SAXSdb — 2e1m

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

L-glutamate oxidase

Streptomyces sp.

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 6	PHOSPHATE ION × 6 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q8L3C7_9ACTO
Isoform	—
PDB实体	1, 2, 3
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–376； UniProt 15–390 作者链 B； PDB构建体 1–130； UniProt 391–520 作者链 C； PDB构建体 1–181； UniProt 521–701

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2e1m
沉积日期 deposition_date	2006-10-26
结构标题 title	Crystal Structure of L-Glutamate Oxidase from Streptomyces sp. X-119-6
关键词 keywords	L-amino acid oxidase, L-Glutamate Oxidase, FAD, L-GOX, Flavoprotein, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2e1m__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2e1m__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2e1m__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	31.28 Å
Rg（电子密度）	30.49 Å
总 Rg	31.22 Å
原子数	9614
残基数	1194
排除体积	168920 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2e1m__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	L-glutamate oxidase
分子量 formula_weight	42019.2 kDa
EC 编号 ec_number	1.4.3.11
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	4807

ANEMTYEQLARELLLVGPAPTNEDLKLRYLDVLIDNGLNPPGPPKRILIVGAGIAGLVAGDLLTRAGHDVTILEANANRVGGRIKTFHAKKGEPSPFADPAQYAEAGAMRLPSFHPLTLALIDKLGLKRRLFFNVDIDPQTGNQDAPVPPVFYKSFKDGKTWTNGAPSPEFKEPDKRNHTWIRTNREQVRRAQYATDPSSINEGFHLTGCETRLTVSDMVNQALEPVRDYYSVKQDDGTRVNKPFKEWLAGWADVVRDFDGYSMGRFLREYAEFSDEAVEAIGTIENMTSRLHLAFFHSFLGRSDIDPRATYWEIEGGSRMLPETLAKDLRDQIVMGQRMVRLEYYDPGRDGHHGELTGPGGPAVAIQTVPEGEPY

来源 Source

来源生物 organism	Streptomyces sp.
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	196112
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	L-glutamate oxidase
分子量 formula_weight	15057.7 kDa
EC 编号 ec_number	1.4.3.11
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

AATQTWTGDLAIVTIPFSSLRFVKVTPPFSYKKRRAVIETHYDQATKVLLEFSRRWWEFTEADWKRELDAIAPGLYDYYQQWGEDDAEAALALPQSVRNLPTGLLGAHPSVDESRIGEEQVEYYRNSELR

来源 Source

来源生物 organism	Streptomyces sp.
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	196112
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	L-glutamate oxidase
分子量 formula_weight	19354.2 kDa
EC 编号 ec_number	1.4.3.11
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

GGVRPATNAYGGGSTTDNPNRFMYYPSHPVPGTQGGVVLAAYSWSDDAARWDSFDDAERYGYALENLQSVHGRRIEVFYTGAGQTQSWLRDPYACGEAAVYTPHQMTAFHLDVVRPEGPVYFAGEHVSLKHAWIEGAVETAVRAAIAVNEAPVGDTGVTAAAGRRGAAAATEPMREEALTS

来源 Source

来源生物 organism	Streptomyces sp.
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	196112
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	PHOSPHATE ION
分子量 formula_weight	95.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE
分子量 formula_weight	785.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	2e1mA01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	250 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1500 —

结构域编号 domain_id	2e1mA03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	470 —

结构域编号 domain_id	2e1mA04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	160 — Double Stranded RNA Binding Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	490 —

结构域编号 domain_id	2e1mA05
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	405 — Guanine Nucleotide Dissociation Inhibitor; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Guanine Nucleotide Dissociation Inhibitor, domain 1

结构域编号 domain_id	2e1mB01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1210 —

结构域编号 domain_id	2e1mB02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1790 —

结构域编号 domain_id	2e1mC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2100 —

结构域编号 domain_id	2e1mC02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1620 —

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晶胞边长 a length_a	123.875 Å
晶胞边长 b length_b	123.875 Å
晶胞边长 c length_c	168.762 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 61 2 2
空间群编号 int_tables_number	178
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	45.270 Å
R 因子 r_factor	0.2480
R_work r_work	0.2480
R_free r_free	0.3080

Crystal Structure of L-Glutamate Oxidase from Streptomyces sp. X-119-6

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

L-glutamate oxidase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2e1m__assembly_1__model_1

2e1m__assembly_1__model_1 | I(q)

2e1m__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal Structure of L-Glutamate Oxidase from Streptomyces sp. X-119-6

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

L-glutamate oxidase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2e1m__assembly_1__model_1

2e1m__assembly_1__model_1 | I(q)

2e1m__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)