2cnw

GDPALF4 complex of the SRP GTPases Ffh and FtsY

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SIGNAL RECOGNITION PARTICLE PROTEIN

THERMUS AQUATICUS

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	CELL DIVISION PROTEIN FTSY × 1 （P83749） GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 2 TETRAFLUOROALUMINATE ION × 2 GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	CELL DIVISION PROTEIN FTSY × 1 （P83749） GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 2 TETRAFLUOROALUMINATE ION × 2 GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	CELL DIVISION PROTEIN FTSY × 1 （P83749） GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 2 TETRAFLUOROALUMINATE ION × 2 GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SRP54_THEAQ
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–294； UniProt 1–293 作者链 B； PDB构建体 2–294； UniProt 1–293 作者链 C； PDB构建体 2–294； UniProt 1–293

CELL DIVISION PROTEIN FTSY

THERMUS AQUATICUS

UniProt P83749

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	SIGNAL RECOGNITION PARTICLE PROTEIN × 1 （O07347） GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 2 TETRAFLUOROALUMINATE ION × 2 GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	SIGNAL RECOGNITION PARTICLE PROTEIN × 1 （O07347） GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 2 TETRAFLUOROALUMINATE ION × 2 GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	SIGNAL RECOGNITION PARTICLE PROTEIN × 1 （O07347） GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 2 TETRAFLUOROALUMINATE ION × 2 GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FTSY_THEAQ
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–284； UniProt 20–303 作者链 E； PDB构建体 1–284； UniProt 20–303 作者链 F； PDB构建体 1–284； UniProt 20–303

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2cnw
沉积日期 deposition_date	2006-05-24
结构标题 title	GDPALF4 complex of the SRP GTPases Ffh and FtsY
关键词 keywords	;INNER MEMBRANE, MEMBRANE TARGETING, NUCLEOTIDE-BINDING, GDP- ALUMINUM FLUORIDE, SIGNAL RECOGNITION PARTICLE, RNA-BINDING, GTP-BINDING, CELL DIVISION, SIGNAL SEQUENCE RECOGNITION, SRP, FFH, FTSY, GTPASE, MEMBRANE, CELL CYCLE, CELL DIVISION-COMPLEX, SIGNAL RECOGNITION ;; SIGNAL RECOGNITION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2cnw__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2cnw__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2cnw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	25.89 Å
Rg（电子密度）	25.04 Å
总 Rg	25.84 Å
原子数	4461
残基数	571
排除体积	79848 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2cnw__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2cnw__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`2cnw__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	SIGNAL RECOGNITION PARTICLE PROTEIN
分子量 formula_weight	32300.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	13912

MFQQLSARLQEAIGRLRGRGRITEEDLKATLREIRRALMDADVNLEVARDFVERVREEALGKQVLESLTPAEVILATVYEALKEALGGEARLPVLKDRNLWFLVGLQGSGKTTTAAKLALYYKGKGRRPLLVAADTQRPAAREQLRLLGEKVGVPVLEVMDGESPESIRRRVEEKARLEARDLILVDTAGRLQIDEPLMGELARLKEVLGPDEVLLVLDAMTGQEALSVARAFDEKVGVTGLVLTKLDGDARGGAALSARHVTGKPIYFAGVSEKPEGLEPFYPERLAGRILGM

来源 Source

来源生物 organism	THERMUS AQUATICUS
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	271
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	CELL DIVISION PROTEIN FTSY
分子量 formula_weight	30764.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,E,F

AIPWGGNLEEVLEELEMALLAADVGLSATEEILQEVRASGRKDLKEAVKEKLVGMLEPDERRATLRKLGFNPQKPKPVEPKGRVVLVVGVNGVGKTTTIAKLGRYYQNLGKKVMFCAGDTFRAAGGTQLSEWGKRLSIPVIQGPEGTDPAALAYDAVQAMKARGYDLLFVDTAGRLHTKHNLMEELKKVKRAIAKADPEEPKEVWLVLDAVTGQNGLEQAKKFHEAVGLTGVIVTKLDGTAKGGVLIPIVRTLKVPIKFVGVGEGPDDLQPFDPEAFVEALLED

