporter ATPase domain-like

结构域编号 domain_id	d2awob3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2awoc1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.6 — MOP-like
家族 Family family	b.40.6.3 — ABC-transporter additional domain

结构域编号 domain_id	d2awoc2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.12 — ABC transporter ATPase domain-like

结构域编号 domain_id	d2awoc3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2awod1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.6 — MOP-like
家族 Family family	b.40.6.3 — ABC-transporter additional domain

结构域编号 domain_id	d2awod2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.12 — ABC transporter ATPase domain-like

结构域编号 domain_id	d2awod3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	2awoA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	2awoA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	2awoA03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	2awoB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	2awoB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	2awoB03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	2awoC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	2awoC02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	2awoC03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	2awoD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	2awoD02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	2awoD03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	70.213 Å
晶胞边长 b length_b	101.975 Å
晶胞边长 c length_c	131.503 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.73 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	29.930 Å
R 因子 r_factor	0.2390
R_work r_work	0.2390
R_free r_free	0.2770

fit	/app/data/saxs_computation/aw/2awo/2awo.fit
pddf	/app/data/pr_computation/aw/2awo/2awo.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/aw/2awo/2awo.dat