2bif

6-PHOSPHOFRUCTO-2-KINASE/FRUCTOSE-2,6-BISPHOSPHATASE H256A MUTANT WITH F6P IN PHOSPHATASE ACTIVE SITE

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (6-PHOSPHOFRUCTO-2-KINASE/FRUCTOSE-2,6-BISPHOSPHATASE)

Rattus norvegicus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	octyl beta-D-glucopyranoside × 3 6-O-phosphono-beta-D-fructofuranose × 2 MAGNESIUM ION × 1 PHOSPHATE ION × 3 PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 SUCCINIC ACID × 2 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	F264_RAT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–469； UniProt 1–468 作者链 B； PDB构建体 1–469； UniProt 1–468

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2bif
沉积日期 deposition_date	1998-10-26
结构标题 title	6-PHOSPHOFRUCTO-2-KINASE/FRUCTOSE-2,6-BISPHOSPHATASE H256A MUTANT WITH F6P IN PHOSPHATASE ACTIVE SITE
关键词 keywords	KINASE, TRANSFERASE (PHOSPHO), PHOSPHATASE, HYDROLASE (PHOSPHO), GLYCOLYSIS, BIFUNCTIONAL ENZYME, TRANSFERASE, HYDROLASE; TRANSFERASE, HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2bif__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2bif__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2bif__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	31.27 Å
Rg（电子密度）	30.06 Å
总 Rg	30.68 Å
原子数	7157
残基数	864
排除体积	127090 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2bif__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	PROTEIN (6-PHOSPHOFRUCTO-2-KINASE/FRUCTOSE-2,6-BISPHOSPHATASE)
分子量 formula_weight	54001.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.1.105, 3.1.3.46
突变 mutation	W15F, W64F, H256A, W299F, W320F
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	7444

MASPRELTQNPLKKIFMPYSNGRPALHASQRGVCMTNCPTLIVMVGLPARGKTYISKKLTRYLNFIGVPTREFNVGQYRRDMVKTYKSFEFFLPDNEEGLKIRKQCALAALNDVRKFLSEEGGHVAVFDATNTTRERRAMIFNFGEQNGYKTFFVESICVDPEVIAANIVQVKLGSPDYVNRDSDEATEDFMRRIECYENSYESLDEEQDRDLSYIKIMDVGQSYVVNRVADHIQSRIVYYLMNIHVTPRSIYLCRAGESELNLKGRIGGDPGLSPRGREFSKHLAQFISDQNIKDLKVFTSQMKRTIQTAEALSVPYEQFKVLNEIDAGVCEEMTYEEIQDHYPLEFALRDQDKYRYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKAAEELPYLKCPLHTVLKLTPVAYGCKVESIFLNVAAVNTHRDRPQNVDISRPSEEALVTVPAHQ

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	Norway rat
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	octyl beta-D-glucopyranoside
分子量 formula_weight	292.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	6-O-phosphono-beta-D-fructofuranose
分子量 formula_weight	260.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	PHOSPHATE ION
分子量 formula_weight	95.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER
分子量 formula_weight	506.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	SUCCINIC ACID
分子量 formula_weight	118.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 8 Entity 8 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	275

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d2bifa1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.7 — 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase, kinase domain

结构域编号 domain_id	d2bifa2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.60 — Phosphoglycerate mutase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.60.1 — Phosphoglycerate mutase-like
家族 Family family	c.60.1.4 — 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase, phosphatase domain

结构域编号 domain_id	d2bifb1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.7 — 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase, kinase domain

结构域编号 domain_id	d2bifb2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.60 — Phosphoglycerate mutase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.60.1 — Phosphoglycerate mutase-like
家族 Family family	c.60.1.4 — 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase, phosphatase domain

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	2bifA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	2bifA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1240 — Phosphoglycerate mutase-like

结构域编号 domain_id	2bifB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	2bifB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1240 — Phosphoglycerate mutase-like

▶

晶胞边长 a length_a	61.740 Å
晶胞边长 b length_b	73.510 Å
晶胞边长 c length_c	76.700 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	116.90 °
晶胞夹角 β angle_beta	99.31 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	105.20 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.400 Å
最低分辨率 resolution_low	30.000 Å
R 因子 r_factor	0.2000
R_work r_work	0.2000
R_free r_free	0.2440

6-PHOSPHOFRUCTO-2-KINASE/FRUCTOSE-2,6-BISPHOSPHATASE H256A MUTANT WITH F6P IN PHOSPHATASE ACTIVE SITE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (6-PHOSPHOFRUCTO-2-KINASE/FRUCTOSE-2,6-BISPHOSPHATASE)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2bif__assembly_1__model_1

2bif__assembly_1__model_1 | I(q)

2bif__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

6-PHOSPHOFRUCTO-2-KINASE/FRUCTOSE-2,6-BISPHOSPHATASE H256A MUTANT WITH F6P IN PHOSPHATASE ACTIVE SITE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (6-PHOSPHOFRUCTO-2-KINASE/FRUCTOSE-2,6-BISPHOSPHATASE)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2bif__assembly_1__model_1

2bif__assembly_1__model_1 | I(q)

2bif__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)