来源 Source

来源生物 organism	THERMUS AQUATICUS
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	271
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	443.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	TETRAFLUOROALUMINATE ION
分子量 formula_weight	103.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE
分子量 formula_weight	363.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	621

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

结构域编号 domain_id	d2cnwa1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.24 — Four-helical up-and-down bundle
超家族 Superfamily superfamily	a.24.13 — Domain of the SRP/SRP receptor G-proteins
家族 Family family	a.24.13.1 — Domain of the SRP/SRP receptor G-proteins

结构域编号 domain_id	d2cnwa2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.10 — Nitrogenase iron protein-like

结构域编号 domain_id	d2cnwb1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.24 — Four-helical up-and-down bundle
超家族 Superfamily superfamily	a.24.13 — Domain of the SRP/SRP receptor G-proteins
家族 Family family	a.24.13.1 — Domain of the SRP/SRP receptor G-proteins

结构域编号 domain_id	d2cnwb2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.10 — Nitrogenase iron protein-like

结构域编号 domain_id	d2cnwc1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.24 — Four-helical up-and-down bundle
超家族 Superfamily superfamily	a.24.13 — Domain of the SRP/SRP receptor G-proteins
家族 Family family	a.24.13.1 — Domain of the SRP/SRP receptor G-proteins

结构域编号 domain_id	d2cnwc2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.10 — Nitrogenase iron protein-like

结构域编号 domain_id	d2cnwd1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.24 — Four-helical up-and-down bundle
超家族 Superfamily superfamily	a.24.13 — Domain of the SRP/SRP receptor G-proteins
家族 Family family	a.24.13.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2cnwd2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.10 — Nitrogenase iron protein-like

结构域编号 domain_id	d2cnwe1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.24 — Four-helical up-and-down bundle
超家族 Superfamily superfamily	a.24.13 — Domain of the SRP/SRP receptor G-proteins
家族 Family family	a.24.13.1 — Domain of the SRP/SRP receptor G-proteins

结构域编号 domain_id	d2cnwe2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.10 — Nitrogenase iron protein-like

结构域编号 domain_id	d2cnwf1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.24 — Four-helical up-and-down bundle
超家族 Superfamily superfamily	a.24.13 — Domain of the SRP/SRP receptor G-proteins
家族 Family family	a.24.13.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2cnwf2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.10 — Nitrogenase iron protein-like

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	2cnwA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — SRP54, nucleotide-binding domain

结构域编号 domain_id	2cnwA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	2cnwB01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — SRP54, nucleotide-binding domain

结构域编号 domain_id	2cnwB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	2cnwC01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — SRP54, nucleotide-binding domain

结构域编号 domain_id	2cnwC02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	2cnwD01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — SRP54, nucleotide-binding domain

结构域编号 domain_id	2cnwD02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	2cnwE01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — SRP54, nucleotide-binding domain

结构域编号 domain_id	2cnwE02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	2cnwF01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — SRP54, nucleotide-binding domain

结构域编号 domain_id	2cnwF02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

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晶胞边长 a length_a	188.686 Å
晶胞边长 b length_b	188.686 Å
晶胞边长 c length_c	44.588 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	9

空间群 space_group	P 32
空间群编号 int_tables_number	145
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.390 Å
最低分辨率 resolution_low	14.680 Å
R 因子 r_factor	0.1860
R_work r_work	0.1830
R_free r_free	0.2530

GDPALF4 complex of the SRP GTPases Ffh and FtsY

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SIGNAL RECOGNITION PARTICLE PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

CELL DIVISION PROTEIN FTSY

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2cnw__assembly_1__model_1

2cnw__assembly_1__model_1 | I(q)

2cnw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (1)

GDPALF4 complex of the SRP GTPases Ffh and FtsY

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SIGNAL RECOGNITION PARTICLE PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

CELL DIVISION PROTEIN FTSY

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2cnw__assembly_1__model_1

2cnw__assembly_1__model_1 | I(q)

2cnw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (1)