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2ec0

RNA-dependent RNA polymerase of foot-and-mouth disease virus in complex with a template-primer RNA and ATP

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RNA-dependent RNA polymerase

Foot-and-mouth disease virus C-S8c1

UniProt Q0QEE1

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 单体 蛋白 1 RNA 2 5'-R(P*AP*UP*GP*GP*GP*CP*CP*C)-3' × 1 5'-R(*GP*GP*GP*CP*CP*CP*A)-3' × 1 MAGNESIUM ION × 1 PYROPHOSPHATE × 1 water × 3 与全部聚合物一致
2 蛋白–RNA 单体 蛋白 1 RNA 2 5'-R(P*AP*UP*GP*GP*GP*CP*CP*C)-3' × 1 5'-R(*GP*GP*GP*CP*CP*CP*A)-3' × 1 MAGNESIUM ION × 1 PYROPHOSPHATE × 1 water × 3 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
2e9r 2e9t 2e9t 2e9z 2ec0 2ec0

共 6 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q0QEE1_9PICO
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–470； UniProt 1719–2188 作者链 D； PDB构建体 1–470； UniProt 1719–2188

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2ec0
沉积日期 deposition_date2007-02-09
结构标题 titleRNA-dependent RNA polymerase of foot-and-mouth disease virus in complex with a template-primer RNA and ATP
关键词 keywordsRNA-dependent RNA polymerase, 3D polymerase, polymerase, foot-and- mouth disease virus, TRANSFERASE-RNA COMPLEX; TRANSFERASE/RNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2ec0__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2ec0__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2ec0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）23.27 Å
Rg（电子密度）22.58 Å
总 Rg23.35 Å
原子数4043
残基数485
排除体积70558 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2ec0__assembly_1__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 2ec0__assembly_2__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd2ec0a_
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.8 — DNA/RNA polymerases
超家族 Superfamily superfamilye.8.1 — DNA/RNA polymerases
家族 Family familye.8.1.4 — RNA-dependent RNA-polymerase
结构域编号 domain_idd2ec0d_
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.8 — DNA/RNA polymerases
超家族 Superfamily superfamilye.8.1 — DNA/RNA polymerases
家族 Family familye.8.1.4 — RNA-dependent RNA-polymerase

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id2ec0A02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
结构域编号 domain_id2ec0A03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology960 — Mitochondrial Import Receptor Subunit Tom20; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id2ec0D02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
结构域编号 domain_id2ec0D03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology960 — Mitochondrial Import Receptor Subunit Tom20; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
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7. 引用文献 (5)