Twinfilin-1
Mus musculus
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 161–313 | 片段：COFILIN HOMOLOGY DOMAIN, UNP Residues 161-313 | 无其他共同聚合物 | SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient NMR样品组成：1.44mM COFILIN HOMOLOGY DOMAIN, 20mM d-Tris-HCL, 100mM NaCl, 1mM d-DTT, 0.02 % NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O | 分辨率未提供 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 2D8B | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1M4J CRYSTAL STRUCTURE OF THE N-TERMINAL ADF-H DOMAIN OF MOUSE TWINFILIN ISOFORM-1 提交 2002-07-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–142（142 aa）
片段：N-terminal ADF-H Domain
链 B
1–142（142 aa）
片段：N-terminal ADF-H Domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；1.6M Na-Citrate, 3% PEG 400, 0.1M Na-Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.251 |
| 1M4J CRYSTAL STRUCTURE OF THE N-TERMINAL ADF-H DOMAIN OF MOUSE TWINFILIN ISOFORM-1 提交 2002-07-03 | 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1–142（142 aa）
片段：N-terminal ADF-H Domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；1.6M Na-Citrate, 3% PEG 400, 0.1M Na-Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.251 |
| 2HD7 Solution structure of C-teminal domain of twinfilin-1. 提交 2006-06-20 | 构建体不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
176–316（141 aa）
片段：C-terminal domain, residues 176-316
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）60；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM C-terminal domain of twinfilin U-15N, C13, 10 mM Bis-Tris, pH 6.8, 50 mM NaCl, 1 mM DTT, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3DAW Structure of the actin-depolymerizing factor homology domain in complex with actin 提交 2008-05-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
167–322（156 aa）
片段：C-terminal domain, ADF-H 2, UNP RESIDUES 167-322
|
突变：V168M | CA CALCIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10mM Tris pH 7.5, 50mM NaCl, 0.2mM ATP, 0.2mM DTT, 0.2mM CaCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.279 |
| 6RSW HFD domain of mouse CAP1 bound to the pointed end of G-actin 提交 2019-05-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
176–316（141 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1M HEPES, 0.1 mM KCl, 10% PEG4000 (w/v)
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.194 |
| 6YP9 Rabbit muscle actin in complex with ADF-H and ATP-ATTO-488 提交 2020-04-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
176–315（140 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M sodium cacodylate (pH 6.0) and 15% (w/v) PEG 4000
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.230 |
| 7DS2 Crystal structure of actin capping protein in complex with twinflin-1 C-terminus tail 提交 2020-12-30 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 C
315–350（36 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；22.5% (w/v) PEG 400, 0.1M HEPES-NaOH (pH = 7.0)
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.183 |
| 7DS4 Crystal structure of actin capping protein in complex with twinflin-1 C-terminus tail F323K mutant 提交 2020-12-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 C
315–344（30 aa）
|
突变：F323K | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；5% (w/v) PEG 3350, 5% (v/v) ethanol, 50mM Tris-HCl (pH = 7.0)
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.259 |
| 7DS6 Crystal structure of actin capping protein in complex with twinflin-1/CD2AP CPI chimera peptide (TWN-CDC) 提交 2020-12-30 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 C
315–327（13 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；5% (w/v) PEG 3350, 5% (v/v) ethanol, 50mM Tris-HCl (pH = 7.0)
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.253 |
| 7DS8 Crystal structure of actin capping protein in complex with twinflin-1/CD2AP CPI chimera peptide (CDN-TWC) 提交 2020-12-30 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 C
326–344（19 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；4% (w/v) PEG 3350, 50mM Tris-HCl (pH = 7.0)
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.233 |
| 7DSB Crystal structure of actin capping protein in complex with V-1 and twinfilin C-terminal tail 提交 2020-12-30 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 D
315–344（30 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10% (w/v) PEG 3350, 5% (v/v) isopropanol, 0.1M HEPES-NaOH (pH = 7.5)
|
分辨率 2.44 Å R-free 0.248 |
共 10 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | TWF1_MOUSE |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 8–160； UniProt 161–313 |
