2buf

Arginine Feed-Back Inhibitable Acetylglutamate Kinase

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ACETYLGLUTAMATE KINASE

PSEUDOMONAS AERUGINOSA

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 6	N-ACETYL-L-GLUTAMATE × 5 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MAGNESIUM ION × 4 CHLORIDE ION × 3	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 6	N-ACETYL-L-GLUTAMATE × 5 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MAGNESIUM ION × 4 CHLORIDE ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ARGB_PSEAE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–300； UniProt 1–300 作者链 B； PDB构建体 1–300； UniProt 1–300 作者链 C； PDB构建体 1–300； UniProt 1–300 作者链 D； PDB构建体 1–300； UniProt 1–300 作者链 E； PDB构建体 1–300； UniProt 1–300 作者链 F； PDB构建体 1–300； UniProt 1–300 作者链 G； PDB构建体 1–300； UniProt 1–300 作者链 H； PDB构建体 1–300； UniProt 1–300 作者链 I； PDB构建体 1–300； UniProt 1–300 作者链 J； PDB构建体 1–300； UniProt 1–300 作者链 K； PDB构建体 1–300； UniProt 1–300 作者链 L； PDB构建体 1–300； UniProt 1–300

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2buf
沉积日期 deposition_date	2005-06-12
结构标题 title	Arginine Feed-Back Inhibitable Acetylglutamate Kinase
关键词 keywords	;ACETYGLUTAMATE KINASE, ACETYLGLUTAMATE, ADP, ARGININE BIOSYNTHESIS, FEED-BACK INHIBITION, HEXAMER, TRANSFERASE, ARGININE INHIBITION, ALLOSTERIC MECHANISM, FEEDBACK CONTROL, AMINO ACID KINASE FAMILY ;; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2buf__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2buf__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2buf__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	40.84 Å
Rg（电子密度）	39.63 Å
总 Rg	40.15 Å
原子数	12772
残基数	1731
排除体积	229250 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2buf__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2buf__assembly_2__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ACETYLGLUTAMATE KINASE
分子量 formula_weight	31754.8 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.2.8
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L
原子数 atom_count	25923

TLSRDDAAQVAKVLSEALPYIRRFVGKTLVIKYGGNAMESEELKAGFARDVVLMKAVGINPVVVHGGGPQIGDLLKRLSIESHFIDGMRVTDAATMDVVEMVLGGQVNKDIVNLINRHGGSAIGLTGKDAELIRAKKLTVTRQTPEMTKPEIIDIGHVGEVTGVNVGLLNMLVKGDFIPVIAPIGVGSNGESYNINADLVAGKVAEALKAEKLMLLTNIAGLMDKQGQVLTGLSTEQVNELIADGTIYGGMLPKIRCALEAVQGGVTSAHIIDGRVPNAVLLEIFTDSGVGTLISNRKRH

来源 Source

来源生物 organism	PSEUDOMONAS AERUGINOSA
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	287
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	N-ACETYL-L-GLUTAMATE
分子量 formula_weight	189.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

结构域编号 domain_id	d2bufa1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.73 — Carbamate kinase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.73.1 — Carbamate kinase-like
家族 Family family	c.73.1.2 — N-acetyl-l-glutamate kinase

结构域编号 domain_id	d2bufb_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.73 — Carbamate kinase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.73.1 — Carbamate kinase-like
家族 Family family	c.73.1.2 — N-acetyl-l-glutamate kinase

结构域编号 domain_id	d2bufc_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.73 — Carbamate kinase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.73.1 — Carbamate kinase-like
家族 Family family	c.73.1.2 — N-acetyl-l-glutamate kinase

结构域编号 domain_id	d2bufd_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.73 — Carbamate kinase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.73.1 — Carbamate kinase-like
家族 Family family	c.73.1.2 — N-acetyl-l-glutamate kinase

结构域编号 domain_id	d2bufe_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.73 — Carbamate kinase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.73.1 — Carbamate kinase-like
家族 Family family	c.73.1.2 — N-acetyl-l-glutamate kinase

结构域编号 domain_id	d2buff_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.73 — Carbamate kinase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.73.1 — Carbamate kinase-like
家族 Family family	c.73.1.2 — N-acetyl-l-glutamate kinase

结构域编号 domain_id	d2bufg_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.73 — Carbamate kinase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.73.1 — Carbamate kinase-like
家族 Family family	c.73.1.2 — N-acetyl-l-glutamate kinase

结构域编号 domain_id	d2bufh_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.73 — Carbamate kinase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.73.1 — Carbamate kinase-like
家族 Family family	c.73.1.2 — N-acetyl-l-glutamate kinase

结构域编号 domain_id	d2bufi_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.73 — Carbamate kinase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.73.1 — Carbamate kinase-like
家族 Family family	c.73.1.2 — N-acetyl-l-glutamate kinase

结构域编号 domain_id	d2bufj_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.73 — Carbamate kinase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.73.1 — Carbamate kinase-like
家族 Family family	c.73.1.2 — N-acetyl-l-glutamate kinase

结构域编号 domain_id	d2bufk_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.73 — Carbamate kinase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.73.1 — Carbamate kinase-like
家族 Family family	c.73.1.2 — N-acetyl-l-glutamate kinase

结构域编号 domain_id	d2bufl_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.73 — Carbamate kinase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.73.1 — Carbamate kinase-like
家族 Family family	c.73.1.2 — N-acetyl-l-glutamate kinase

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	2bufA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1160 — Carbamate kinase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acetylglutamate kinase-like

结构域编号 domain_id	2bufB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1160 — Carbamate kinase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acetylglutamate kinase-like

结构域编号 domain_id	2bufC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1160 — Carbamate kinase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acetylglutamate kinase-like

结构域编号 domain_id	2bufD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1160 — Carbamate kinase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acetylglutamate kinase-like

结构域编号 domain_id	2bufE00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1160 — Carbamate kinase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acetylglutamate kinase-like

结构域编号 domain_id	2bufF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1160 — Carbamate kinase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acetylglutamate kinase-like

结构域编号 domain_id	2bufG00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1160 — Carbamate kinase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acetylglutamate kinase-like

结构域编号 domain_id	2bufH00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1160 — Carbamate kinase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acetylglutamate kinase-like

结构域编号 domain_id	2bufI00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1160 — Carbamate kinase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acetylglutamate kinase-like

结构域编号 domain_id	2bufJ00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1160 — Carbamate kinase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acetylglutamate kinase-like

结构域编号 domain_id	2bufK00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1160 — Carbamate kinase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acetylglutamate kinase-like

结构域编号 domain_id	2bufL00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1160 — Carbamate kinase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acetylglutamate kinase-like

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晶胞边长 a length_a	71.860 Å
晶胞边长 b length_b	98.780 Å
晶胞边长 c length_c	162.900 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	91.49 °
晶胞夹角 β angle_beta	92.03 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	107.56 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.950 Å
最低分辨率 resolution_low	18.000 Å
R 因子 r_factor	0.2491
R_work r_work	0.2491
R_free r_free	0.2668

Arginine Feed-Back Inhibitable Acetylglutamate Kinase

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ACETYLGLUTAMATE KINASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2buf__assembly_2__model_1

2buf__assembly_2__model_1 | I(q)

2buf__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (2)

Arginine Feed-Back Inhibitable Acetylglutamate Kinase

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ACETYLGLUTAMATE KINASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2buf__assembly_2__model_1

2buf__assembly_2__model_1 | I(q)

2buf__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (2)